/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 251 by dpavlin, Thu Dec 15 14:12:00 2005 UTC revision 765 by dpavlin, Wed Oct 25 21:01:51 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.08;
11  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Input 0.14;
12  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Store 0.14;
13    use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.06;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    
25  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
26    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
27    
28  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
29    
30  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
31    
32  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
33    
34    Options:
35    
36    =over 4
37    
38    =item --offset 42
39    
40    start loading (all) databases at offset 42
41    
42    =item --limit 100
43    
44    limit loading to 100 records
45    
46    =item --clean
47    
48    remove database and Hyper Estraier index before indexing
49    
50    =item --only=database_name/input_filter
51    
52    reindex just single database (legacy name is --one)
53    
54    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
55    or C<type> from input
56    
57    =item --config conf/config.yml
58    
59    path to YAML configuration file
60    
61    =item --stats
62    
63    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
64    and subfield usage for each input
65    
66    =item --validate path/to/validation_file
67    
68    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
69    
70    =item --marc-lint
71    
72    By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
73    messages with C<--no-marc-lint>.
74    
75    =item --marc-dump
76    
77    Force dump or input and marc record for debugging.
78    
79    =item --parallel 4
80    
81    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
82    machine if you want to use full load)
83    
84    =item --only-links
85    
86    Create just links
87    
88    =item --merge
89    
90    Create merged index of databases which have links
91    
92    =back
93    
94    =cut
95    
96    my $offset;
97    my $limit;
98    
99    my $clean = 0;
100    my $config_path;
101    my $debug = 0;
102    my $only_filter;
103    my $stats = 0;
104    my $validate_path;
105    my $marc_lint = 1;
106    my $marc_dump = 0;
107    my $parallel = 0;
108    my $only_links = 0;
109    my $merge = 0;
110    
111    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
112    
113    GetOptions(
114            "limit=i" => \$limit,
115            "offset=i" => \$offset,
116            "clean" => \$clean,
117            "one=s" => \$only_filter,
118            "only=s" => \$only_filter,
119            "config" => \$config_path,
120            "debug+" => \$debug,
121            "stats" => \$stats,
122            "validate=s" => \$validate_path,
123            "marc-lint!" => \$marc_lint,
124            "marc-dump!" => \$marc_dump,
125            "parallel=i" => \$parallel,
126            "only-links!" => \$only_links,
127            "merge" => \$merge,
128    );
129    
130    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
131    
132    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
133    
134    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
135    
136    $log->info( "-" x 79 );
137    
138    
139    my $estcmd_fh;
140    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
141    if ($merge) {
142            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
143            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
144            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
145            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
146    }
147    
148    
149    my $validate;
150    $validate = new WebPAC::Validate(
151            path => $validate_path,
152    ) if ($validate_path);
153    
154    
155    my $use_indexer = $config->use_indexer;
156    if ($stats) {
157            $log->debug("option --stats disables update of indexing engine...");
158            $use_indexer = undef;
159    } else {
160            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
161    }
162    
163    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
164    
165    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
166    
167  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
168    my $start_t = time();
169    
170  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
171    
172          my $abs_path = abs_path($0);  if ($parallel) {
173          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;          $log->info("Using $parallel processes for speedup");
174            Proc::Queue::size($parallel);
175    }
176    
177          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;  sub create_ds_config {
178            my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
179            my $c = dclone( $db_config );
180            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
181            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
182            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
183            return $c;
184    }
185    
186    while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
187    
188            my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
189            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
190    
191            if ($parallel) {
192                    my $f=fork;
193                    if(defined ($f) and $f==0) {
194                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
195                    } else {
196                            next;
197                    }
198            }
199    
200            my $indexer;
201            if ($use_indexer && $parser->have_rules( 'search', $database )) {
202    
203                    my $cfg_name = $use_indexer;
204                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
205    
206                    my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
207                    $indexer_config->{database} = $database;
208                    $indexer_config->{clean} = $clean;
209                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
210    
211                    # force clean if database has links
212                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
213    
214                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
215    
216                            # open Hyper Estraier database
217                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
218                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
219                    
220                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
221    
222                            # open Hyper Estraier database
223                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
224                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
225    
226                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
227    
228                            # open KinoSearch
229                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
230                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
231                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
232    
233                    } else {
234                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
235                    }
236    
237                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
238            }
239    
240    
241            #
242            # store Hyper Estraier links to other databases
243            #
244            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
245                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
246                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
247                                    if ($merge) {
248                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
249                                    } else {
250                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
251                                            push @links, sub {
252                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
253                                                    $indexer->add_link(
254                                                            from => $database,
255                                                            to => $link->{to},
256                                                            credit => $link->{credit},
257                                                    );
258                                            };
259                                    }
