/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 268 by dpavlin, Fri Dec 16 21:09:42 2005 UTC revision 664 by dpavlin, Mon Sep 11 11:57:18 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Common 0.02;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Lookup 0.03;
11  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Input 0.11;
12  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Store 0.03;
13  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Normalize 0.11;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.05;  use WebPAC::Validate 0.06;
16    use WebPAC::Output::MARC;
17  use YAML qw/LoadFile/;  use YAML qw/LoadFile/;
18  use LWP::Simple;  use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    
25  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
26    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
27    
28  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
29    
30  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
31    
32    B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
33    
34    Options:
35    
36    =over 4
37    
38    =item --offset 42
39    
40    start loading (all) databases at offset 42
41    
42    =item --limit 100
43    
44    limit loading to 100 records
45    
46    =item --clean
47    
48    remove database and Hyper Estraier index before indexing
49    
50    =item --only=database_name/input_filter
51    
52    reindex just single database (legacy name is --one)
53    
54    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
55    or C<type> from input
56    
57    =item --config conf/config.yml
58    
59    path to YAML configuration file
60    
61    =item --stats
62    
63    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
64    and subfield usage for each input
65    
66    =item --validate path/to/validation_file
67    
68    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
69    
70    =item --marc-normalize conf/normalize/mapping.pl
71    
72    This option specifies normalisation file for MARC creation
73    
74    =item --marc-output out/marc/test.marc
75    
76    Optional path to output file
77    
78    =item --marc-lint
79    
80    By default turned on if C<--marc-normalize> is used. You can disable lint
81    messages with C<--no-marc-lint>.
82    
83    =item --marc-dump
84    
85    Force dump or input and marc record for debugging.
86    
87    =item --parallel 4
88    
89    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
90    machine if you want to use full load)
91    
92    =item --only-links
93    
94    Create just links
95    
96    =item --merge
97    
98    Create merged index of databases which have links
99    
100    =back
101    
102    =cut
103    
104    my $offset;
105    my $limit;
106    
107    my $clean = 0;
108    my $config = 'conf/config.yml';
109    my $debug = 0;
110    my $only_filter;
111    my $stats = 0;
112    my $validate_path;
113    my ($marc_normalize, $marc_output);
114    my $marc_lint = 1;
115    my $marc_dump = 0;
116    my $parallel = 0;
117    my $only_links = 0;
118    my $merge = 0;
119    
120    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
121    
122    my $hostname = `hostname`;
123    chomp($hostname);
124    $hostname =~ s/\..+$//;
125    if (-e "conf/$hostname.yml") {
126            $config = "conf/$hostname.yml";
127            $log->info("using host configuration file: $config");
128    }
129    
130    GetOptions(
131            "limit=i" => \$limit,
132            "offset=i" => \$offset,
133            "clean" => \$clean,
134            "one=s" => \$only_filter,
135            "only=s" => \$only_filter,
136            "config" => \$config,
137            "debug+" => \$debug,
138            "stats" => \$stats,
139            "validate=s" => \$validate_path,
140            "marc-normalize=s" => \$marc_normalize,
141            "marc-output=s" => \$marc_output,
142            "marc-lint!" => \$marc_lint,
143            "marc-dump!" => \$marc_dump,
144            "parallel=i" => \$parallel,
145            "only-links!" => \$only_links,
146            "merge" => \$merge,
147    );
148    
149    $config = LoadFile($config);
150    
151    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
152    
153  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});
154    
155    $log->info( "-" x 79 );
156    
157    
158    my $estcmd_fh;
159    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
160    if ($merge) {
161            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
162            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
163            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
164            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
165    }
166    
167    
168    my $validate;
169    $validate = new WebPAC::Validate(
170            path => $validate_path,
171    ) if ($validate_path);
172    
173    
174    my $use_indexer = $config->{use_indexer} || 'hyperestraier';
175    if ($stats) {
176            $log->debug("option --stats disables update of indexing engine...");
177            $use_indexer = undef;
178    } else {
179            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
180    }
181    
182    # disable indexing when creating marc
183    $use_indexer = undef if ($marc_normalize);
184    
185  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
186    my $start_t = time();
187    
188    my @links;
189    
190    if ($parallel) {
191            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
192            Proc::Queue::size($parallel);
193    }
194    
195  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {
196    
197          my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
198            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
199    
200          #          if ($parallel) {
201          # open Hyper Estraier database                  my $f=fork;
202          #                  if(defined ($f) and $f==0) {
203                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
204                    } else {
205                            next;
206                    }
207            }
208    
209          my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");          my $indexer;
210          $est_config->{database} = $database;          if ($use_indexer) {
211    
212          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");                  my $cfg_name = $use_indexer;
213                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
214    
215                    my $indexer_config = $config->{$cfg_name} || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
216                    $indexer_config->{database} = $database;
217                    $indexer_config->{clean} = $clean;
218                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
219    
220                    # force clean if database has links
221                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
222    
223                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
224    
225                            # open Hyper Estraier database
226                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
