/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 76 by dpavlin, Sun Nov 20 20:32:46 2005 UTC revision 916 by dpavlin, Tue Oct 30 20:32:16 2007 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.08;
11  use WebPAC::DB;  use WebPAC::Input 0.16;
12  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Store 0.15;
13    use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier;  use WebPAC::Validate 0.11;
16    use WebPAC::Output::MARC;
17    use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    use Pod::Usage qw/pod2usage/;
25    
26  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
27    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
28    
29  my $abs_path = abs_path($0);  =head1 NAME
 $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;  
30    
31  my $isis_file = '/data/isis_data/ps/LIBRI/LIBRI';  run.pl - start WebPAC indexing
32    
33  my $lookup = new WebPAC::Lookup(  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
         lookup_file => "$abs_path/conf/lookup/isis.pm",  
 );  
34    
35  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(  =head1 OPTIONS
         code_page => 'ISO-8859-2',      # application encoding  
         limit_mfn => $limit,  
 );  
36    
37  my $maxmfn = $isis->open(  =over 4
         filename => $isis_file,  
         code_page => '852',             # database encoding  
 );  
38    
39  my $path = './db/';  =item --offset 42
40    
41  my $db = new WebPAC::DB(  start loading (all) databases at offset 42
         path => $path,  
 );  
42    
43  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(  =item --limit 100
 #       filter => { 'foo' => sub { shift } },  
         db => $db,  
         lookup_regex => $lookup->regex,  
         lookup => $lookup,  
 );  
44    
45  $n->open(  limit loading to 100 records
         tag => 'isis',  
         xml_file => "$abs_path/conf/normalize/isis_ffzg.xml",  
 );  
46    
47  my $out = new WebPAC::Output::TT(  =item --clean
         include_path => "$abs_path/conf/output/tt",  
         filters => { foo => sub { shift } },  
 );  
48    
49  my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  remove database and Hyper Estraier index before indexing
         url => 'http://localhost:1978/node/webpac2',  
         user => 'admin',  
         passwd => 'admin',  
         database => 'ps',  
 );  
50    
51  while (my $row = $isis->fetch) {  =item --only=database_name/input_filter
52    
53          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";  reindex just single database (legacy name is --one)
54    
55          my $ds = $n->data_structure($row);  C</input_filter> is optional part which can be C<name>
56    or C<type> from input
57    
58  #       print STDERR Dumper($row, $ds);  =item --config conf/config.yml
59    
60          my $html = $out->apply(  path to YAML configuration file
61                  template => 'html_ffzg.tt',  
62                  data => $ds,  =item --stats
63          );  
64    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
65    and subfield usage for each input
66    
67    =item --validate path/to/validation_file
68    
69    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
70    
71    You can use special variables C<$database> and $C<$input> in this parametar
72    like C<--validate 'conf/validate/$database-$input'> to construct filename
73    
74    =item --validate-delimiters path/to/validate_delimiters_file
75    
76    this option is used with C<--validate> to turn on extra validation of
77    delimiters. If file is non existant, it will be created on first run.
78    
79    =item --marc-generate
80    
81    Generate MARC file. This will automatically be on if file contains C<marc*> directives.
82    You can use this option as C<--no-marc-generate> to disable MARC generation.
83    
84          # create test output  =item --marc-lint
85    
86          my $file = sprintf('out/%02d.html', $mfn );  By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
87          open(my $fh, '>', $file) or die "can't open $file: $!";  messages with C<--no-marc-lint>.
         print $fh $html;  
         close($fh);  
88    
89          $html =~ s#\s*[\n\r]+\s*##gs;  =item --marc-dump
90    
91  #       print STDERR $html;  Force dump or input and marc record for debugging.
