/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 221 by dpavlin, Mon Dec 5 17:48:23 2005 UTC revision 707 by dpavlin, Mon Sep 25 15:26:12 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.04;
11    use WebPAC::Input 0.13;
12  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Store 0.03;
13  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Normalize 0.11;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.06;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    
25  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
26    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
27    
28  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
29    
30  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
31    
32  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
33    
34    Options:
35    
36    =over 4
37    
38    =item --offset 42
39    
40    start loading (all) databases at offset 42
41    
42    =item --limit 100
43    
44    limit loading to 100 records
45    
46    =item --clean
47    
48    remove database and Hyper Estraier index before indexing
49    
50    =item --only=database_name/input_filter
51    
52    reindex just single database (legacy name is --one)
53    
54    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
55    or C<type> from input
56    
57    =item --config conf/config.yml
58    
59    path to YAML configuration file
60    
61    =item --stats
62    
63    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
64    and subfield usage for each input
65    
66    =item --validate path/to/validation_file
67    
68    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
69    
70    =item --marc-normalize conf/normalize/mapping.pl
71    
72    This option specifies normalisation file for MARC creation
73    
74    =item --marc-output out/marc/test.marc
75    
76    Optional path to output file
77    
78    =item --marc-lint
79    
80    By default turned on if C<--marc-normalize> is used. You can disable lint
81    messages with C<--no-marc-lint>.
82    
83    =item --marc-dump
84    
85    Force dump or input and marc record for debugging.
86    
87    =item --parallel 4
88    
89    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
90    machine if you want to use full load)
91    
92    =item --only-links
93    
94    Create just links
95    
96    =item --merge
97    
98    Create merged index of databases which have links
99    
100    =back
101    
102    =cut
103    
104    my $offset;
105    my $limit;
106    
107    my $clean = 0;
108    my $config_path;
109    my $debug = 0;
110    my $only_filter;
111    my $stats = 0;
112    my $validate_path;
113    my ($marc_normalize, $marc_output);
114    my $marc_lint = 1;
115    my $marc_dump = 0;
116    my $parallel = 0;
117    my $only_links = 0;
118    my $merge = 0;
119    
120    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
121    
122    GetOptions(
123            "limit=i" => \$limit,
124            "offset=i" => \$offset,
125            "clean" => \$clean,
126            "one=s" => \$only_filter,
127            "only=s" => \$only_filter,
128            "config" => \$config_path,
129            "debug+" => \$debug,
130            "stats" => \$stats,
131            "validate=s" => \$validate_path,
132            "marc-normalize=s" => \$marc_normalize,
133            "marc-output=s" => \$marc_output,
134            "marc-lint!" => \$marc_lint,
135            "marc-dump!" => \$marc_dump,
136            "parallel=i" => \$parallel,
137            "only-links!" => \$only_links,
138            "merge" => \$merge,
139    );
140    
141    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
142    
143    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
144    
145    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
146    
147    $log->info( "-" x 79 );
148    
149    
150    my $estcmd_fh;
151    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
152    if ($merge) {
153            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
154            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
155            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
156            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
157    }
158    
159    
160    my $validate;
161    $validate = new WebPAC::Validate(
162            path => $validate_path,
163    ) if ($validate_path);
164    
165    
166    my $use_indexer = $config->use_indexer;
167    if ($stats) {
168            $log->debug("option --stats disables update of indexing engine...");
169            $use_indexer = undef;
170    } else {
171            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
172    }
173    
174    # disable indexing when creating marc
175    $use_indexer = undef if ($marc_normalize);
176    
177    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
178    
179    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
180    
181  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
182    my $start_t = time();
183    
184  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
185    
186          my $type = lc($db_config->{input}->{type});  if ($parallel) {
187            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
188            Proc::Queue::size($parallel);
189    }
190    
191          die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');  sub create_ds_config {
192            my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
193            my $c = dclone( $db_config );
194            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
195            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
196            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
197            return $c;
198    }
199    
200          my $abs_path = abs_path($0);  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
         $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;  
201    
202          my $lookup = new WebPAC::Lookup(          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
203                  lookup_file => $db_config->{input}->{lookup},          next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
204          );  
205            if ($parallel) {
206                    my $f=fork;
207                    if(defined ($f) and $f==0) {
208                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
209                    } else {
210                            next;
211                    }
212            }
213    
214            my $indexer;
215            if ($use_indexer) {
216    
217                    my $cfg_name = $use_indexer;
218                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
219    
220                    my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
221                    $indexer_config->{database} = $database;
222                    $indexer_config->{clean} = $clean;
223                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
224    
225                    # force clean if database has links
226                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
227    
228                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
229    
230          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;                          # open Hyper Estraier database
231                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
232                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
233                    
234                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
235    
236                            # open Hyper Estraier database
237                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
238                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
239    
240          my $log = $lookup->_get_logger;                  } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
241          $log->info("working on $database in $db_path");  
242                            # open KinoSearch
243                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
244                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
245                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
246    
247                    } else {
248                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
249                    }
250    
251                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
252            }
