/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 221 by dpavlin, Mon Dec 5 17:48:23 2005 UTC revision 736 by dpavlin, Thu Oct 5 12:57:51 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.04;
11  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Input 0.13;
12  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Store 0.11;
13    use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.06;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    
25  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
26    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
27    
28  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
29    
30  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
31    
32  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
33    
34    Options:
35    
36    =over 4
37    
38    =item --offset 42
39    
40    start loading (all) databases at offset 42
41    
42    =item --limit 100
43    
44    limit loading to 100 records
45    
46    =item --clean
47    
48    remove database and Hyper Estraier index before indexing
49    
50    =item --only=database_name/input_filter
51    
52    reindex just single database (legacy name is --one)
53    
54    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
55    or C<type> from input
56    
57    =item --config conf/config.yml
58    
59    path to YAML configuration file
60    
61    =item --stats
62    
63    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
64    and subfield usage for each input
65    
66    =item --validate path/to/validation_file
67    
68    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
69    
70    =item --marc-normalize conf/normalize/mapping.pl
71    
72    This option specifies normalisation file for MARC creation
73    
74    =item --marc-output out/marc/test.marc
75    
76    Optional path to output file
77    
78    =item --marc-lint
79    
80    By default turned on if C<--marc-normalize> is used. You can disable lint
81    messages with C<--no-marc-lint>.
82    
83    =item --marc-dump
84    
85    Force dump or input and marc record for debugging.
86    
87    =item --parallel 4
88    
89    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
90    machine if you want to use full load)
91    
92    =item --only-links
93    
94    Create just links
95    
96    =item --merge
97    
98    Create merged index of databases which have links
99    
100    =back
101    
102    =cut
103    
104    my $offset;
105    my $limit;
106    
107    my $clean = 0;
108    my $config_path;
109    my $debug = 0;
110    my $only_filter;
111    my $stats = 0;
112    my $validate_path;
113    my ($marc_normalize, $marc_output);
114    my $marc_lint = 1;
115    my $marc_dump = 0;
116    my $parallel = 0;
117    my $only_links = 0;
118    my $merge = 0;
119    
120    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
121    
122    GetOptions(
123            "limit=i" => \$limit,
124            "offset=i" => \$offset,
125            "clean" => \$clean,
126            "one=s" => \$only_filter,
127            "only=s" => \$only_filter,
128            "config" => \$config_path,
129            "debug+" => \$debug,
130            "stats" => \$stats,
131            "validate=s" => \$validate_path,
132            "marc-normalize=s" => \$marc_normalize,
133            "marc-output=s" => \$marc_output,
134            "marc-lint!" => \$marc_lint,
135            "marc-dump!" => \$marc_dump,
136            "parallel=i" => \$parallel,
137            "only-links!" => \$only_links,
138            "merge" => \$merge,
139    );
140    
141    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
142    
143    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
144    
145    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
146    
147    $log->info( "-" x 79 );
148    
149    
150    my $estcmd_fh;
151    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
152    if ($merge) {
153            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
154            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
155            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
156            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
157    }
158    
159    
160    my $validate;
161    $validate = new WebPAC::Validate(
162            path => $validate_path,
163    ) if ($validate_path);
164    
165    
166    my $use_indexer = $config->use_indexer;
167    if ($stats) {
168            $log->debug("option --stats disables update of indexing engine...");
169            $use_indexer = undef;
170    } else {
171            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
172    }
173    
174    # disable indexing when creating marc
175    $use_indexer = undef if ($marc_normalize);
176    
177    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
178    
179    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
180    
181  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
182    my $start_t = time();
183    
184  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
185    
186          my $type = lc($db_config->{input}->{type});  if ($parallel) {
187            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
188            Proc::Queue::size($parallel);
189    }
190    
191          die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');  sub create_ds_config {
192            my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
193            my $c = dclone( $db_config );
194            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
195            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
196            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
197            return $c;
198    }
199    
200          my $abs_path = abs_path($0);  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
         $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;  
201    
202          my $lookup = new WebPAC::Lookup(          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
203                  lookup_file => $db_config->{input}->{lookup},          next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
         );  
204    
205          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          if ($parallel) {
206                    my $f=fork;
207                    if(defined ($f) and $f==0) {
208                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
209                    } else {
210                            next;
211                    }
212            }
213    
214            my $indexer;
215            if ($use_indexer) {
216    
217          my $log = $lookup->_get_logger;                  my $cfg_name = $use_indexer;
218          $log->info("working on $database in $db_path");                  $cfg_name =~ s/\-.*$//;
219    
220          my $db = new WebPAC::Store(                  my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
221                  path => $db_path,                  $indexer_config->{database} = $database;
222                  database => $database,                  $indexer_config->{clean} = $clean;
223                  debug => 1,                  $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
224          );  
225                    # force clean if database has links
226                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
227    
228                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
229    
230                            # open Hyper Estraier database
231                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
232                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
233                    
234                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
235    
236                            # open Hyper Estraier database
237                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
238                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
239    
240                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
241    
242                            # open KinoSearch
243                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
244                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
245                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
246    
247                    } else {
248                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
249                    }
250    
251                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
252            }
253    
254    
255            #
256            # store Hyper Estraier links to other databases
257            #