92    
93          $est->add(  =item --parallel 4
94                  id => $mfn,  
95                  ds => $ds,  Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
96                  type => 'search',  machine if you want to use full load)
97    
98    =item --only-links
99    
100    Create just links
101    
102    =item --merge
103    
104    Create merged index of databases which have links
105    
106    =back
107    
108    =cut
109    
110    my $offset;
111    my $limit;
112    
113    my $clean = 0;
114    my $config_path;
115    my $debug = 0;
116    my $only_filter;
117    my $stats = 0;
118    my $validate_path;
119    my $validate_delimiters_path;
120    my $marc_generate = 1;
121    my $marc_lint = 1;
122    my $marc_dump = 0;
123    my $parallel = 0;
124    my $only_links = 0;
125    my $merge = 0;
126    my $help;
127    
128    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
129    
130    GetOptions(
131            "limit=i" => \$limit,
132            "offset=i" => \$offset,
133            "clean" => \$clean,
134            "one=s" => \$only_filter,
135            "only=s" => \$only_filter,
136            "config" => \$config_path,
137            "debug+" => \$debug,
138            "stats" => \$stats,
139            "validate=s" => \$validate_path,
140            "validate-delimiters=s" => \$validate_delimiters_path,
141            "marc-generate!" => \$marc_generate,
142            "marc-lint!" => \$marc_lint,
143            "marc-dump!" => \$marc_dump,
144            "parallel=i" => \$parallel,
145            "only-links!" => \$only_links,
146            "merge" => \$merge,
147            "help" => \$help,
148    );
149    
150    $marc_generate = 0 if ( $validate_delimiters_path );
151    
152    pod2usage(-verbose => 2) if ($help);
153    
154    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
155    
156    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
157    
158    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
159    
160    $log->info( "-" x 79 );
161    
162    my $log_file = 'log';
163    
164    if (-e $log_file ) {    # && -s $log_file > 5 * 1024 * 1024) {
165            $log->info("moved old log with ", -s $log_file, " bytes to '${log_file}.old'");
166            rename $log_file, "${log_file}.old" || $log->logwarn("can't rename $log_file to ${log_file}.old: $!");
167    }
168    
169    my $estcmd_fh;
170    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
171    if ($merge) {
172            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
173            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
174            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
175            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
176    }
177    
178    my $validate;
179    $validate = new WebPAC::Validate(
180            delimiters => $config->webpac('delimiters'),
181    ) if ($validate_path || $validate_delimiters_path);
182    
183    my $use_indexer = $config->use_indexer;
184    $stats ||= $validate;
185    if ($stats) {
186            $log->debug("disabled indexing for stats collection");
187            $use_indexer = undef;
188    } elsif ( $use_indexer ) {
189            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
190    }
191    
192    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
193    
194    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
195    
196    my $total_rows = 0;
197    my $start_t = time();
198    
199    my @links;
200    
201    if ($parallel) {
202            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
203            Proc::Queue::size($parallel);
204    }
205    
206    sub create_ds_config {
207            my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
208            my $c = dclone( $db_config );
209            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
210            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
211            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
212            return $c;
213    }
214    
215    foreach my $database ( sort keys %{ $config->databases } ) {
216            my $db_config = $config->databases->{$database};
217    
218            my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
219            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
220    
221            if ($parallel) {
222                    my $f=fork;
223                    if(defined ($f) and $f==0) {
224                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
225                    } else {
226                            next;
227                    }
228            }
229    
230            my $indexer;
231            if ($use_indexer && $parser->have_rules( 'search', $database )) {
232    
233                    my $cfg_name = $use_indexer;
234                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
235    
236                    my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
237                    $indexer_config->{database} = $database;
238                    $indexer_config->{clean} = $clean;
239                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
240    
241                    # force clean if database has links
242                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
243    
244                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
245    
246                            # open Hyper Estraier database
247                            require WebPAC::Output::Estraier;
248                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
249                    
250                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
251    
252                            # open Hyper Estraier database
253                            require WebPAC::Output::EstraierNative;
254                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
255    
256                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
257    
258                            die "no longer supported";
259    
260                    } else {
261                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
262                    }
263    
264                    $log->logdie("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
265            }
266    
267    
268            #
269            # store Hyper Estraier links to other databases
270            #
271            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
272                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
273                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
274                                    if ($merge) {
275                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
276                                    } else {
277                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
278                                            push @links, sub {
279                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
280                                                    $indexer->add_link(
281                                                            from => $database,
282                                                            to => $link->{to},
283                                                            credit => $link->{credit},
284                                                    );
285                                            };
286                                    }
287                            } else {
288                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
289                            }
290                    }
291            }
292            next if ($only_links);
293    
294    
295            #
296            # now WebPAC::Store
297            #
298            my $store = new WebPAC::Store({
299                    debug => $debug,
300            });
301    
302            #
303            # prepare output
304            #
305            my @outputs;
306            if (defined( $db_config->{output} )) {
307                    my $module = $db_config->{output}->{module} || $log->logdie("need module in output section of $database");
