/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 286 by dpavlin, Sun Dec 18 21:06:46 2005 UTC revision 769 by dpavlin, Fri Nov 3 20:21:09 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Common 0.02;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Parser 0.08;
11  use WebPAC::Input::ISIS 0.02;  use WebPAC::Input 0.14;
12  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Store 0.14;
13  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.05;  use WebPAC::Validate 0.06;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    
25  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
26    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
27    
28  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
29    
30  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
31    
32  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
33    
34    Options:
35    
36    =over 4
37    
38    =item --offset 42
39    
40    start loading (all) databases at offset 42
41    
42    =item --limit 100
43    
44    limit loading to 100 records
45    
46    =item --clean
47    
48    remove database and Hyper Estraier index before indexing
49    
50    =item --only=database_name/input_filter
51    
52    reindex just single database (legacy name is --one)
53    
54    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
55    or C<type> from input
56    
57    =item --config conf/config.yml
58    
59    path to YAML configuration file
60    
61    =item --stats
62    
63    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
64    and subfield usage for each input
65    
66    =item --validate path/to/validation_file
67    
68    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
69    
70    =item --marc-lint
71    
72    By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
73    messages with C<--no-marc-lint>.
74    
75    =item --marc-dump
76    
77    Force dump or input and marc record for debugging.
78    
79    =item --parallel 4
80    
81    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
82    machine if you want to use full load)
83    
84    =item --only-links
85    
86    Create just links
87    
88    =item --merge
89    
90    Create merged index of databases which have links
91    
92    =back
93    
94    =cut
95    
96    my $offset;
97    my $limit;
98    
99    my $clean = 0;
100    my $config_path;
101    my $debug = 0;
102    my $only_filter;
103    my $stats = 0;
104    my $validate_path;
105    my $marc_lint = 1;
106    my $marc_dump = 0;
107    my $parallel = 0;
108    my $only_links = 0;
109    my $merge = 0;
110    
111    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
112    
113    GetOptions(
114            "limit=i" => \$limit,
115            "offset=i" => \$offset,
116            "clean" => \$clean,
117            "one=s" => \$only_filter,
118            "only=s" => \$only_filter,
119            "config" => \$config_path,
120            "debug+" => \$debug,
121            "stats" => \$stats,
122            "validate=s" => \$validate_path,
123            "marc-lint!" => \$marc_lint,
124            "marc-dump!" => \$marc_dump,
125            "parallel=i" => \$parallel,
126            "only-links!" => \$only_links,
127            "merge" => \$merge,
128    );
129    
130    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
131    
132    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
133    
134    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
135    
136    $log->info( "-" x 79 );
137    
138    
139    my $estcmd_fh;
140    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
141    if ($merge) {
142            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
143            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
144            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
145            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
146    }
147    
148    
149    my $validate;
150    $validate = new WebPAC::Validate(
151            path => $validate_path,
152    ) if ($validate_path);
153    
154    
155    my $use_indexer = $config->use_indexer;
156    $stats ||= $validate;
157    if ($stats) {
158            $log->debug("disabled indexing for stats collection");
159            $use_indexer = undef;
160    } else {
161            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
162    }
163    
164    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
165    
166    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
167    
168  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
169    my $start_t = time();
170    
171  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
172    
173          my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();  if ($parallel) {
174            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
175            Proc::Queue::size($parallel);
176    }
177    
178          #  sub create_ds_config {
179          # open Hyper Estraier database          my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
180          #          my $c = dclone( $db_config );
181            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
182            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
183            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
184            return $c;
185    }
186    
187          my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
         $est_config->{database} = $database;  
188    
189          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
190            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
191    
192            if ($parallel) {
193                    my $f=fork;
194                    if(defined ($f) and $f==0) {
195                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
196                    } else {
197                            next;
198                    }
199            }
200    
201            my $indexer;
202            if ($use_indexer && $parser->have_rules( 'search', $database )) {
203    
204                    my $cfg_name = $use_indexer;
205                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
206    
207                    my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
208                    $indexer_config->{database} = $database;
209                    $indexer_config->{clean} = $clean;
210                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
211    
212                    # force clean if database has links
213                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
214    
215                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
216    
217                            # open Hyper Estraier database
218                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
219                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
220                    
221                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
222    
223                            # open Hyper Estraier database
224                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
225                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
226    
227                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
228    
229                            # open KinoSearch
230                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
231                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
232                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
233    
234                    } else {
235                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
236                    }
237    
238                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
239            }
240    
241    
242            #
243            # store Hyper Estraier links to other databases
244            #
245            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
246                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
247                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
248                                    if ($merge) {
249                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
250                                    } else {
251                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
252                                            push @links, sub {
253                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
254                                                    $indexer->add_link(
255                                                            from => $database,
256                                                            to => $link->{to},
257                                                            credit => $link->{credit},
258                                                    );
259                                            };
260                                    }
261                            } else {
262                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
263                            }
264                    }
265            }
266            next if ($only_links);
267    
         my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  
                 %{ $est_config },  