227                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
228                    
229                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
230    
231                            # open Hyper Estraier database
232                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
233                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
234    
235                            $use_indexer = 'hyperestraier';
236    
237                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
238    
239                            # open KinoSearch
240                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
241                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
242                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
243    
244                    } else {
245                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
246                    }
247    
248                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
249            }
250    
251    
252            #
253            # store Hyper Estraier links to other databases
254            #
255            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
256                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
257                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
258                                    if ($merge) {
259                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
260                                    } else {
261                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
262                                            push @links, sub {
263                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
264                                                    $indexer->add_link(
265                                                            from => $database,
266                                                            to => $link->{to},
267                                                            credit => $link->{credit},
268                                                    );
269                                            };
270                                    }
271                            } else {
272                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
273                            }
274                    }
275            }
276            next if ($only_links);
277    
         my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  
                 %{ $est_config },  
         );  
278    
279          #          #
280          # now WebPAC::Store          # now WebPAC::Store
# Line 52  while (my ($database, $db_config) = each Line 284  while (my ($database, $db_config) = each
284    
285          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;
286    
287          $log->info("working on $database in $db_path");          if ($clean) {
288                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
289                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
290            } else {
291                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
292            }
293    
294          my $db = new WebPAC::Store(          my $db = new WebPAC::Store(
295                  path => $db_path,                  path => $db_path,
296                  database => $database,                  database => $database,
297                  debug => 1,                  debug => $debug,
298          );          );
299    
300    
# Line 74  while (my ($database, $db_config) = each Line 311  while (my ($database, $db_config) = each
311                  $log->info("database $database doesn't have inputs defined");                  $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
312          }          }
313    
314            my @supported_inputs = keys %{ $config->{webpac}->{inputs} };
315    
316          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
317    
318                    next if ($only_input && ($input->{name} !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
319    
320                  my $type = lc($input->{type});                  my $type = lc($input->{type});
321    
322                  die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');                  die "I know only how to handle input types ", join(",", @supported_inputs), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, @supported_inputs));
323    
324                    my $lookup;
325                    if ($input->{lookup}) {
326                            $lookup = new WebPAC::Lookup(
327                                    lookup_file => $input->{lookup},
328                            );
329                            delete( $input->{lookup} );
330                    }
331    
332                  my $lookup = new WebPAC::Lookup(                  my $input_module = $config->{webpac}->{inputs}->{$type};
333                          lookup_file => $input->{lookup},  
334                    $log->info("working on input '$input->{name}' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
335                            $input->{lookup} ? "lookup '$input->{lookup}'" : ""
336                  );                  );
337    
338                  $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");                  if ($stats) {
339                            # disable modification of records if --stats is in use
340                            delete($input->{modify_records});
341                            delete($input->{modify_file});
342                    }
343    
344                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  my $input_db = new WebPAC::Input(
345                          code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},                          module => $input_module,
346                          limit_mfn => $input->{limit},                          encoding => $config->{webpac}->{webpac_encoding},
347                          lookup => $lookup,                          limit => $limit || $input->{limit},
348                            offset => $offset,
349                            lookup_coderef => sub {
350                                    my $rec = shift || return;
351                                    $lookup->add( $rec );
352                            },
353                            recode => $input->{recode},
354                            stats => $stats,
355                            modify_records => $input->{modify_records},
356                            modify_file => $input->{modify_file},
357                  );                  );
358                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
359    
360                  my $maxmfn = $isis->open(                  my $maxmfn = $input_db->open(
361                          filename => $input->{path},                          path => $input->{path},
362                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding
363                            %{ $input },
364                  );                  );
365    
366                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  my @norm_array = ref($input->{normalize}) eq 'ARRAY' ?