260                            } else {
261                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
262                            }
263                    }
264            }
265            next if ($only_links);
266    
         my $db = new WebPAC::Store(  
                 path => $db_path,  
                 database => $database,  
                 debug => 1,  
         );  
267    
268          my $log = $db->_get_logger;          #
269          $log->info("working on $database in $db_path");          # now WebPAC::Store
270            #
271            my $abs_path = abs_path($0);
272            $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
273    
274          my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");          my $db_path = $config->webpac('db_path');
         $est_config->{database} = $database;  
275    
276          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");          if ($clean) {
277                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
278                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
279            } else {
280                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
281            }
282    
283          my $est = new WebPAC::Output::Estraier(          my $store = new WebPAC::Store(
284                  %{ $est_config },                  path => $db_path,
285                    debug => $debug,
286          );          );
287    
288    
289          #          #
290          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
291          #          #
# Line 58  while (my ($database, $db_config) = each Line 293  while (my ($database, $db_config) = each
293          my @inputs;          my @inputs;
294          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
295                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
296          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
297                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
298            } else {
299                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
300          }          }
301    
302          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
303    
304                    my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
305    
306                    next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
307    
308                  my $type = lc($input->{type});                  my $type = lc($input->{type});
309    
310                  die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');                  die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
311    
312                    my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
313    
314                  my $lookup = new WebPAC::Lookup(                  my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
315                          lookup_file => $input->{lookup},  
316                    $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
317                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
318                  );                  );
319    
320                  $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");                  if ($stats) {
321                            # disable modification of records if --stats is in use
322                            delete($input->{modify_records});
323                            delete($input->{modify_file});
324                    }
325    
326                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  my $input_db = new WebPAC::Input(
327                          code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},                          module => $input_module,
328                          limit_mfn => $input->{limit},                          encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
329                          lookup => $lookup,                          limit => $limit || $input->{limit},
330                            offset => $offset,
331                            recode => $input->{recode},
332                            stats => $stats,
333                            modify_records => $input->{modify_records},
334                            modify_file => $input->{modify_file},
335                  );                  );
336                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
337    
338                    if (defined( $input->{lookup} )) {
339                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
340                            delete( $input->{lookup} );
341                    }
342    
343                    my $lookup_coderef;
344    
345                    if (@lookups) {
346    
347                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
348    
349                            $lookup_coderef = sub {
350                                    my $rec = shift || die "need rec!";
351                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
352    
353                                    WebPAC::Normalize::data_structure(
354                                            row => $rec,
355                                            rules => $rules,
356                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
357                                    );
358    
359                  my $maxmfn = $isis->open(                                  #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
360                          filename => $input->{path},                          };
361    
362                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
363    
364                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
365    
366                    };
367    
368                    my $lookup_jar;
369    
370                    my $maxmfn = $input_db->open(
371                            path => $input->{path},
372                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding
373                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
374                            lookup => $lookup_jar,
375                            %{ $input },
376                            load_row => sub {
377                                    my $a = shift;
378                                    return $store->load_row(
379                                            database => $database,
380                                            input => $input_name,
381                                            id => $a->{id},
382                                    );
383                            },
384                            save_row => sub {
385                                    my $a = shift;
386                                    return $store->save_row(
387                                            database => $database,
388                                            input => $input_name,
389                                            id => $a->{id},
390                                            row => $a->{row},
391                                    );
392                            },
393    
394                  );                  );
395    
396  $log->info( Dumper($lookup->{_lookup_data}) );                  my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
397    
398                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
399                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          $log->debug("created following lookups: ", sub { dump( $lookup_data ) } );
                         db => $db,  
                         lookup_regex => $lookup->regex,  
                         lookup => $lookup,  
                         prefix => $input->{name},  
                 );  
400    
401                  $n->open(                          foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
402                          tag => $input->{normalize}->{tag},                                  $store->save_lookup(
403                          xml_file => $input->{normalize}->{path},                                          database => $database,
404                  );                                          input => $input_name,
405                                            key => $key,
406                                            data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
407                                    );
408                            }
409                    }
410    
411                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  my $report_fh;
412                    if ($stats || $validate) {
413                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
414                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
415    
416                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
417                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
