/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 217 by dpavlin, Mon Dec 5 17:47:51 2005 UTC revision 834 by dpavlin, Thu May 24 10:53:48 2007 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.08;
11  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Input 0.16;
12  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Store 0.14;
13    use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.11;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    use Pod::Usage qw/pod2usage/;
25    
26  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
27    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
28    
29  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
30    
31  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
32    
33  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
34    
35    =head1 OPTIONS
36    
37    =over 4
38    
39    =item --offset 42
40    
41    start loading (all) databases at offset 42
42    
43    =item --limit 100
44    
45    limit loading to 100 records
46    
47    =item --clean
48    
49    remove database and Hyper Estraier index before indexing
50    
51    =item --only=database_name/input_filter
52    
53    reindex just single database (legacy name is --one)
54    
55    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
56    or C<type> from input
57    
58    =item --config conf/config.yml
59    
60    path to YAML configuration file
61    
62    =item --stats
63    
64    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
65    and subfield usage for each input
66    
67    =item --validate path/to/validation_file
68    
69    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
70    
71    =item --marc-generate
72    
73    Generate MARC file. This will automatically be on if file contains C<marc*> directives.
74    You can use this option as C<--no-marc-generate> to disable MARC generation.
75    
76    =item --marc-lint
77    
78    By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
79    messages with C<--no-marc-lint>.
80    
81    =item --marc-dump
82    
83    Force dump or input and marc record for debugging.
84    
85    =item --parallel 4
86    
87    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
88    machine if you want to use full load)
89    
90    =item --only-links
91    
92    Create just links
93    
94    =item --merge
95    
96    Create merged index of databases which have links
97    
98    =back
99    
100    =cut
101    
102    my $offset;
103    my $limit;
104    
105    my $clean = 0;
106    my $config_path;
107    my $debug = 0;
108    my $only_filter;
109    my $stats = 0;
110    my $validate_path;
111    my $marc_generate = 1;
112    my $marc_lint = 1;
113    my $marc_dump = 0;
114    my $parallel = 0;
115    my $only_links = 0;
116    my $merge = 0;
117    my $help;
118    
119    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
120    
121    GetOptions(
122            "limit=i" => \$limit,
123            "offset=i" => \$offset,
124            "clean" => \$clean,
125            "one=s" => \$only_filter,
126            "only=s" => \$only_filter,
127            "config" => \$config_path,
128            "debug+" => \$debug,
129            "stats" => \$stats,
130            "validate=s" => \$validate_path,
131            "marc-generate!" => \$marc_generate,
132            "marc-lint!" => \$marc_lint,
133            "marc-dump!" => \$marc_dump,
134            "parallel=i" => \$parallel,
135            "only-links!" => \$only_links,
136            "merge" => \$merge,
137            "help" => \$help,
138    );
139    
140    pod2usage(-verbose => 2) if ($help);
141    
142    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
143    
144    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
145    
146    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
147    
148    $log->info( "-" x 79 );
149    
150    my $log_file = 'log';
151    
152    if (-e $log_file ) {    # && -s $log_file > 5 * 1024 * 1024) {
153            $log->info("moved old log with ", -s $log_file, " bytes to '${log_file}.old'");
154            rename $log_file, "${log_file}.old" || $log->logwarn("can't rename $log_file to ${log_file}.old: $!");
155    }
156    
157    my $estcmd_fh;
158    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
159    if ($merge) {
160            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
161            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
162            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
163            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
164    }
165    
166    
167    my $validate;
168    $validate = new WebPAC::Validate(
169            path => $validate_path,
170            delimiters => $config->webpac('delimiters'),
171    ) if ($validate_path);
172    
173    
174    my $use_indexer = $config->use_indexer;
175    $stats ||= $validate;
176    if ($stats) {
177            $log->debug("disabled indexing for stats collection");
178            $use_indexer = undef;
179    } else {
180            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
181    }
182    
183    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
184    
185    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
186    
187  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
188    my $start_t = time();
189    
190  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
191    
192          my $type = lc($db_config->{input}->{type});  if ($parallel) {
193            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
194            Proc::Queue::size($parallel);
195    }
196    
197          die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');  sub create_ds_config {
198            my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
199            my $c = dclone( $db_config );
200            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
201            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
202            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
203            return $c;
204    }
205    
206          my $abs_path = abs_path($0);  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
         $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;  
207    
208          my $lookup = new WebPAC::Lookup(          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
209                  lookup_file => $db_config->{input}->{lookup},          next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
210          );  
211            if ($parallel) {
212                    my $f=fork;
213                    if(defined ($f) and $f==0) {
214                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
215                    } else {
216                            next;
217                    }
218            }
219    
220          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          my $indexer;
221            if ($use_indexer && $parser->have_rules( 'search', $database )) {
222    
223                    my $cfg_name = $use_indexer;
224                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
225    
226          my $log = $lookup->_get_logger;                  my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
227          $log->info("working on $database in $db_path");                  $indexer_config->{database} = $database;
228                    $indexer_config->{clean} = $clean;
229                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
230    
231          my $db = new WebPAC::Store(                  # force clean if database has links
232                  path => $db_path,                  $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
233                  database => $database,  
234          );                  if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
235    
236          my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");                          # open Hyper Estraier database
237          $est_config->{database} = $database;                          use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
238                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
239                    
240                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
241    
242          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");                          # open Hyper Estraier database
243                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
244                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
245    
246          my $est = new WebPAC::Output::Estraier(                  } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
247                  %{ $est_config },  
248                            # open KinoSearch
249                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
250                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
251                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
252    
253                    } else {
254                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
255                    }
256    
257                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