367                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          @{ $input->{normalize} } : ( $input->{normalize} );
                         db => $db,  
                         lookup_regex => $lookup->regex,  
                         lookup => $lookup,  
                         prefix => $input->{name},  
                 );  
368    
369                  $n->open(                  if ($marc_normalize) {
370                          tag => $input->{normalize}->{tag},                          @norm_array = ( {
371                          xml_file => $input->{normalize}->{path},                                  path => $marc_normalize,
372                  );                                  output => $marc_output || 'out/marc/' . $database . '-' . $input->{name} . '.marc',
373                            } );
374                    }
375    
376                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  foreach my $normalize (@norm_array) {
377    
378                          my $row = $isis->fetch || next;                          my $normalize_path = $normalize->{path} || $log->logdie("can't find normalize path in config");
379    
380                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                          $log->logdie("Found '$normalize_path' as normalization file which isn't supported any more!") unless ( $normalize_path =~ m!\.pl$!i );
381    
382                          my $ds = $n->data_structure($row);                          my $rules = read_file( $normalize_path ) or die "can't open $normalize_path: $!";
383    
384                          $est->add(                          $log->info("Using $normalize_path for normalization...");
                                 id => $input->{name} . "#" . $mfn,  
                                 ds => $ds,  
                                 type => $config->{hyperestraier}->{type},  
                         );  
385    
386                          $total_rows++;                          my $marc = new WebPAC::Output::MARC(
387                  }                                  path => $normalize->{output},
388                                    lint => $marc_lint,
389                                    dump => $marc_dump,
390                            ) if ($normalize->{output});
391    
392          };                          # reset position in database
393                            $input_db->seek(1);
394    
395          $log->info("$total_rows records indexed");                          foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
396    
397                                    my $row = $input_db->fetch || next;
398    
399                                    my $mfn = $row->{'000'}->[0];
400    
401                                    if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
402                                            $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
403                                            $mfn = $pos;
404                                            push @{ $row->{'000'} }, $pos;
405                                    }
406    
407    
408                                    if ($validate) {
409                                            if ( my $errors = $validate->validate_errors( $row, $input_db->dump ) ) {
410                                                    $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
411                                                            dump( $errors )
412                                                    );
413                                            }
414                                    }
415    
416                                    my $ds_config = dclone($db_config);
417    
418                                    # default values -> database key
419                                    $ds_config->{_} = $database;
420    
421                                    # current mfn
422                                    $ds_config->{_mfn} = $mfn;
423    
424                                    # attach current input
425                                    $ds_config->{input} = $input;
426    
427                                    my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
428                                            row => $row,
429                                            rules => $rules,
430                                            lookup => $lookup ? $lookup->lookup_hash : undef,
431                                            config => $ds_config,
432                                            marc_encoding => 'utf-8',
433                                    );
434    
435                                    $db->save_ds(
436                                            id => $mfn,
437                                            ds => $ds,
438                                            prefix => $input->{name},
439                                    ) if ($ds && !$stats);
440    
441                                    $indexer->add(
442                                            id => $input->{name} . "/" . $mfn,
443                                            ds => $ds,
444                                            type => $config->{$use_indexer}->{type},
445                                    ) if ($indexer && $ds);
446    
447                                    if ($marc) {
448                                            my $i = 0;
449    
450                                            while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
451                                                    $marc->add(
452                                                            id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
453                                                            fields => $fields,
454                                                            leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
455                                                            row => $row,
456                                                    );
457                                                    $i++;
458                                            }
459    
460                                            $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
461                                    }
462    
463                                    $total_rows++;
464                            }
465    
466                            if ($validate) {
467                                    my $errors = $validate->report;
468                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" ) if ($errors);
469                            }
470    
471                            $log->info("statistics of fields usage:\n", $input_db->stats) if ($stats);
472    
473                            # close MARC file
474                            $marc->finish if ($marc);
475    
         #  
         # add Hyper Estraier links to other databases  
         #  
         if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY') {  
                 foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {  
                         $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");  
                         $est->add_link(  
                                 from => $database,  
                                 to => $link->{to},  
                                 credit => $link->{credit},  
                         );  
476                  }                  }
477    
478            }
479    
480            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
481    
482            my $dt = time() - $start_t;
483            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
484                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
485                            $dt, ($total_rows / $dt)
486                    )
487            );
488    
489    
490            # end forked process
491            if ($parallel) {
492                    $log->info("parallel process $$ finished");
493                    exit(0);
494          }          }
495    
496  }  }
497    
498    if ($parallel) {
499            # wait all children to finish
500            sleep(1) while wait != -1;
501            $log->info("all parallel processes finished");
502    }
503    
504    #
505    # handle links or merge after indexing
506    #
507    
508    if ($merge) {
509            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
510            close($estcmd_fh);
511            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
512            system $estcmd_path;
513    } else {
514            foreach my $link (@links) {
515                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
516                    $link->();
517            }
518    }

Legend:
Removed from v.268  
changed lines
  Added in v.664

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26