258            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
259                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
260                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
261                                    if ($merge) {
262                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
263                                    } else {
264                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
265                                            push @links, sub {
266                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
267                                                    $indexer->add_link(
268                                                            from => $database,
269                                                            to => $link->{to},
270                                                            credit => $link->{credit},
271                                                    );
272                                            };
273                                    }
274                            } else {
275                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
276                            }
277                    }
278            }
279            next if ($only_links);
280    
281    
282            #
283            # now WebPAC::Store
284            #
285            my $abs_path = abs_path($0);
286            $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
287    
288          my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");          my $db_path = $config->webpac('db_path');
         $est_config->{database} = $database;  
289    
290          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");          if ($clean) {
291                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
292                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
293            } else {
294                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
295            }
296    
297          my $est = new WebPAC::Output::Estraier(          my $store = new WebPAC::Store(
298                  %{ $est_config },                  path => $db_path,
299                    debug => $debug,
300          );          );
301    
302    
303          #          #
304          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
305          #          #
# Line 67  while (my ($database, $db_config) = each Line 307  while (my ($database, $db_config) = each
307          my @inputs;          my @inputs;
308          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
309                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
310          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
311                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
312            } else {
313                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
314          }          }
315    
316          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
                 $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");  
317    
318                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
                         code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},  
                         limit_mfn => $input->{limit},  
                 );  
319    
320                  my $maxmfn = $isis->open(                  next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
321                          filename => $input->{path},  
322                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                  my $type = lc($input->{type});
323    
324                    die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
325    
326                    my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
327    
328                    my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
329    
330                    $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
331                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
332                  );                  );
333    
334                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  if ($stats) {
335                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          # disable modification of records if --stats is in use
336                          db => $db,                          delete($input->{modify_records});
337                          lookup_regex => $lookup->regex,                          delete($input->{modify_file});
338                          lookup => $lookup,                  }
339                          prefix => $input->{name},  
340                    my $input_db = new WebPAC::Input(
341                            module => $input_module,
342                            encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
343                            limit => $limit || $input->{limit},
344                            offset => $offset,
345                            recode => $input->{recode},
346                            stats => $stats,
347                            modify_records => $input->{modify_records},
348                            modify_file => $input->{modify_file},
349                  );                  );
350                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
351    
352                    if (defined( $input->{lookup} )) {
353                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
354                            delete( $input->{lookup} );
355                    }
356    
357                    my $lookup_coderef;
358    
359                    if (@lookups) {
360    
361                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
362    
363                            $lookup_coderef = sub {
364                                    my $rec = shift || die "need rec!";
365                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
366    
367                                    $store->save_row(
368                                            database => $database,
369                                            input => $input_name,
370                                            id => $mfn,
371                                            row => $rec,
372                                    );
373    
374                  $n->open(                                  WebPAC::Normalize::data_structure(
375                          tag => $input->{normalize}->{tag},                                          row => $rec,
376                          xml_file => $input->{normalize}->{path},                                          rules => $rules,
377                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
378                                    );
379    
380                                    #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
381                            };
382    
383                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
384    
385                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
386    
387                    };
388    
389                    my $lookup_jar;
390    
391                    my $maxmfn = $input_db->open(
392                            path => $input->{path},
393                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
394                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
395                            lookup => $lookup_jar,
396                            %{ $input },
397                  );                  );
398    
399                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
400    
401                    if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
402                            $log->debug("created following lookups: ", dump( $lookup_data ));
403    
404                            foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
405                                    $store->save_lookup(
406                                            database => $database,
407                                            input => $input_name,
408                                            key => $key,
409                                            data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
410                                    );
411                            }
412                    }
413    
414                          my $row = $isis->fetch || next;                  my $report_fh;
415                    if ($stats || $validate) {
416                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
417                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
