/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 217 by dpavlin, Mon Dec 5 17:47:51 2005 UTC revision 856 by dpavlin, Sun May 27 16:00:26 2007 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.08;
11  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Input 0.16;
12  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Store 0.14;
13    use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.11;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    use Pod::Usage qw/pod2usage/;
25    
26  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
27    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
28    
29  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
30    
31  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
32    
33  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
34    
35    =head1 OPTIONS
36    
37    =over 4
38    
39    =item --offset 42
40    
41    start loading (all) databases at offset 42
42    
43    =item --limit 100
44    
45    limit loading to 100 records
46    
47    =item --clean
48    
49    remove database and Hyper Estraier index before indexing
50    
51    =item --only=database_name/input_filter
52    
53    reindex just single database (legacy name is --one)
54    
55    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
56    or C<type> from input
57    
58    =item --config conf/config.yml
59    
60    path to YAML configuration file
61    
62    =item --stats
63    
64    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
65    and subfield usage for each input
66    
67    =item --validate path/to/validation_file
68    
69    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
70    
71    You can use special variables C<$database> and $C<$input> in this parametar
72    like C<--validate 'conf/validate/$database-$input'> to construct filename
73    
74    =item --validate-delimiters path/to/validate_delimiters_file
75    
76    this option is used with C<--validate> to turn on extra validation of
77    delimiters. If file is non existant, it will be created on first run.
78    
79    =item --marc-generate
80    
81    Generate MARC file. This will automatically be on if file contains C<marc*> directives.
82    You can use this option as C<--no-marc-generate> to disable MARC generation.
83    
84    =item --marc-lint
85    
86    By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
87    messages with C<--no-marc-lint>.
88    
89    =item --marc-dump
90    
91    Force dump or input and marc record for debugging.
92    
93    =item --parallel 4
94    
95    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
96    machine if you want to use full load)
97    
98    =item --only-links
99    
100    Create just links
101    
102    =item --merge
103    
104    Create merged index of databases which have links
105    
106    =back
107    
108    =cut
109    
110    my $offset;
111    my $limit;
112    
113    my $clean = 0;
114    my $config_path;
115    my $debug = 0;
116    my $only_filter;
117    my $stats = 0;
118    my $validate_path;
119    my $validate_delimiters_path;
120    my $marc_generate = 1;
121    my $marc_lint = 1;
122    my $marc_dump = 0;
123    my $parallel = 0;
124    my $only_links = 0;
125    my $merge = 0;
126    my $help;
127    
128    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
129    
130    GetOptions(
131            "limit=i" => \$limit,
132            "offset=i" => \$offset,
133            "clean" => \$clean,
134            "one=s" => \$only_filter,
135            "only=s" => \$only_filter,
136            "config" => \$config_path,
137            "debug+" => \$debug,
138            "stats" => \$stats,
139            "validate=s" => \$validate_path,
140            "validate-delimiters=s" => \$validate_delimiters_path,
141            "marc-generate!" => \$marc_generate,
142            "marc-lint!" => \$marc_lint,
143            "marc-dump!" => \$marc_dump,
144            "parallel=i" => \$parallel,
145            "only-links!" => \$only_links,
146            "merge" => \$merge,
147            "help" => \$help,
148    );
149    
150    $marc_generate = 0 if ( $validate_delimiters_path );
151    
152    pod2usage(-verbose => 2) if ($help);
153    
154    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
155    
156    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
157    
158    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
159    
160    $log->info( "-" x 79 );
161    
162    my $log_file = 'log';
163    
164    if (-e $log_file ) {    # && -s $log_file > 5 * 1024 * 1024) {
165            $log->info("moved old log with ", -s $log_file, " bytes to '${log_file}.old'");
166            rename $log_file, "${log_file}.old" || $log->logwarn("can't rename $log_file to ${log_file}.old: $!");
167    }
168    
169    my $estcmd_fh;
170    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
171    if ($merge) {
172            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
173            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
174            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
175            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
176    }
177    
178    my $validate;
179    $validate = new WebPAC::Validate(
180            path => $validate_path,
181            delimiters => $config->webpac('delimiters'),
182            delimiters_path => $validate_delimiters_path,
183    ) if ($validate_path || $validate_delimiters_path);
184    
185    my $use_indexer = $config->use_indexer;
186    $stats ||= $validate;
187    if ($stats) {
188            $log->debug("disabled indexing for stats collection");
189            $use_indexer = undef;
190    } else {
191            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
192    }
193    
194    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
195    
196    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
197    
198  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
199    my $start_t = time();
200    
201  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
202    
203          my $type = lc($db_config->{input}->{type});  if ($parallel) {
204            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
205            Proc::Queue::size($parallel);
206    }
207    
208          die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');  sub create_ds_config {
209            my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
210            my $c = dclone( $db_config );
211            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
212            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
213            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
214            return $c;
215    }
216    
217          my $abs_path = abs_path($0);  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
         $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;  
218    
219          my $lookup = new WebPAC::Lookup(          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
220                  lookup_file => $db_config->{input}->{lookup},          next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
         );  
221    
222          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          if ($parallel) {
223                    my $f=fork;
224                    if(defined ($f) and $f==0) {
225                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
226                    } else {
227                            next;
228                    }
229            }
230    
231            my $indexer;
232            if ($use_indexer && $parser->have_rules( 'search', $database )) {
233    
234          my $log = $lookup->_get_logger;                  my $cfg_name = $use_indexer;
235          $log->info("working on $database in $db_path");                  $cfg_name =~ s/\-.*$//;
236    
237          my $db = new WebPAC::Store(                  my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
238                  path => $db_path,                  $indexer_config->{database} = $database;
239                  database => $database,                  $indexer_config->{clean} = $clean;
240          );                  $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
241    
242                    # force clean if database has links
243                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
244    
245                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
246    
247          my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");                          # open Hyper Estraier database
248          $est_config->{database} = $database;                          use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
249                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
250                    
251                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
252    
253          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");                          # open Hyper Estraier database
254                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
255                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
256    
257          my $est = new WebPAC::Output::Estraier(                  } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
258                  %{ $est_config },  
259                            # open KinoSearch
260                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