258            }
259    
260    
261            #
262            # store Hyper Estraier links to other databases
263            #
264            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
265                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
266                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
267                                    if ($merge) {
268                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
269                                    } else {
270                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
271                                            push @links, sub {
272                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
273                                                    $indexer->add_link(
274                                                            from => $database,
275                                                            to => $link->{to},
276                                                            credit => $link->{credit},
277                                                    );
278                                            };
279                                    }
280                            } else {
281                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
282                            }
283                    }
284            }
285            next if ($only_links);
286    
287    
288            #
289            # now WebPAC::Store
290            #
291            my $abs_path = abs_path($0);
292            $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
293    
294            my $db_path = $config->webpac('db_path');
295    
296            if ($clean) {
297                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
298                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
299            } else {
300                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
301            }
302    
303            my $store = new WebPAC::Store(
304                    path => $db_path,
305                    debug => $debug,
306          );          );
307    
308    
309          #          #
310          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
311          #          #
# Line 66  while (my ($database, $db_config) = each Line 313  while (my ($database, $db_config) = each
313          my @inputs;          my @inputs;
314          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
315                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
316          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
317                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
318            } else {
319                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
320          }          }
321    
322          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
                 $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");  
323    
324                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
                         code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},  
                         limit_mfn => $input->{limit},  
                 );  
325    
326                  my $maxmfn = $isis->open(                  next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
327                          filename => $input->{path},  
328                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                  my $type = lc($input->{type});
329    
330                    die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
331    
332                    my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
333    
334                    my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
335    
336                    $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
337                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
338                  );                  );
339    
340                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  if ($stats) {
341                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          # disable modification of records if --stats is in use
342                          db => $db,                          delete($input->{modify_records});
343                          lookup_regex => $lookup->regex,                          delete($input->{modify_file});
344                          lookup => $lookup,                  }
345    
346                    my $input_db = new WebPAC::Input(
347                            module => $input_module,
348                            encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
349                            limit => $limit || $input->{limit},
350                            offset => $offset,
351                            recode => $input->{recode},
352                            stats => $stats,
353                            modify_records => $input->{modify_records},
354                            modify_file => $input->{modify_file},
355                  );                  );
356                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
357    
358                    if (defined( $input->{lookup} )) {
359                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
360                            delete( $input->{lookup} );
361                    }
362    
363                    my $lookup_coderef;
364    
365                    if (@lookups) {
366    
367                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
368    
369                            $lookup_coderef = sub {
370                                    my $rec = shift || die "need rec!";
371                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
372    
373                                    WebPAC::Normalize::data_structure(
374                                            row => $rec,
375                                            rules => $rules,
376                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
377                                    );
378    
379                                    #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
380                            };
381    
382                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
383    
384                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
385    
386                    };
387    
388                    my $lookup_jar;
389    
390                    my $maxmfn = $input_db->open(
391                            path => $input->{path},
392                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
393                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
394                            lookup => $lookup_jar,
395                            %{ $input },
396                            load_row => sub {
397                                    my $a = shift;
398                                    return $store->load_row(
399                                            database => $database,
400                                            input => $input_name,
401                                            id => $a->{id},
402                                    );
403                            },
404                            save_row => sub {
405                                    my $a = shift;
406                                    return $store->save_row(
407                                            database => $database,
408                                            input => $input_name,
409                                            id => $a->{id},
410                                            row => $a->{row},
411                                    );
412                            },
413    
                 $n->open(  
                         tag => $input->{normalize}->{tag},  
                         xml_file => $input->{normalize}->{path},  
414                  );                  );
415    
416                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
417    
418                          my $row = $isis->fetch || next;                  if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
419                            $log->debug("created following lookups: ", sub { dump( $lookup_data ) } );
420    
421                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                          foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
422                                    $store->save_lookup(
423                                            database => $database,
424                                            input => $input_name,
425                                            key => $key,
426                                            data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
427                                    );
428                            }
429                    }
430    
431                          my $ds = $n->data_structure($row);                  my $report_fh;
432                    if ($stats || $validate) {