418                            $log->info("Generating report file $path");
419                    }
420    
421                          my $row = $isis->fetch || next;                  my $marc;
422                    if ($parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
423                            $marc = new WebPAC::Output::MARC(
424                                    path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
425                                    lint => $marc_lint,
426                                    dump => $marc_dump,
427                            );
428                    }
429    
430                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                  my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
431                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
432    
433                          my $ds = $n->data_structure($row);                  # reset position in database
434                    $input_db->seek(1);
435    
436                          $est->add(                  # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
437                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                  my $indexer_config = $use_indexer;
438                                  ds => $ds,                  $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
439                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},  
440                    my $lookup_hash;
441                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
442            
443                    if ($depends) {
444                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
445                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
446    
447                            foreach my $db (keys %$depends) {
448                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
449                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
450                                                    my $t = time();
451                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
452                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
453                                                            database => $db,
454                                                            input => $i,
455                                                            key => $k,
456                                                    );
457                                                    $log->debug(sprintf("lookup $db/$i took %.2fs", time() - $t));
458                                            }
459                                    }
460                            }
461    
462                            $log->debug("lookup_hash = ", sub { dump( $lookup_hash ) });
463                    }
464    
465    
466                    foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
467    
468                            my $row = $input_db->fetch || next;
469    
470                            my $mfn = $row->{'000'}->[0];
471    
472                            if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
473                                    $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
474                                    $mfn = $pos;
475                                    push @{ $row->{'000'} }, $pos;
476                            }
477    
478    
479                            if ($validate) {
480                                    if ( my $errors = $validate->validate_errors( $row, $input_db->dump ) ) {
481                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
482                                                    $validate->report_error( $errors )
483                                            );
484                                    }
485                            }
486    
487                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
488                                    row => $row,
489                                    rules => $rules,
490                                    lookup => $lookup_hash,
491                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
492                                    marc_encoding => 'utf-8',
493                                    load_row_coderef => sub {
494                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
495                                            return $store->load_row(
496                                                    database => $database,
497                                                    input => $input,
498                                                    id => $mfn,
499                                            );
500                                    },
501                          );                          );
502    
503                            $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
504    
505                            $store->save_ds(
506                                    database => $database,
507                                    input => $input_name,
508                                    id => $mfn,
509                                    ds => $ds,
510                            ) if ($ds && !$stats);
511    
512                            $indexer->add(
513                                    id => "${input_name}/${mfn}",
514                                    ds => $ds,
515                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
516                            ) if ($indexer && $ds);
517    
518                            if ($marc) {
519                                    my $i = 0;
520    
521                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
522                                            $marc->add(
523                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
524                                                    fields => $fields,
525                                                    leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
526                                                    row => $row,
527                                            );
528                                            $i++;
529                                    }
530    
531                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
532                            }
533    
534                          $total_rows++;                          $total_rows++;
535                  }                  }
536    
537          };                  if ($validate) {
538                            my $errors = $validate->report;
539                            if ($errors) {
540                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
541                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
542                            }
543                    }
544    
545                    if ($stats) {
546                            my $s = $input_db->stats;
547                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
548                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
549                    }
550    
551                    # close MARC file
552                    $marc->finish if ($marc);
553    
554                    # close report
555                    close($report_fh) if ($report_fh)
556    
557            }
558    
559            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
560    
561            my $dt = time() - $start_t;
562            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
563                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
564                            $dt, ($total_rows / $dt)
565                    )
566            );
567    
568    
569            # end forked process
570            if ($parallel) {
571                    $log->info("parallel process $$ finished");
572                    exit(0);
573            }
574    
         $log->info("$total_rows records indexed");  
575  }  }
576    
577    if ($parallel) {
578            # wait all children to finish
579            sleep(1) while wait != -1;
580            $log->info("all parallel processes finished");
581    }
582    
583    #
584    # handle links or merge after indexing
585    #
586    
587    if ($merge) {
588            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
589            close($estcmd_fh);
590            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
591            system $estcmd_path;
592    } else {
593            foreach my $link (@links) {
594                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
595                    $link->();
596            }
597    }

Legend:
Removed from v.251  
changed lines
  Added in v.765

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26