         );  
268    
269          #          #
270          # now WebPAC::Store          # now WebPAC::Store
# Line 50  while (my ($database, $db_config) = each Line 272  while (my ($database, $db_config) = each
272          my $abs_path = abs_path($0);          my $abs_path = abs_path($0);
273          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
274    
275          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          my $db_path = $config->webpac('db_path');
276    
277          $log->info("working on $database in $db_path");          if ($clean) {
278                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
279                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
280            } else {
281                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
282            }
283    
284          my $db = new WebPAC::Store(          my $store = new WebPAC::Store(
285                  path => $db_path,                  path => $db_path,
286                  database => $database,                  debug => $debug,
                 debug => 1,  
287          );          );
288    
289    
# Line 74  while (my ($database, $db_config) = each Line 300  while (my ($database, $db_config) = each
300                  $log->info("database $database doesn't have inputs defined");                  $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
301          }          }
302    
         my @supported_inputs = keys %{ $config->{webpac}->{inputs} };  
   
303          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
304    
305                    my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
306    
307                    next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
308    
309                  my $type = lc($input->{type});                  my $type = lc($input->{type});
310    
311                  die "I know only how to handle input types ", join(",", @supported_inputs), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, @supported_inputs));                  die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
312    
313                  my $lookup = new WebPAC::Lookup(                  my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
                         lookup_file => $input->{lookup},  
                 );  
314    
315                  my $input_module = $config->{webpac}->{inputs}->{$type};                  my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
316    
317                  $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}] using $input_module");                  $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
318                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
319                    );
320    
321                  sub new_input {                  if ($stats) {
322                          my $name = shift;                          # disable modification of records if --stats is in use
323                          my $args = shift;                          delete($input->{modify_records});
324                          new $name->($args);                          delete($input->{modify_file});
325                  }                  }
326    
327                  my $input = new_input($input_module,{                  my $input_db = new WebPAC::Input(
328                          code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},                          module => $input_module,
329                          limit_mfn => $input->{limit},                          encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
330                          lookup => $lookup,                          limit => $limit || $input->{limit},
331                  });                          offset => $offset,
332                            recode => $input->{recode},
333                            stats => $stats,
334                            modify_records => $input->{modify_records},
335                            modify_file => $input->{modify_file},
336                    );
337                  $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);                  $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
338    
339                  my $maxmfn = $input->open(                  if (defined( $input->{lookup} )) {
340                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
341                            delete( $input->{lookup} );
342                    }
343    
344                    my $lookup_coderef;
345    
346                    if (@lookups) {
347    
348                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
349    
350                            $lookup_coderef = sub {
351                                    my $rec = shift || die "need rec!";
352                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
353    
354                                    WebPAC::Normalize::data_structure(
355                                            row => $rec,
356                                            rules => $rules,
357                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
358                                    );
359    
360                                    #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
361                            };
362    
363                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
364    
365                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
366    
367                    };
368    
369                    my $lookup_jar;
370    
371                    my $maxmfn = $input_db->open(
372                          path => $input->{path},                          path => $input->{path},
373                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding
374                  );                          lookup_coderef => $lookup_coderef,
375                            lookup => $lookup_jar,
376                            %{ $input },
377                            load_row => sub {
378                                    my $a = shift;
379                                    return $store->load_row(
380                                            database => $database,
381                                            input => $input_name,
382                                            id => $a->{id},
383                                    );
384                            },
385                            save_row => sub {
386                                    my $a = shift;
387                                    return $store->save_row(
388                                            database => $database,
389                                            input => $input_name,
390                                            id => $a->{id},
391                                            row => $a->{row},
392                                    );
393                            },
394    
                 my $n = new WebPAC::Normalize::XML(  
                 #       filter => { 'foo' => sub { shift } },  
                         db => $db,  
                         lookup_regex => $lookup->regex,  
                         lookup => $lookup,  
                         prefix => $input->{name},  
395                  );                  );
396    
397                  my $normalize_path = $input->{normalize}->{path};                  my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
398    
399                  if ($normalize_path =~ m/\.xml$/i) {                  if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
400                          $n->open(                          $log->debug("created following lookups: ", sub { dump( $lookup_data ) } );
401                                  tag => $input->{normalize}->{tag},  
402                                  xml_file => $input->{normalize}->{path},                          foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
403                          );                                  $store->save_lookup(
404                  } elsif ($normalize_path =~ m/\.(?:yml|yaml)$/i) {                                          database => $database,
405                          $n->open_yaml(                                          input => $input_name,
406                                  path => $normalize_path,                                          key => $key,
407                                  tag => $input->{normalize}->{tag},                                          data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
408                          );                                  );
409                            }
410                  }                  }
411    
412                  for ( 0 ... $input->size ) {                  my $report_fh;
413                    if ($stats || $validate) {
414                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
415                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
416    
417                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
418                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
419                            $log->info("Generating report file $path");
420                    }
421    