433                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
434                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
435    
436                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
437                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
438                            $log->info("Generating report file $path");
439                    }
440    
441                          $est->add(                  my $marc;
442                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                  if ($marc_generate && $parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
443                                  ds => $ds,                          $marc = new WebPAC::Output::MARC(
444                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},                                  path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
445                                    lint => $marc_lint,
446                                    dump => $marc_dump,
447                          );                          );
448                    }
449    
450                    my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
451                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
452    
453                    # reset position in database
454                    $input_db->seek(1);
455    
456                    # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
457                    my $indexer_config = $use_indexer;
458                    $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
459    
460                    my $lookup_hash;
461                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
462            
463                    if ($depends) {
464                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
465                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
466    
467                            foreach my $db (keys %$depends) {
468                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
469                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
470                                                    my $t = time();
471                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
472                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
473                                                            database => $db,
474                                                            input => $i,
475                                                            key => $k,
476                                                    );
477                                                    $log->debug(sprintf("lookup $db/$i took %.2fs", time() - $t));
478                                            }
479                                    }
480                            }
481    
482                            $log->debug("lookup_hash = ", sub { dump( $lookup_hash ) });
483                    }
484    
485    
486                    foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
487    
488                            my $row = $input_db->fetch || next;
489    
490                          $total_rows++;                          $total_rows++;
491    
492                            my $mfn = $row->{'000'}->[0];
493    
494                            if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
495                                    $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
496                                    $mfn = $pos;
497                                    push @{ $row->{'000'} }, $pos;
498                            }
499    
500    
501                            if ($validate) {
502                                    if ( my $errors = $validate->validate_rec( $row, $input_db->dump_ascii ) ) {
503                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
504                                                    $validate->report_error( $errors )
505                                            );
506                                    }
507                                    next;   # validation doesn't create any output
508                            }
509    
510                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
511                                    row => $row,
512                                    rules => $rules,
513                                    lookup => $lookup_hash,
514                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
515                                    marc_encoding => 'utf-8',
516                                    load_row_coderef => sub {
517                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
518                                            return $store->load_row(
519                                                    database => $database,
520                                                    input => $input,
521                                                    id => $mfn,
522                                            );
523                                    },
524                            );
525    
526                            $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
527    
528                            $store->save_ds(
529                                    database => $database,
530                                    input => $input_name,
531                                    id => $mfn,
532                                    ds => $ds,
533                            ) if ($ds && !$stats);
534    
535                            $indexer->add(
536                                    id => "${input_name}/${mfn}",
537                                    ds => $ds,
538                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
539                            ) if ($indexer && $ds);
540    
541                            if ($marc) {
542                                    my $i = 0;
543    
544                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
545                                            $marc->add(
546                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
547                                                    fields => $fields,
548                                                    leader => WebPAC::Normalize::_get_marc_leader(),
549                                                    row => $row,
550                                            );
551                                            $i++;
552                                    }
553    
554                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
555                            }
556                    }
557    
558                    if ($validate) {
559                            my $errors = $validate->report;
560                            if ($errors) {
561                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
562                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
563                            }
564    
565                            print $report_fh "\nAll possible subfields/delimiter templates:\n", $validate->delimiters_templates( report => 1 ), "\n\n";
566                    }
567    
568                    if ($stats) {
569                            my $s = $input_db->stats;
570                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
571                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
572                  }                  }
573    
574          };                  # close MARC file
575                    $marc->finish if ($marc);
576    
577                    # close report
578                    close($report_fh) if ($report_fh)
579    
580            }
581    
582            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
583    
584            my $dt = time() - $start_t;
585            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
586                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
587                            $dt, ($total_rows / $dt)
588                    )
589            );
590    
591    
592            # end forked process
593            if ($parallel) {
594                    $log->info("parallel process $$ finished");
595                    exit(0);
596            }
597    
         $log->info("$total_rows records indexed");  
598  }  }
599    
600    if ($parallel) {
601            # wait all children to finish
602            sleep(1) while wait != -1;
603            $log->info("all parallel processes finished");
604    }
605    
606    #
607    # handle links or merge after indexing
608    #
609    
610    if ($merge) {
611            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
612            close($estcmd_fh);
613            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
614            system $estcmd_path;
615    } else {
616            foreach my $link (@links) {
617                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
618                    $link->();
619            }
620    }

Legend:
Removed from v.217  
changed lines
  Added in v.834

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26