261                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
262                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
263    
264                    } else {
265                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
266                    }
267    
268                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
269            }
270    
271    
272            #
273            # store Hyper Estraier links to other databases
274            #
275            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
276                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
277                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
278                                    if ($merge) {
279                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
280                                    } else {
281                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
282                                            push @links, sub {
283                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
284                                                    $indexer->add_link(
285                                                            from => $database,
286                                                            to => $link->{to},
287                                                            credit => $link->{credit},
288                                                    );
289                                            };
290                                    }
291                            } else {
292                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
293                            }
294                    }
295            }
296            next if ($only_links);
297    
298    
299            #
300            # now WebPAC::Store
301            #
302            my $abs_path = abs_path($0);
303            $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
304    
305            my $db_path = $config->webpac('db_path');
306    
307            if ($clean) {
308                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
309                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
310            } else {
311                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
312            }
313    
314            my $store = new WebPAC::Store(
315                    path => $db_path,
316                    debug => $debug,
317          );          );
318    
319    
320          #          #
321          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
322          #          #
# Line 66  while (my ($database, $db_config) = each Line 324  while (my ($database, $db_config) = each
324          my @inputs;          my @inputs;
325          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
326                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
327          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
328                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
329            } else {
330                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
331          }          }
332    
333          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
                 $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");  
334    
335                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
                         code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},  
                         limit_mfn => $input->{limit},  
                 );  
336    
337                  my $maxmfn = $isis->open(                  next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
338                          filename => $input->{path},  
339                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                  my $type = lc($input->{type});
340    
341                    die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
342    
343                    my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
344    
345                    my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
346    
347                    $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
348                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
349                  );                  );
350    
351                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  if ($stats) {
352                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          # disable modification of records if --stats is in use
353                          db => $db,                          delete($input->{modify_records});
354                          lookup_regex => $lookup->regex,                          delete($input->{modify_file});
355                          lookup => $lookup,                  }
356    
357                    my $input_db = new WebPAC::Input(
358                            module => $input_module,
359                            encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
360                            limit => $limit || $input->{limit},
361                            offset => $offset,
362                            recode => $input->{recode},
363                            stats => $stats,
364                            modify_records => $input->{modify_records},
365                            modify_file => $input->{modify_file},
366                  );                  );
367                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
368    
369                    if (defined( $input->{lookup} )) {
370                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
371                            delete( $input->{lookup} );
372                    }
373    
374                    my $lookup_coderef;
375    
376                    if (@lookups) {
377    
378                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
379    
380                            $lookup_coderef = sub {
381                                    my $rec = shift || die "need rec!";
382                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
383    
384                                    WebPAC::Normalize::data_structure(
385                                            row => $rec,
386                                            rules => $rules,
387                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
388                                    );
389    
390                                    #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
391                            };
392    
393                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
394    
395                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
396    
397                    };
398    
399                    my $lookup_jar;
400    
401                    my $maxmfn = $input_db->open(
402                            path => $input->{path},
403                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
404                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
405                            lookup => $lookup_jar,
406                            %{ $input },
407                            load_row => sub {
408                                    my $a = shift;
409                                    return $store->load_row(
410                                            database => $database,
411                                            input => $input_name,
412                                            id => $a->{id},
413                                    );
414                            },
415                            save_row => sub {
416                                    my $a = shift;
417                                    return $store->save_row(
418                                            database => $database,
419                                            input => $input_name,
420                                            id => $a->{id},
421                                            row => $a->{row},
422                                    );
423                            },
424    
                 $n->open(  
                         tag => $input->{normalize}->{tag},  
                         xml_file => $input->{normalize}->{path},  
425                  );                  );
426    
427                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
428    
429                          my $row = $isis->fetch || next;                  if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
430                            $log->debug("created following lookups: ", sub { dump( $lookup_data ) } );
431    
432                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                          foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
433                                    $store->save_lookup(
434                                            database => $database,
435                                            input => $input_name,
436                                            key => $key,
437                                            data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
438                                    );
439                            }
440                    }
441    
442                          my $ds = $n->data_structure($row);                  my $report_fh;
443                    if ($stats || $validate) {
