/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 251 by dpavlin, Thu Dec 15 14:12:00 2005 UTC revision 702 by dpavlin, Mon Sep 25 13:08:17 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.04;
11    use WebPAC::Lookup 0.03;
12    use WebPAC::Input 0.11;
13  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Store 0.03;
14  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Normalize 0.11;
15  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
16  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.06;
17  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
18  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
19    use Getopt::Long;
20    use File::Path;
21    use Time::HiRes qw/time/;
22    use File::Slurp;
23    use Data::Dump qw/dump/;
24    use Storable qw/dclone/;
25    
26  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
27    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
28    
29  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
30    
31  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
32    
33  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
34    
35    Options:
36    
37    =over 4
38    
39    =item --offset 42
40    
41    start loading (all) databases at offset 42
42    
43    =item --limit 100
44    
45    limit loading to 100 records
46    
47    =item --clean
48    
49    remove database and Hyper Estraier index before indexing
50    
51    =item --only=database_name/input_filter
52    
53    reindex just single database (legacy name is --one)
54    
55    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
56    or C<type> from input
57    
58    =item --config conf/config.yml
59    
60    path to YAML configuration file
61    
62    =item --stats
63    
64    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
65    and subfield usage for each input
66    
67    =item --validate path/to/validation_file
68    
69    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
70    
71    =item --marc-normalize conf/normalize/mapping.pl
72    
73    This option specifies normalisation file for MARC creation
74    
75    =item --marc-output out/marc/test.marc
76    
77    Optional path to output file
78    
79    =item --marc-lint
80    
81    By default turned on if C<--marc-normalize> is used. You can disable lint
82    messages with C<--no-marc-lint>.
83    
84    =item --marc-dump
85    
86    Force dump or input and marc record for debugging.
87    
88    =item --parallel 4
89    
90    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
91    machine if you want to use full load)
92    
93    =item --only-links
94    
95    Create just links
96    
97    =item --merge
98    
99    Create merged index of databases which have links
100    
101    =back
102    
103    =cut
104    
105    my $offset;
106    my $limit;
107    
108    my $clean = 0;
109    my $config_path;
110    my $debug = 0;
111    my $only_filter;
112    my $stats = 0;
113    my $validate_path;
114    my ($marc_normalize, $marc_output);
115    my $marc_lint = 1;
116    my $marc_dump = 0;
117    my $parallel = 0;
118    my $only_links = 0;
119    my $merge = 0;
120    
121    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
122    
123    GetOptions(
124            "limit=i" => \$limit,
125            "offset=i" => \$offset,
126            "clean" => \$clean,
127            "one=s" => \$only_filter,
128            "only=s" => \$only_filter,
129            "config" => \$config_path,
130            "debug+" => \$debug,
131            "stats" => \$stats,
132            "validate=s" => \$validate_path,
133            "marc-normalize=s" => \$marc_normalize,
134            "marc-output=s" => \$marc_output,
135            "marc-lint!" => \$marc_lint,
136            "marc-dump!" => \$marc_dump,
137            "parallel=i" => \$parallel,
138            "only-links!" => \$only_links,
139            "merge" => \$merge,
140    );
141    
142    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
143    
144    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
145    
146    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
147    
148    $log->info( "-" x 79 );
149    
150    
151    my $estcmd_fh;
152    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
153    if ($merge) {
154            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
155            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
156            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
157            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
158    }
159    
160    
161    my $validate;
162    $validate = new WebPAC::Validate(
163            path => $validate_path,
164    ) if ($validate_path);
165    
166    
167    my $use_indexer = $config->use_indexer;
168    if ($stats) {
169            $log->debug("option --stats disables update of indexing engine...");
170            $use_indexer = undef;
171    } else {
172            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
173    }
174    
175    # disable indexing when creating marc
176    $use_indexer = undef if ($marc_normalize);
177    
178    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
179    
180    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
181    
182  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
183    my $start_t = time();
184    
185    my @links;
186    
187    if ($parallel) {
188            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
189            Proc::Queue::size($parallel);
190    }
191    
192    while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
193    
194  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
195            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
196    
197            if ($parallel) {
198                    my $f=fork;
199                    if(defined ($f) and $f==0) {
200                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
201                    } else {
202                            next;
203                    }
204            }
205    
206            my $indexer;
207            if ($use_indexer) {
208    
209                    my $cfg_name = $use_indexer;
210                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
211    
212                    my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
213                    $indexer_config->{database} = $database;
214                    $indexer_config->{clean} = $clean;
215                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
216    
217                    # force clean if database has links
218                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
219    
220                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
221    
222                            # open Hyper Estraier database
223                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
224                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
225                    
226                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
227    
228                            # open Hyper Estraier database
229                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
230                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
231    
232                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
233    
234                            # open KinoSearch
235                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
236                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
237                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
238    
239                    } else {
240                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
241                    }
242    
243                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
244            }
245    
246    
247            #
248            # store Hyper Estraier links to other databases
249            #
250            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
251                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
252                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
253                                    if ($merge) {
254                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
255                                    } else {
256                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
257                                            push @links, sub {
258                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
259                                                    $indexer->add_link(
260                                                            from => $database,
261                                                            to => $link->{to},
262                                                            credit => $link->{credit},
263                                                    );
264                                            };
265                                    }
266                            } else {
267                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
268                            }
269                    }
270            }
271            next if ($only_links);
272    
273    
274            #
275            # now WebPAC::Store
276            #
277          my $abs_path = abs_path($0);          my $abs_path = abs_path($0);
278          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
279    
280          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          my $db_path = $config->get('webpac')->{db_path} . '/' . $database;
281    
282            if ($clean) {
283                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
284                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
285            } else {
286                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
287            }
288    
289          my $db = new WebPAC::Store(          my $db = new WebPAC::Store(
290                  path => $db_path,                  path => $db_path,
291                  database => $database,                  database => $database,
292                  debug => 1,                  debug => $debug,
293          );          );
294    
         my $log = $db->_get_logger;  
         $log->info("working on $database in $db_path");  
   