422                          my $row = $input->fetch || next;                  my $marc;
423                    if ($parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
424                            $marc = new WebPAC::Output::MARC(
425                                    path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
426                                    lint => $marc_lint,
427                                    dump => $marc_dump,
428                            );
429                    }
430    
431                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                  my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
432                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
433    
434                          my $ds = $n->data_structure($row);                  # reset position in database
435                    $input_db->seek(1);
436    
437                          $est->add(                  # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
438                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                  my $indexer_config = $use_indexer;
439                                  ds => $ds,                  $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
440                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},  
441                          );                  my $lookup_hash;
442                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
443            
444                    if ($depends) {
445                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
446                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
447    
448                            foreach my $db (keys %$depends) {
449                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
450                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
451                                                    my $t = time();
452                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
453                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
454                                                            database => $db,
455                                                            input => $i,
456                                                            key => $k,
457                                                    );
458                                                    $log->debug(sprintf("lookup $db/$i took %.2fs", time() - $t));
459                                            }
460                                    }
461                            }
462    
463                          $total_rows++;                          $log->debug("lookup_hash = ", sub { dump( $lookup_hash ) });
464                  }                  }
465    
         };  
466    
467          $log->info("$total_rows records indexed");                  foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
468    
469          #                          my $row = $input_db->fetch || next;
470          # add Hyper Estraier links to other databases  
471          #                          $total_rows++;
472          if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY') {  
473                  foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {                          my $mfn = $row->{'000'}->[0];
474                          $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");  
475                          $est->add_link(                          if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
476                                  from => $database,                                  $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
477                                  to => $link->{to},                                  $mfn = $pos;
478                                  credit => $link->{credit},                                  push @{ $row->{'000'} }, $pos;
479                            }
480    
481    
482                            if ($validate) {
483                                    if ( my $errors = $validate->validate_rec( $row, $input_db->dump ) ) {
484                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
485                                                    $validate->report_error( $errors )
486                                            );
487                                    }
488                                    next;   # validation doesn't create any output
489                            }
490    
491                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
492                                    row => $row,
493                                    rules => $rules,
494                                    lookup => $lookup_hash,
495                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
496                                    marc_encoding => 'utf-8',
497                                    load_row_coderef => sub {
498                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
499                                            return $store->load_row(
500                                                    database => $database,
501                                                    input => $input,
502                                                    id => $mfn,
503                                            );
504                                    },
505                          );                          );
506    
507                            $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
508    
509                            $store->save_ds(
510                                    database => $database,
511                                    input => $input_name,
512                                    id => $mfn,
513                                    ds => $ds,
514                            ) if ($ds && !$stats);
515    
516                            $indexer->add(
517                                    id => "${input_name}/${mfn}",
518                                    ds => $ds,
519                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
520                            ) if ($indexer && $ds);
521    
522                            if ($marc) {
523                                    my $i = 0;
524    
525                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
526                                            $marc->add(
527                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
528                                                    fields => $fields,
529                                                    leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
530                                                    row => $row,
531                                            );
532                                            $i++;
533                                    }
534    
535                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
536                            }
537                  }                  }
538    
539                    if ($validate) {
540                            my $errors = $validate->report;
541                            if ($errors) {
542                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
543                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
544                            }
545                    }
546    
547                    if ($stats) {
548                            my $s = $input_db->stats;
549                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
550                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
551                    }
552    
553                    # close MARC file
554                    $marc->finish if ($marc);
555    
556                    # close report
557                    close($report_fh) if ($report_fh)
558    
559            }
560    
561            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
562    
563            my $dt = time() - $start_t;
564            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
565                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
566                            $dt, ($total_rows / $dt)
567                    )
568            );
569    
570    
571            # end forked process
572            if ($parallel) {
573                    $log->info("parallel process $$ finished");
574                    exit(0);
575          }          }
576    
577  }  }
578    
579    if ($parallel) {
580            # wait all children to finish
581            sleep(1) while wait != -1;
582            $log->info("all parallel processes finished");
583    }
584    
585    #
586    # handle links or merge after indexing
587    #
588    
589    if ($merge) {
590            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
591            close($estcmd_fh);
592            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
593            system $estcmd_path;
594    } else {
595            foreach my $link (@links) {
596                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
597                    $link->();
598            }
599    }

Legend:
Removed from v.286  
changed lines
  Added in v.769

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26