418    
419                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
420                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
421                            $log->info("Generating report file $path");
422                    }
423    
424                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                  my $marc;
425                    if ($marc_normalize) {
426                            $marc = new WebPAC::Output::MARC(
427                                    path => $marc_output || "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
428                                    lint => $marc_lint,
429                                    dump => $marc_dump,
430                            );
431                    }
432    
433                          my $ds = $n->data_structure($row);                  my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
434                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
435    
436                          $est->add(                  # reset position in database
437                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                  $input_db->seek(1);
438                                  ds => $ds,  
439                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},                  # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
440                    my $indexer_config = $use_indexer;
441                    $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
442    
443                    my $lookup_hash;
444                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
445            
446                    if ($depends) {
447                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
448                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
449    
450                            foreach my $db (keys %$depends) {
451                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
452                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
453                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
454                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
455                                                            database => $db,
456                                                            input => $i,
457                                                            key => $k,
458                                                    );
459                                            }
460                                    }
461                            }
462    
463                            $log->debug("lookup_hash = ", dump( $lookup_hash ));
464                    }
465    
466    
467                    foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
468    
469                            my $row = $input_db->fetch || next;
470    
471                            my $mfn = $row->{'000'}->[0];
472    
473                            if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
474                                    $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
475                                    $mfn = $pos;
476                                    push @{ $row->{'000'} }, $pos;
477                            }
478    
479    
480                            if ($validate) {
481                                    if ( my $errors = $validate->validate_errors( $row, $input_db->dump ) ) {
482                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
483                                                    $validate->report_error( $errors )
484                                            );
485                                    }
486                            }
487    
488                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
489                                    row => $row,
490                                    rules => $rules,
491                                    lookup => $lookup_hash,
492                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
493                                    marc_encoding => 'utf-8',
494                                    load_row_coderef => sub {
495                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
496                                            return $store->load_row(
497                                                    database => $database,
498                                                    input => $input,
499                                                    id => $mfn,
500                                            );
501                                    },
502                          );                          );
503    
504                            $log->debug("ds = ",dump($ds));
505    
506                            $store->save_ds(
507                                    database => $database,
508                                    input => $input_name,
509                                    id => $mfn,
510                                    ds => $ds,
511                            ) if ($ds && !$stats);
512    
513                            $indexer->add(
514                                    id => "${input_name}/${mfn}",
515                                    ds => $ds,
516                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
517                            ) if ($indexer && $ds);
518    
519                            if ($marc) {
520                                    my $i = 0;
521    
522                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
523                                            $marc->add(
524                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
525                                                    fields => $fields,
526                                                    leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
527                                                    row => $row,
528                                            );
529                                            $i++;
530                                    }
531    
532                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
533                            }
534    
535                          $total_rows++;                          $total_rows++;
536                  }                  }
537    
538          };                  if ($validate) {
539                            my $errors = $validate->report;
540                            if ($errors) {
541                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
542                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
543                            }
544                    }
545    
546                    if ($stats) {
547                            my $s = $input_db->stats;
548                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
549                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
550                    }
551    
552                    # close MARC file
553                    $marc->finish if ($marc);
554    
555                    # close report
556                    close($report_fh) if ($report_fh)
557    
558            }
559    
560            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
561    
562            my $dt = time() - $start_t;
563            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
564                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
565                            $dt, ($total_rows / $dt)
566                    )
567            );
568    
569    
570            # end forked process
571            if ($parallel) {
572                    $log->info("parallel process $$ finished");
573                    exit(0);
574            }
575    
         $log->info("$total_rows records indexed");  
576  }  }
577    
578    if ($parallel) {
579            # wait all children to finish
580            sleep(1) while wait != -1;
581            $log->info("all parallel processes finished");
582    }
583    
584    #
585    # handle links or merge after indexing
586    #
587    
588    if ($merge) {
589            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
590            close($estcmd_fh);
591            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
592            system $estcmd_path;
593    } else {
594            foreach my $link (@links) {
595                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
596                    $link->();
597            }
598    }

Legend:
Removed from v.221  
changed lines
  Added in v.736

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26