253    
254    
255            #
256            # store Hyper Estraier links to other databases
257            #
258            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
259                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
260                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
261                                    if ($merge) {
262                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
263                                    } else {
264                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
265                                            push @links, sub {
266                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
267                                                    $indexer->add_link(
268                                                            from => $database,
269                                                            to => $link->{to},
270                                                            credit => $link->{credit},
271                                                    );
272                                            };
273                                    }
274                            } else {
275                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
276                            }
277                    }
278            }
279            next if ($only_links);
280    
281    
282            #
283            # now WebPAC::Store
284            #
285            my $abs_path = abs_path($0);
286            $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
287    
288            my $db_path = $config->get('webpac')->{db_path} . '/' . $database;
289    
290            if ($clean) {
291                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
292                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
293            } else {
294                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
295            }
296    
297          my $db = new WebPAC::Store(          my $db = new WebPAC::Store(
298                  path => $db_path,                  path => $db_path,
299                  database => $database,                  database => $database,
300                  debug => 1,                  debug => $debug,
301          );          );
302    
         my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");  
         $est_config->{database} = $database;  
   
         $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");  
   
         my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  
                 %{ $est_config },  
         );  
303    
304          #          #
305          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
# Line 67  while (my ($database, $db_config) = each Line 308  while (my ($database, $db_config) = each
308          my @inputs;          my @inputs;
309          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
310                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
311          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
312                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
313            } else {
314                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
315          }          }
316    
317          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
                 $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");  
318    
319                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  next if ($only_input && ($input->{name} !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
                         code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},  
                         limit_mfn => $input->{limit},  
                 );  
320    
321                  my $maxmfn = $isis->open(                  my $type = lc($input->{type});
322                          filename => $input->{path},  
323                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                  die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
324    
325                    my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
326    
327                    my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
328    
329                    $log->info("working on input '$input->{name}' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
330                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
331                  );                  );
332    
333                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  if ($stats) {
334                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          # disable modification of records if --stats is in use
335                          db => $db,                          delete($input->{modify_records});
336                          lookup_regex => $lookup->regex,                          delete($input->{modify_file});
337                          lookup => $lookup,                  }
338                          prefix => $input->{name},  
339                    my $input_db = new WebPAC::Input(
340                            module => $input_module,
341                            encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
342                            limit => $limit || $input->{limit},
343                            offset => $offset,
344                            recode => $input->{recode},
345                            stats => $stats,
346                            modify_records => $input->{modify_records},
347                            modify_file => $input->{modify_file},
348                  );                  );
349                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
350    
351                    if (defined( $input->{lookup} )) {
352                            $log->warn("$database/", $input->{name}, " has depriciated lookup definition, removing it...");
353                            delete( $input->{lookup} );
354                    }
355    
356                    my $lookup;
357                    my $lookup_coderef;
358    
359                    if (@lookups) {
360    
361                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
362    
363                            $lookup_coderef = sub {
364                                    my $rec = shift || die "need rec!";
365                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
366    
367                  $n->open(                                  WebPAC::Normalize::data_structure(
368                          tag => $input->{normalize}->{tag},                                          row => $rec,
369                          xml_file => $input->{normalize}->{path},                                          rules => $rules,
370                                            lookup => $lookup,
371                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
372                                    );
373    
374                                    warn "current lookup = ", dump($lookup) if ($lookup);
375                            };
376    
377                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
378    
379                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
380    
381                    };
382    
383                    my $maxmfn = $input_db->open(
384                            path => $input->{path},
385                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
386                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
387                            %{ $input },
388                  );                  );
389    
390                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  $log->debug("created following lookups: ", dump( WebPAC::Normalize::_get_lookup() ) );
391    
392                    my $report_fh;
393                    if ($stats || $validate) {
394                            my $path = "out/report/" . $database . '-' . $input->{name} . '.txt';
395                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
396    
397                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input->{name}' records ",
398                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
399                            $log->info("Generating report file $path");
400                    }
401    
402                    my @norm_array = ref($input->{normalize}) eq 'ARRAY' ?