         my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");  
         $est_config->{database} = $database;  
   
         $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");  
   
         my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  
                 %{ $est_config },  
         );  
295    
296          #          #
297          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
# Line 58  while (my ($database, $db_config) = each Line 300  while (my ($database, $db_config) = each
300          my @inputs;          my @inputs;
301          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
302                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
303          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
304                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
305            } else {
306                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
307          }          }
308    
309          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
310    
311                    next if ($only_input && ($input->{name} !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
312    
313                  my $type = lc($input->{type});                  my $type = lc($input->{type});
314    
315                  die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');                  die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
316    
317                  my $lookup = new WebPAC::Lookup(                  my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
318                          lookup_file => $input->{lookup},  
319                    $log->info("working on input '$input->{name}' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
320                            $input->{lookup} ? "lookup '$input->{lookup}'" : ""
321                  );                  );
322    
323                  $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");                  if ($stats) {
324                            # disable modification of records if --stats is in use
325                            delete($input->{modify_records});
326                            delete($input->{modify_file});
327                    }
328    
329                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  warn "parser->depends = ", dump( $parser->{depends} );
330                          code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},                  warn "depends on: ", dump( $parser->depends($database, $input->{name}) );
331                          limit_mfn => $input->{limit},                  warn "lookup_create_rules = ", dump( $parser->lookup_create_rules($database, $input->{name}) );
332                          lookup => $lookup,                  warn "parser->_lookup_create = ", dump( $parser->{_lookup_create} );
333    
334                    my $lookup;
335    
336                    my $input_db = new WebPAC::Input(
337                            module => $input_module,
338                            encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
339                            limit => $limit || $input->{limit},
340                            offset => $offset,
341                            lookup_coderef => sub {
342                                    my $rec = shift || return;
343                                    $lookup->add( $rec );
344                            },
345                            recode => $input->{recode},
346                            stats => $stats,
347                            modify_records => $input->{modify_records},
348                            modify_file => $input->{modify_file},
349                  );                  );
350                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
351    
352                    if (defined( $input->{lookup} )) {
353                            $log->warn("$database/", $input->{name}, " has depriciated lookup definition, removing it...");
354                            delete( $input->{lookup} );
355                    }
356    
357                  my $maxmfn = $isis->open(                  my $maxmfn = $input_db->open(
358                          filename => $input->{path},                          path => $input->{path},
359                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding
360                            %{ $input },
361                  );                  );
362    
363  $log->info( Dumper($lookup->{_lookup_data}) );                  my $report_fh;
364                    if ($stats || $validate) {
365                            my $path = "out/report/" . $database . '-' . $input->{name} . '.txt';
366                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
367    
368                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input->{name}' records ",
369                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
370                            $log->info("Generating report file $path");
371                    }
372    
373                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  my @norm_array = ref($input->{normalize}) eq 'ARRAY' ?
374                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          @{ $input->{normalize} } : ( $input->{normalize} );
                         db => $db,  
                         lookup_regex => $lookup->regex,  
                         lookup => $lookup,  
                         prefix => $input->{name},  
                 );  
375    
376                  $n->open(                  if ($marc_normalize) {
377                          tag => $input->{normalize}->{tag},                          @norm_array = ( {
378                          xml_file => $input->{normalize}->{path},                                  path => $marc_normalize,
379                  );                                  output => $marc_output || 'out/marc/' . $database . '-' . $input->{name} . '.marc',
380                            } );
381                    }
382    
383                    foreach my $normalize (@norm_array) {
384    
385                  for ( 0 ... $isis->size ) {                          my $normalize_path = $normalize->{path} || $log->logdie("can't find normalize path in config");
386    
387                          my $row = $isis->fetch || next;                          $log->logdie("Found '$normalize_path' as normalization file which isn't supported any more!") unless ( $normalize_path =~ m!\.pl$!i );
388    
389                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                          my $rules = read_file( $normalize_path ) or die "can't open $normalize_path: $!";
390    
391                          my $ds = $n->data_structure($row);                          $log->info("Using $normalize_path for normalization...");
392    
393                            my $marc = new WebPAC::Output::MARC(
394                                    path => $normalize->{output},
395                                    lint => $marc_lint,
396                                    dump => $marc_dump,
397                            ) if ($normalize->{output});
