/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 214 by dpavlin, Mon Dec 5 17:47:29 2005 UTC revision 851 by dpavlin, Sun May 27 11:14:40 2007 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Parser 0.08;
11  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Input 0.16;
12  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Store 0.14;
13    use WebPAC::Normalize 0.22;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.11;
16  use YAML qw/LoadFile/;  use WebPAC::Output::MARC;
17  use LWP::Simple;  use WebPAC::Config;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    use Pod::Usage qw/pod2usage/;
25    
26  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
27    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
28    
29  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
30    
31  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
32    
33  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
34    
35    =head1 OPTIONS
36    
37    =over 4
38    
39    =item --offset 42
40    
41    start loading (all) databases at offset 42
42    
43    =item --limit 100
44    
45    limit loading to 100 records
46    
47    =item --clean
48    
49    remove database and Hyper Estraier index before indexing
50    
51    =item --only=database_name/input_filter
52    
53    reindex just single database (legacy name is --one)
54    
55    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
56    or C<type> from input
57    
58    =item --config conf/config.yml
59    
60    path to YAML configuration file
61    
62    =item --stats
63    
64    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
65    and subfield usage for each input
66    
67    =item --validate path/to/validation_file
68    
69    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
70    
71    =item --validate-delimiters path/to/validate_delimiters_file
72    
73    this option is used with C<--validate> to turn on extra validation of
74    delimiters. If file is non existant, it will be created on first run.
75    
76    =item --marc-generate
77    
78    Generate MARC file. This will automatically be on if file contains C<marc*> directives.
79    You can use this option as C<--no-marc-generate> to disable MARC generation.
80    
81    =item --marc-lint
82    
83    By default turned on if normalisation file has C<marc*> directives. You can disable lint
84    messages with C<--no-marc-lint>.
85    
86    =item --marc-dump
87    
88    Force dump or input and marc record for debugging.
89    
90    =item --parallel 4
91    
92    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
93    machine if you want to use full load)
94    
95    =item --only-links
96    
97    Create just links
98    
99    =item --merge
100    
101    Create merged index of databases which have links
102    
103    =back
104    
105    =cut
106    
107    my $offset;
108    my $limit;
109    
110    my $clean = 0;
111    my $config_path;
112    my $debug = 0;
113    my $only_filter;
114    my $stats = 0;
115    my $validate_path;
116    my $validate_delimiters_path;
117    my $marc_generate = 1;
118    my $marc_lint = 1;
119    my $marc_dump = 0;
120    my $parallel = 0;
121    my $only_links = 0;
122    my $merge = 0;
123    my $help;
124    
125    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
126    
127    GetOptions(
128            "limit=i" => \$limit,
129            "offset=i" => \$offset,
130            "clean" => \$clean,
131            "one=s" => \$only_filter,
132            "only=s" => \$only_filter,
133            "config" => \$config_path,
134            "debug+" => \$debug,
135            "stats" => \$stats,
136            "validate=s" => \$validate_path,
137            "validate-delimiters=s" => \$validate_delimiters_path,
138            "marc-generate!" => \$marc_generate,
139            "marc-lint!" => \$marc_lint,
140            "marc-dump!" => \$marc_dump,
141            "parallel=i" => \$parallel,
142            "only-links!" => \$only_links,
143            "merge" => \$merge,
144            "help" => \$help,
145    );
146    
147    $marc_generate = 0 if ( $validate_delimiters_path );
148    
149    pod2usage(-verbose => 2) if ($help);
150    
151    my $config = new WebPAC::Config( path => $config_path );
152    
153    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
154    
155    die "no databases in config file!\n" unless ($config->databases);
156    
157    $log->info( "-" x 79 );
158    
159    my $log_file = 'log';
160    
161    if (-e $log_file ) {    # && -s $log_file > 5 * 1024 * 1024) {
162            $log->info("moved old log with ", -s $log_file, " bytes to '${log_file}.old'");
163            rename $log_file, "${log_file}.old" || $log->logwarn("can't rename $log_file to ${log_file}.old: $!");
164    }
165    
166    my $estcmd_fh;
167    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
168    if ($merge) {
169            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
170            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
171            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
172            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
173    }
174    
175    my $validate;
176    $validate = new WebPAC::Validate(
177            path => $validate_path,
178            delimiters => $config->webpac('delimiters'),
179            delimiters_path => $validate_delimiters_path,
180    ) if ($validate_path || $validate_delimiters_path);
181    
182    my $use_indexer = $config->use_indexer;
183    $stats ||= $validate;
184    if ($stats) {
185            $log->debug("disabled indexing for stats collection");
186            $use_indexer = undef;
187    } else {
188            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
189    }
190    
191    # parse normalize files and create source files for lookup and normalization
192    
193    my $parser = new WebPAC::Parser( config => $config );
194    
195  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
196    my $start_t = time();
197    
198  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  my @links;
199    
200          my $type = lc($db_config->{input}->{type});  if ($parallel) {
201            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
202            Proc::Queue::size($parallel);
203    }
204    
205          die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');  sub create_ds_config {
206            my ($db_config, $database, $input, $mfn) = @_;
207            my $c = dclone( $db_config );
208            $c->{_} = $database || $log->logconfess("need database");
209            $c->{_mfn} = $mfn || $log->logconfess("need mfn");
210            $c->{input} = $input || $log->logconfess("need input");
211            return $c;
212    }
213    
214          my $abs_path = abs_path($0);  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->databases }) {
         $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;  
215    
216          my $lookup = new WebPAC::Lookup(          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
217                  lookup_file => $db_config->{input}->{lookup},          next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
218          );  
219            if ($parallel) {
220                    my $f=fork;
221                    if(defined ($f) and $f==0) {
222                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
223                    } else {
224                            next;
225                    }
226            }
227    
228          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          my $indexer;
229            if ($use_indexer && $parser->have_rules( 'search', $database )) {
230    
231                    my $cfg_name = $use_indexer;
232                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
233    
234          my $log = $lookup->_get_logger;                  my $indexer_config = $config->get( $cfg_name ) || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
235          $log->info("working on $database in $db_path");                  $indexer_config->{database} = $database;
236                    $indexer_config->{clean} = $clean;
237                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
238    
239          my $db = new WebPAC::Store(                  # force clean if database has links
240                  path => $db_path,                  $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
241          );  
242                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
243    
