/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 268 by dpavlin, Fri Dec 16 21:09:42 2005 UTC revision 814 by dpavlin, Sun Apr 1 21:47:48 2007 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Common 0.02;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Parser 0.08;
11  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Input 0.16;
12  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Store 0.14;
13  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.05;  use WebPAC::Validate 0.06;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    use Pod::Usage qw/pod2usage/;
25    
26  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
27    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
28    
29  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
30    
31  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
32    
33  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
34    
35    =head1 OPTIONS
36    
37    =over 4
38    
39    =item --offset 42
40    
41    start loading (all) databases at offset 42
42    
43    =item --limit 100
44    
45    limit loading to 100 records
46    
47    =item --clean
48    
49    remove database and Hyper Estraier index before indexing
50    
51    =item --only=database_name/input_filter
52    
53    reindex just single database (legacy name is --one)
54    
55    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
56    or C<type> from input
57    
58    =item --config conf/config.yml
59    
60    path to YAML configuration file
61    
62    =item --stats
63    
64    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
65    and subfield usage for each input
66    
67    =item --validate path/to/validation_file
68    
69    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
70    
71    =item --marc-generate
72    
73    Generate MARC file. This will automatically be on if file contains C<marc*> directives.
74    You can use this option as C<--no-marc-generate> to disable MARC generation.
75    
76    =item --marc-lint
77    
78    By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
79    messages with C<--no-marc-lint>.
80    
81    =item --marc-dump
82    
83    Force dump or input and marc record for debugging.
84    
85    =item --parallel 4
86    
87    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
88    machine if you want to use full load)
89    
90    =item --only-links
91    
92    Create just links
93    
94    =item --merge
95    
96    Create merged index of databases which have links
97    
98    =back
99    
100    =cut
101    
102    my $offset;
103    my $limit;
104    
105    my $clean = 0;
106    my $config_path;
107    my $debug = 0;
108    my $only_filter;
109    my $stats = 0;
110    my $validate_path;
111    my $marc_generate = 1;
112    my $marc_lint = 1;
113    my $marc_dump = 0;
114    my $parallel = 0;
115    my $only_links = 0;
116    my $merge = 0;
117    my $help;
118    
119    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
120    
121    GetOptions(
122            "limit=i" => \$limit,
123            "offset=i" => \$offset,
124            "clean" => \$clean,
125            "one=s" => \$only_filter,
126            "only=s" => \$only_filter,
127            "config" => \$config_path,
128            "debug+" => \$debug,
129            "stats" => \$stats,
130            "validate=s" => \$validate_path,
131            "marc-generate!" => \$marc_generate,
132            "marc-lint!" => \$marc_lint,
133            "marc-dump!" => \$marc_dump,
134            "parallel=i" => \$parallel,
135            "only-links!" => \$only_links,
136            "merge" => \$merge,
137            "help" => \$help,
138    );
139    
140    pod2usage(-verbose => 2) if ($help);
141    
142    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
143    
144    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
145    
146    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
147    
148    $log->info( "-" x 79 );
149    
150    my $log_file = 'log';
151    
152    if (-e $log_file ) {    # && -s $log_file > 5 * 1024 * 1024) {
153            $log->info("moved old log with ", -s $log_file, " bytes to '${log_file}.old'");
154            rename $log_file, "${log_file}.old" || $log->logwarn("can't rename $log_file to ${log_file}.old: $!");
155    }
156    
157    my $estcmd_fh;
158    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
159    if ($merge) {
160            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
161            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
162            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
163            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
164    }
165    
166    
167    my $validate;
168    $validate = new WebPAC::Validate(
169            path => $validate_path,
170    ) if ($validate_path);
171    
172    
173    my $use_indexer = $config->use_indexer;
174    $stats ||= $validate;
175    if ($stats) {
176            $log->debug("disabled indexing for stats collection");
177            $use_indexer = undef;
178    } else {
179            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
180    }
181    
182    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
183    
184    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
185    
186  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
187    my $start_t = time();
188    
189  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
190    
191          my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();  if ($parallel) {
192            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
193            Proc::Queue::size($parallel);
194    }
195    
196          #  sub create_ds_config {
197          # open Hyper Estraier database          my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
198          #          my $c = dclone( $db_config );
199            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
200            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
201            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
202            return $c;
203    }
204    
205          my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
         $est_config->{database} = $database;  
206    
207          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
208            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
209    
210            if ($parallel) {
211                    my $f=fork;
212                    if(defined ($f) and $f==0) {
213                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
214                    } else {
215                            next;
216                    }
217            }
218    
219            my $indexer;
220            if ($use_indexer && $parser->have_rules( 'search', $database )) {
221    
222                    my $cfg_name = $use_indexer;
223                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
224    
225                    my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
226                    $indexer_config->{database} = $database;
227                    $indexer_config->{clean} = $clean;
228                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
229    
230                    # force clean if database has links
231                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
232    
233                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
234    
235                            # open Hyper Estraier database
236                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
237                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
238                    
239                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
240    
241                            # open Hyper Estraier database
242                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
243                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
244    
245                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
246    
247                            # open KinoSearch
248                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
249                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
250                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
251    
252                    } else {
253                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
254                    }
255    
256                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
257            }
258    
259    
260            #
261            # store Hyper Estraier links to other databases
262            #
263            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
264                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
265                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
266                                    if ($merge) {
267                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
268                                    } else {
269                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
270                                            push @links, sub {