308                    $module = 'WebPAC::Output::' . $module unless $module =~ m/::/;
309                    $log->debug("loading output module $module");
310                    eval "require $module";
311                    $db_config->{output}->{database} = $database;
312                    $log->debug("calling $module->new(",dump( $db_config->{output} ),")");
313                    my $out = new $module->new( $db_config->{output} );
314                    $out->init;
315                    push @outputs, $out;
316            }
317    
318    
319            #
320            # now, iterate through input formats
321            #
322    
323            my @inputs;
324            if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
325                    @inputs = @{ $db_config->{input} };
326            } elsif ($db_config->{input}) {
327                    push @inputs, $db_config->{input};
328            } else {
329                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
330            }
331    
332            foreach my $input (@inputs) {
333    
334                    my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
335    
336                    next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
337    
338                    my $type = lc($input->{type});
339    
340                    die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
341    
342                    my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
343    
344                    my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
345    
346                    $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
347                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
348                    );
349    
350                    if ($stats) {
351                            # disable modification of records if --stats is in use
352                            delete($input->{modify_records});
353                            delete($input->{modify_file});
354                    }
355    
356                    my $input_db = new WebPAC::Input(
357                            module => $input_module,
358                            encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
359                            limit => $limit || $input->{limit},
360                            offset => $offset,
361                            recode => $input->{recode},
362                            stats => $stats,
363                            modify_records => $input->{modify_records},
364                            modify_file => $input->{modify_file},
365                            input_config => $input,
366                    );
367                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
368    
369                    if (defined( $input->{lookup} )) {
370                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
371                            delete( $input->{lookup} );
372                    }
373    
374                    my $lookup_coderef;
375    
376                    if (@lookups) {
377    
378                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
379    
380                            $lookup_coderef = sub {
381                                    my $rec = shift || die "need rec!";
382                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
383    
384                                    WebPAC::Normalize::data_structure(
385                                            row => $rec,
386                                            rules => $rules,
387                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
388                                    );
389    
390                                    #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
391                            };
392    
393                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
394    
395                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
396    
397                    };
398    
399                    my $lookup_jar;
400    
401                    my $maxmfn = $input_db->open(
402                            path => $input->{path},
403                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
404                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
405                            lookup => $lookup_jar,
406                            %{ $input },
407                            load_row => sub {
408                                    my $a = shift;
409                                    return $store->load_row(
410                                            database => $database,
411                                            input => $input_name,
412                                            id => $a->{id},
413                                    );
414                            },
415                            save_row => sub {
416                                    my $a = shift;
417                                    return $store->save_row(
418                                            database => $database,
419                                            input => $input_name,
420                                            id => $a->{id},
421                                            row => $a->{row},
422                                    );
423                            },
424    
425                    );
426    
427                    my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
428    
429                    if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
430                            $log->debug("created following lookups: ", sub { dump( $lookup_data ) } );
431    
432                            foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
433                                    $store->save_lookup(
434                                            database => $database,
435                                            input => $input_name,
436                                            key => $key,
437                                            data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
438                                    );
439                            }
440                    }
441    
442                    my $report_fh;
443                    if ($stats || $validate) {
444                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
445                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
446    
447                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
448                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
449                            $log->info("Generating report file $path");
450    
451                            if ( $validate ) {
452                                    $validate->read_validate_file( $validate->fill_in( $validate_path, database => $database, input => $input_name ) ) if ( $validate_path );
453                                    $validate->read_validate_delimiters_file( $validate->fill_in( $validate_delimiters_path, database => $database, input => $input_name ) ) if ( $validate_delimiters_path );
454                            }
455                    }
456    
457                    my $marc;
458                    if ($marc_generate && $parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
459                            $marc = new WebPAC::Output::MARC(
460                                    path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
461                                    lint => $marc_lint,
462                                    dump => $marc_dump,
463                            );
464                    }
465    
466                    my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
467                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
468    
469                    # reset position in database
470                    $input_db->seek(1);
471    
472                    # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
473                    my $indexer_config = $use_indexer;