398    
399                            # reset position in database
400                            $input_db->seek(1);
401    
402                            # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
403                            my $indexer_config = $use_indexer;
404                            $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
405    
406                            foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
407    
408                                    my $row = $input_db->fetch || next;
409    
410                                    my $mfn = $row->{'000'}->[0];
411    
412                                    if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
413                                            $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
414                                            $mfn = $pos;
415                                            push @{ $row->{'000'} }, $pos;
416                                    }
417    
418    
419                                    if ($validate) {
420                                            if ( my $errors = $validate->validate_errors( $row, $input_db->dump ) ) {
421                                                    $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
422                                                            $validate->report_error( $errors )
423                                                    );
424                                            }
425                                    }
426    
427                                    my $ds_config = dclone($db_config);
428    
429                                    # default values -> database key
430                                    $ds_config->{_} = $database;
431    
432                                    # current mfn
433                                    $ds_config->{_mfn} = $mfn;
434    
435                                    # attach current input
436                                    $ds_config->{input} = $input;
437    
438                                    my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
439                                            row => $row,
440                                            rules => $rules,
441                                            lookup => $lookup ? $lookup->lookup_hash : undef,
442                                            config => $ds_config,
443                                            marc_encoding => 'utf-8',
444                                    );
445    
446                                    $db->save_ds(
447                                            id => $mfn,
448                                            ds => $ds,
449                                            prefix => $input->{name},
450                                    ) if ($ds && !$stats);
451    
452                                    $indexer->add(
453                                            id => $input->{name} . "/" . $mfn,
454                                            ds => $ds,
455                                            type => $config->get($indexer_config)->{type},
456                                    ) if ($indexer && $ds);
457    
458                                    if ($marc) {
459                                            my $i = 0;
460    
461                                            while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
462                                                    $marc->add(
463                                                            id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
464                                                            fields => $fields,
465                                                            leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
466                                                            row => $row,
467                                                    );
468                                                    $i++;
469                                            }
470    
471                                            $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
472                                    }
473    
474                                    $total_rows++;
475                            }
476    
477                            if ($validate) {
478                                    my $errors = $validate->report;
479                                    if ($errors) {
480                                            $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
481                                            print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
482                                    }
483                            }
484    
485                            if ($stats) {
486                                    my $s = $input_db->stats;
487                                    $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
488                                    print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
489                            }
490    
491                          $est->add(                          # close MARC file
492                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                          $marc->finish if ($marc);
                                 ds => $ds,  
                                 type => $config->{hyperestraier}->{type},  
                         );  
493    
494                          $total_rows++;                          # close report
495                            close($report_fh) if ($report_fh)
496                  }                  }
497    
498          };          }
499    
500            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
501    
502            my $dt = time() - $start_t;
503            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
504                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
505                            $dt, ($total_rows / $dt)
506                    )
507            );
508    
509    
510          $log->info("$total_rows records indexed");          # end forked process
511            if ($parallel) {
512                    $log->info("parallel process $$ finished");
513                    exit(0);
514            }
515    
516    }
517    
518    if ($parallel) {
519            # wait all children to finish
520            sleep(1) while wait != -1;
521            $log->info("all parallel processes finished");
522  }  }
523    
524    #
525    # handle links or merge after indexing
526    #
527    
528    if ($merge) {
529            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
530            close($estcmd_fh);
531            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
532            system $estcmd_path;
533    } else {
534            foreach my $link (@links) {
535                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
536                    $link->();
537            }
538    }

Legend:
Removed from v.251  
changed lines
  Added in v.702

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26