271                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
272                                                    $indexer->add_link(
273                                                            from => $database,
274                                                            to => $link->{to},
275                                                            credit => $link->{credit},
276                                                    );
277                                            };
278                                    }
279                            } else {
280                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
281                            }
282                    }
283            }
284            next if ($only_links);
285    
         my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  
                 %{ $est_config },  
         );  
286    
287          #          #
288          # now WebPAC::Store          # now WebPAC::Store
# Line 50  while (my ($database, $db_config) = each Line 290  while (my ($database, $db_config) = each
290          my $abs_path = abs_path($0);          my $abs_path = abs_path($0);
291          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
292    
293          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          my $db_path = $config->webpac('db_path');
294    
295          $log->info("working on $database in $db_path");          if ($clean) {
296                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
297                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
298            } else {
299                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
300            }
301    
302          my $db = new WebPAC::Store(          my $store = new WebPAC::Store(
303                  path => $db_path,                  path => $db_path,
304                  database => $database,                  debug => $debug,
                 debug => 1,  
305          );          );
306    
307    
# Line 76  while (my ($database, $db_config) = each Line 320  while (my ($database, $db_config) = each
320    
321          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
322    
323                    my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
324    
325                    next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
326    
327                  my $type = lc($input->{type});                  my $type = lc($input->{type});
328    
329                  die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');                  die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
330    
331                  my $lookup = new WebPAC::Lookup(                  my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
                         lookup_file => $input->{lookup},  
                 );  
332    
333                  $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");                  my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
334    
335                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
336                          code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},                          @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
                         limit_mfn => $input->{limit},  
                         lookup => $lookup,  
337                  );                  );
338    
339                  my $maxmfn = $isis->open(                  if ($stats) {
340                          filename => $input->{path},                          # disable modification of records if --stats is in use
341                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                          delete($input->{modify_records});
342                  );                          delete($input->{modify_file});
343                    }
344    
345                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  my $input_db = new WebPAC::Input(
346                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          module => $input_module,
347                          db => $db,                          encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
348                          lookup_regex => $lookup->regex,                          limit => $limit || $input->{limit},
349                          lookup => $lookup,                          offset => $offset,
350                          prefix => $input->{name},                          recode => $input->{recode},
351                            stats => $stats,
352                            modify_records => $input->{modify_records},
353                            modify_file => $input->{modify_file},
354                  );                  );
355                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
356    
357                    if (defined( $input->{lookup} )) {
358                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
359                            delete( $input->{lookup} );
360                    }
361    
362                    my $lookup_coderef;
363    
364                    if (@lookups) {
365    
366                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
367    
368                            $lookup_coderef = sub {
369                                    my $rec = shift || die "need rec!";
370                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
371    
372                                    WebPAC::Normalize::data_structure(
373                                            row => $rec,
374                                            rules => $rules,
375                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
376                                    );
377    
378                                    #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
379                            };
380    
381                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
382    
383                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
384    
385                    };
386    
387                    my $lookup_jar;
388    
389                    my $maxmfn = $input_db->open(
390                            path => $input->{path},
391                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
392                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
393                            lookup => $lookup_jar,
394                            %{ $input },
395                            load_row => sub {
396                                    my $a = shift;
397                                    return $store->load_row(
398                                            database => $database,
399                                            input => $input_name,
400                                            id => $a->{id},
401                                    );
402                            },
403                            save_row => sub {
404                                    my $a = shift;
405                                    return $store->save_row(
406                                            database => $database,
407                                            input => $input_name,
408                                            id => $a->{id},
409                                            row => $a->{row},
410                                    );
411                            },
412    
                 $n->open(  
                         tag => $input->{normalize}->{tag},  
                         xml_file => $input->{normalize}->{path},  
413                  );                  );
414    
415                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
416    
417                          my $row = $isis->fetch || next;                  if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
418                            $log->debug("created following lookups: ", sub { dump( $lookup_data ) } );
419    
420                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                          foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
421                                    $store->save_lookup(
422                                            database => $database,
423                                            input => $input_name,
424                                            key => $key,
425                                            data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
426                                    );
427                            }
428                    }
429    
430                          my $ds = $n->data_structure($row);                  my $report_fh;
431                    if ($stats || $validate) {
432                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
433                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
434    
435                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
436                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
437                            $log->info("Generating report file $path");
438                    }