403                            @{ $input->{normalize} } : ( $input->{normalize} );
404    
405                    if ($marc_normalize) {
406                            @norm_array = ( {
407                                    path => $marc_normalize,
408                                    output => $marc_output || 'out/marc/' . $database . '-' . $input->{name} . '.marc',
409                            } );
410                    }
411    
412                    foreach my $normalize (@norm_array) {
413    
414                          my $row = $isis->fetch || next;                          my $normalize_path = $normalize->{path} || $log->logdie("can't find normalize path in config");
415    
416                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                          $log->logdie("Found '$normalize_path' as normalization file which isn't supported any more!") unless ( $normalize_path =~ m!\.pl$!i );
417    
418                          my $ds = $n->data_structure($row);                          my $rules = read_file( $normalize_path ) or die "can't open $normalize_path: $!";
419    
420                          $est->add(                          $log->info("Using $normalize_path for normalization...");
421                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,  
422                                  ds => $ds,                          my $marc = new WebPAC::Output::MARC(
423                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},                                  path => $normalize->{output},
424                          );                                  lint => $marc_lint,
425                                    dump => $marc_dump,
426                            ) if ($normalize->{output});
427    
428                            # reset position in database
429                            $input_db->seek(1);
430    
431                            # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
432                            my $indexer_config = $use_indexer;
433                            $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
434    
435                            foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
436    
437                                    my $row = $input_db->fetch || next;
438    
439                                    my $mfn = $row->{'000'}->[0];
440    
441                                    if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
442                                            $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
443                                            $mfn = $pos;
444                                            push @{ $row->{'000'} }, $pos;
445                                    }
446    
447    
448                                    if ($validate) {
449                                            if ( my $errors = $validate->validate_errors( $row, $input_db->dump ) ) {
450                                                    $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
451                                                            $validate->report_error( $errors )
452                                                    );
453                                            }
454                                    }
455    
456                                    my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
457                                            row => $row,
458                                            rules => $rules,
459                                            lookup => $lookup ? $lookup->lookup_hash : undef,
460                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
461                                            marc_encoding => 'utf-8',
462                                    );
463    
464                                    $db->save_ds(
465                                            id => $mfn,
466                                            ds => $ds,
467                                            prefix => $input->{name},
468                                    ) if ($ds && !$stats);
469    
470                                    $indexer->add(
471                                            id => $input->{name} . "/" . $mfn,
472                                            ds => $ds,
473                                            type => $config->get($indexer_config)->{type},
474                                    ) if ($indexer && $ds);
475    
476                                    if ($marc) {
477                                            my $i = 0;
478    
479                                            while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
480                                                    $marc->add(
481                                                            id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
482                                                            fields => $fields,
483                                                            leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
484                                                            row => $row,
485                                                    );
486                                                    $i++;
487                                            }
488    
489                                            $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
490                                    }
491    
492                                    $total_rows++;
493                            }
494    
495                            if ($validate) {
496                                    my $errors = $validate->report;
497                                    if ($errors) {
498                                            $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
499                                            print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
500                                    }
501                            }
502    
503                            if ($stats) {
504                                    my $s = $input_db->stats;
505                                    $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
506                                    print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
507                            }
508    
509                          $total_rows++;                          # close MARC file
510                            $marc->finish if ($marc);
511    
512                            # close report
513                            close($report_fh) if ($report_fh)
514                  }                  }
515    
516          };          }
517    
518            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
519    
520            my $dt = time() - $start_t;
521            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
522                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
523                            $dt, ($total_rows / $dt)
524                    )
525            );
526    
527    
528            # end forked process
529            if ($parallel) {
530                    $log->info("parallel process $$ finished");
531                    exit(0);
532            }
533    
         $log->info("$total_rows records indexed");  
534  }  }
535    
536    if ($parallel) {
537            # wait all children to finish
538            sleep(1) while wait != -1;
539            $log->info("all parallel processes finished");
540    }
541    
542    #
543    # handle links or merge after indexing
544    #
545    
546    if ($merge) {
547            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
548            close($estcmd_fh);
549            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
550            system $estcmd_path;
551    } else {
552            foreach my $link (@links) {
553                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
554                    $link->();
555            }
556    }

Legend:
Removed from v.221  
changed lines
  Added in v.707

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26