474                    $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
475    
476                    my $lookup_hash;
477                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
478            
479                    if ($depends) {
480                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
481                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
482    
483                            foreach my $db (keys %$depends) {
484                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
485                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
486                                                    my $t = time();
487                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
488                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
489                                                            database => $db,
490                                                            input => $i,
491                                                            key => $k,
492                                                    );
493                                                    $log->debug(sprintf("lookup $db/$i took %.2fs", time() - $t));
494                                            }
495                                    }
496                            }
497    
498                            $log->debug("lookup_hash = ", sub { dump( $lookup_hash ) });
499                    }
500    
501    
502                    foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
503    
504                            my $row = $input_db->fetch || next;
505    
506                            $total_rows++;
507    
508                            my $mfn = $row->{'000'}->[0];
509    
510                            if (! $mfn || $mfn !~ m{^\d+$}) {
511                                    $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
512                                    $mfn = $pos;
513                                    push @{ $row->{'000'} }, $pos;
514                            }
515    
516    
517                            if ($validate) {
518                                    if ( my $errors = $validate->validate_rec( $row, $input_db->dump_ascii ) ) {
519                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
520                                                    $validate->report_error( $errors )
521                                            );
522                                    }
523                                    next;   # validation doesn't create any output
524                            }
525    
526                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
527                                    row => $row,
528                                    rules => $rules,
529                                    lookup => $lookup_hash,
530                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
531                                    marc_encoding => 'utf-8',
532                                    load_row_coderef => sub {
533                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
534                                            return $store->load_row(
535                                                    database => $database,
536                                                    input => $input,
537                                                    id => $mfn,
538                                            );
539                                    },
540                            );
541    
542                            $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
543    
544                            $store->save_ds(
545                                    database => $database,
546                                    input => $input_name,
547                                    id => $mfn,
548                                    ds => $ds,
549                            ) if ($ds && !$stats);
550    
551                            $indexer->add(
552                                    id => "${input_name}/${mfn}",
553                                    ds => $ds,
554                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
555                            ) if ($indexer && $ds);
556    
557                            if ($marc) {
558                                    my $i = 0;
559    
560                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
561                                            $marc->add(
562                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
563                                                    fields => $fields,
564                                                    leader => WebPAC::Normalize::_get_marc_leader(),
565                                                    row => $row,
566                                            );
567                                            $i++;
568                                    }
569    
570                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
571                            }
572    
573                            foreach my $out ( @outputs ) {
574                                    $out->add( $mfn, $ds ) if $out->can('add');
575                            }
576    
577                    }
578    
579                    if ($validate) {
580                            my $errors = $validate->report;
581                            if ($errors) {
582                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
583                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
584                            }
585    
586                            print $report_fh "\nAll possible subfields/delimiter templates:\n", $validate->delimiters_templates( report => 1, current_input => 1 ), "\n\n";
587    
588                            # must be last thing that touches $validate for this input
589                            $validate->reset;
590                    }
591    
592                    if ($stats) {
593                            my $s = $input_db->stats;
594                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
595                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
596                    }
597    
598                    # close MARC file
599                    $marc->finish if ($marc);
600    
601                    # close report
602                    close($report_fh) if ($report_fh);
603            }
604    
605            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
606    
607            foreach my $out ( @outputs ) {
608                    $out->finish if $out->can('finish');
609            }
610    
611            my $dt = time() - $start_t;
612            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
613                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
614                            $dt, ($total_rows / $dt)
615                    )
616          );          );
617    
618  };  
619            # end forked process
620            if ($parallel) {
621                    $log->info("parallel process $$ finished");
622                    exit(0);
623            }
624    
625    }
626    
627    if ($parallel) {
628            # wait all children to finish
629            sleep(1) while wait != -1;
630            $log->info("all parallel processes finished");
631    }
632    
633    # save new delimiters if needed
634    $validate->save_delimiters_templates if ( $validate_delimiters_path );
635    
636    #
637    # handle links or merge after indexing
638    #
639    
640    if ($merge) {
641            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
642            close($estcmd_fh);
643            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
644            system $estcmd_path;
645    } else {
646            foreach my $link (@links) {
647                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
648                    $link->();
649            }
650    }

Legend:
Removed from v.76  
changed lines
  Added in v.916

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26