444                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
445                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
446    
447                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
448                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
449                            $log->info("Generating report file $path");
450                    }
451    
452                          $est->add(                  my $marc;
453                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                  if ($marc_generate && $parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
454                                  ds => $ds,                          $marc = new WebPAC::Output::MARC(
455                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},                                  path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
456                                    lint => $marc_lint,
457                                    dump => $marc_dump,
458                          );                          );
459                    }
460    
461                    my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
462                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
463    
464                    # reset position in database
465                    $input_db->seek(1);
466    
467                    # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
468                    my $indexer_config = $use_indexer;
469                    $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
470    
471                    my $lookup_hash;
472                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
473            
474                    if ($depends) {
475                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
476                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
477    
478                            foreach my $db (keys %$depends) {
479                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
480                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
481                                                    my $t = time();
482                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
483                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
484                                                            database => $db,
485                                                            input => $i,
486                                                            key => $k,
487                                                    );
488                                                    $log->debug(sprintf("lookup $db/$i took %.2fs", time() - $t));
489                                            }
490                                    }
491                            }
492    
493                            $log->debug("lookup_hash = ", sub { dump( $lookup_hash ) });
494                    }
495    
496    
497                    foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
498    
499                            my $row = $input_db->fetch || next;
500    
501                          $total_rows++;                          $total_rows++;
502    
503                            my $mfn = $row->{'000'}->[0];
504    
505                            if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
506                                    $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
507                                    $mfn = $pos;
508                                    push @{ $row->{'000'} }, $pos;
509                            }
510    
511    
512                            if ($validate) {
513                                    if ( my $errors = $validate->validate_rec( $row, $input_db->dump_ascii ) ) {
514                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
515                                                    $validate->report_error( $errors )
516                                            );
517                                    }
518                                    next;   # validation doesn't create any output
519                            }
520    
521                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
522                                    row => $row,
523                                    rules => $rules,
524                                    lookup => $lookup_hash,
525                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
526                                    marc_encoding => 'utf-8',
527                                    load_row_coderef => sub {
528                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
529                                            return $store->load_row(
530                                                    database => $database,
531                                                    input => $input,
532                                                    id => $mfn,
533                                            );
534                                    },
535                            );
536    
537                            $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
538    
539                            $store->save_ds(
540                                    database => $database,
541                                    input => $input_name,
542                                    id => $mfn,
543                                    ds => $ds,
544                            ) if ($ds && !$stats);
545    
546                            $indexer->add(
547                                    id => "${input_name}/${mfn}",
548                                    ds => $ds,
549                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
550                            ) if ($indexer && $ds);
551    
552                            if ($marc) {
553                                    my $i = 0;
554    
555                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
556                                            $marc->add(
557                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
558                                                    fields => $fields,
559                                                    leader => WebPAC::Normalize::_get_marc_leader(),
560                                                    row => $row,
561                                            );
562                                            $i++;
563                                    }
564    
565                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
566                            }
567                  }                  }
568    
569          };                  if ($validate) {
570                            my $errors = $validate->report;
571                            if ($errors) {
572                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
573                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
574                            }
575    
576                            print $report_fh "\nAll possible subfields/delimiter templates:\n", $validate->delimiters_templates( report => 1, current_input => 1 ), "\n\n";
577    
578                            # must be last thing that touches $validate for this input
579                            $validate->reset;
580                    }
581    
582                    if ($stats) {
583                            my $s = $input_db->stats;
584                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
585                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
586                    }
587    
588                    # close MARC file
589                    $marc->finish if ($marc);
590    
591                    # close report
592                    close($report_fh) if ($report_fh);
593            }
594    
595            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
596    
597            my $dt = time() - $start_t;
598            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
599                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
600                            $dt, ($total_rows / $dt)
601                    )
602            );
603    
604    
605            # end forked process
606            if ($parallel) {
607                    $log->info("parallel process $$ finished");
608                    exit(0);
609            }
610    
         $log->info("$total_rows records indexed");  
611  }  }
612    
613    if ($parallel) {
614            # wait all children to finish
615            sleep(1) while wait != -1;
616            $log->info("all parallel processes finished");
617    }
618    
619    # save new delimiters if needed
620    $validate->save_delimiters_templates if ( $validate );
621    
622    #
623    # handle links or merge after indexing
624    #
625    
626    if ($merge) {
627            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
628            close($estcmd_fh);
629            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
630            system $estcmd_path;
631    } else {
632            foreach my $link (@links) {
633                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
634                    $link->();
635            }
636    }

Legend:
Removed from v.217  
changed lines
  Added in v.856

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26