439    
440                          $est->add(                  my $marc;
441                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                  if ($marc_generate && $parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
442                                  ds => $ds,                          $marc = new WebPAC::Output::MARC(
443                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},                                  path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
444                                    lint => $marc_lint,
445                                    dump => $marc_dump,
446                          );                          );
447                    }
448    
449                          $total_rows++;                  my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
450                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
451    
452                    # reset position in database
453                    $input_db->seek(1);
454    
455                    # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
456                    my $indexer_config = $use_indexer;
457                    $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
458    
459                    my $lookup_hash;
460                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
461            
462                    if ($depends) {
463                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
464                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
465    
466                            foreach my $db (keys %$depends) {
467                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
468                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
469                                                    my $t = time();
470                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
471                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
472                                                            database => $db,
473                                                            input => $i,
474                                                            key => $k,
475                                                    );
476                                                    $log->debug(sprintf("lookup $db/$i took %.2fs", time() - $t));
477                                            }
478                                    }
479                            }
480    
481                            $log->debug("lookup_hash = ", sub { dump( $lookup_hash ) });
482                  }                  }
483    
         };  
484    
485          $log->info("$total_rows records indexed");                  foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
486    
487          #                          my $row = $input_db->fetch || next;
488          # add Hyper Estraier links to other databases  
489          #                          $total_rows++;
490          if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY') {  
491                  foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {                          my $mfn = $row->{'000'}->[0];
492                          $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");  
493                          $est->add_link(                          if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
494                                  from => $database,                                  $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
495                                  to => $link->{to},                                  $mfn = $pos;
496                                  credit => $link->{credit},                                  push @{ $row->{'000'} }, $pos;
497                            }
498    
499    
500                            if ($validate) {
501                                    if ( my $errors = $validate->validate_rec( $row, $input_db->dump_ascii ) ) {
502                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
503                                                    $validate->report_error( $errors )
504                                            );
505                                    }
506                                    next;   # validation doesn't create any output
507                            }
508    
509                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
510                                    row => $row,
511                                    rules => $rules,
512                                    lookup => $lookup_hash,
513                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
514                                    marc_encoding => 'utf-8',
515                                    load_row_coderef => sub {
516                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
517                                            return $store->load_row(
518                                                    database => $database,
519                                                    input => $input,
520                                                    id => $mfn,
521                                            );
522                                    },
523                          );                          );
524    
525                            $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
526    
527                            $store->save_ds(
528                                    database => $database,
529                                    input => $input_name,
530                                    id => $mfn,
531                                    ds => $ds,
532                            ) if ($ds && !$stats);
533    
534                            $indexer->add(
535                                    id => "${input_name}/${mfn}",
536                                    ds => $ds,
537                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
538                            ) if ($indexer && $ds);
539    
540                            if ($marc) {
541                                    my $i = 0;
542    
543                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
544                                            $marc->add(
545                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
546                                                    fields => $fields,
547                                                    leader => WebPAC::Normalize::_get_marc_leader(),
548                                                    row => $row,
549                                            );
550                                            $i++;
551                                    }
552    
553                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
554                            }
555                  }                  }
556    
557                    if ($validate) {
558                            my $errors = $validate->report;
559                            if ($errors) {
560                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
561                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
562                            }
563                    }
564    
565                    if ($stats) {
566                            my $s = $input_db->stats;
567                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
568                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
569                    }
570    
571                    # close MARC file
572                    $marc->finish if ($marc);
573    
574                    # close report
575                    close($report_fh) if ($report_fh)
576    
577            }
578    
579            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
580    
581            my $dt = time() - $start_t;
582            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
583                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
584                            $dt, ($total_rows / $dt)
585                    )
586            );
587    
588    
589            # end forked process
590            if ($parallel) {
591                    $log->info("parallel process $$ finished");
592                    exit(0);
593          }          }
594    
595  }  }
596    
597    if ($parallel) {
598            # wait all children to finish
599            sleep(1) while wait != -1;
600            $log->info("all parallel processes finished");
601    }
602    
603    #
604    # handle links or merge after indexing
605    #
606    
607    if ($merge) {
608            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
609            close($estcmd_fh);
610            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
611            system $estcmd_path;
612    } else {
613            foreach my $link (@links) {
614                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
615                    $link->();
616            }
617    }

Legend:
Removed from v.268  
changed lines
  Added in v.814

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26