244                            # open Hyper Estraier database
245                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
246                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
247                    
248                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
249    
250                            # open Hyper Estraier database
251                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
252                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
253    
254                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
255    
256                            # open KinoSearch
257                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
258                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
259                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
260    
261                    } else {
262                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
263                    }
264    
265                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
266            }
267    
268    
269            #
270            # store Hyper Estraier links to other databases
271            #
272            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
273                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
274                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
275                                    if ($merge) {
276                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
277                                    } else {
278                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
279                                            push @links, sub {
280                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
281                                                    $indexer->add_link(
282                                                            from => $database,
283                                                            to => $link->{to},
284                                                            credit => $link->{credit},
285                                                    );
286                                            };
287                                    }
288                            } else {
289                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
290                            }
291                    }
292            }
293            next if ($only_links);
294    
         my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");  
         $est_config->{database} = $database;  
295    
296          $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");          #
297            # now WebPAC::Store
298            #
299            my $abs_path = abs_path($0);
300            $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
301    
302            my $db_path = $config->webpac('db_path');
303    
304          my $est = new WebPAC::Output::Estraier(          if ($clean) {
305                  %{ $est_config },                  $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
306                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
307            } else {
308                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
309            }
310    
311            my $store = new WebPAC::Store(
312                    path => $db_path,
313                    debug => $debug,
314          );          );
315    
316    
317          #          #
318          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
319          #          #
# Line 65  while (my ($database, $db_config) = each Line 321  while (my ($database, $db_config) = each
321          my @inputs;          my @inputs;
322          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
323                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
324          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
325                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
326            } else {
327                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
328          }          }
329    
330          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
                 $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");  
331    
332                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  my $input_name = $input->{name} || $log->logdie("input without a name isn't valid: ",dump($input));
                         code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},  
                         limit_mfn => $input->{limit},  
                 );  
333    
334                  my $maxmfn = $isis->open(                  next if ($only_input && ($input_name !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
335                          filename => $input->{path},  
336                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                  my $type = lc($input->{type});
337    
338                    die "I know only how to handle input types ", join(",", $config->webpac('inputs') ), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, $config->webpac('inputs')));
339    
340                    my $input_module = $config->webpac('inputs')->{$type};
341    
342                    my @lookups = $parser->have_lookup_create($database, $input);
343    
344                    $log->info("working on input '$input_name' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
345                            @lookups ? " creating lookups: ".join(", ", @lookups) : ""
346                  );                  );
347    
348                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  if ($stats) {
349                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          # disable modification of records if --stats is in use
350                          db => $db,                          delete($input->{modify_records});
351                          lookup_regex => $lookup->regex,                          delete($input->{modify_file});
352                          lookup => $lookup,                  }
353    
354                    my $input_db = new WebPAC::Input(
355                            module => $input_module,
356                            encoding => $config->webpac('webpac_encoding'),
357                            limit => $limit || $input->{limit},
358                            offset => $offset,
359                            recode => $input->{recode},
360                            stats => $stats,
361                            modify_records => $input->{modify_records},
362                            modify_file => $input->{modify_file},
363                  );                  );
364                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
365    
366                    if (defined( $input->{lookup} )) {
367                            $log->warn("$database/$input_name has depriciated lookup definition, removing it...");
368                            delete( $input->{lookup} );
369                    }
370    
371                    my $lookup_coderef;
372    
373                    if (@lookups) {
374    
375                            my $rules = $parser->lookup_create_rules($database, $input) || $log->logdie("no rules found for $database/$input");
376    
377                            $lookup_coderef = sub {
378                                    my $rec = shift || die "need rec!";
379                                    my $mfn = $rec->{'000'}->[0] || die "need mfn in 000";
380    
381                                    WebPAC::Normalize::data_structure(
382                                            row => $rec,
383                                            rules => $rules,
384                                            config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
385                                    );
386    
387                                    #warn "current lookup: ", dump(WebPAC::Normalize::_get_lookup());
388                            };
389    
390                            WebPAC::Normalize::_set_lookup( undef );
391    
392                            $log->debug("created lookup_coderef using:\n$rules");
393    
394                    };
395    
396                    my $lookup_jar;
397    
398                    my $maxmfn = $input_db->open(
399                            path => $input->{path},
400                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
401                            lookup_coderef => $lookup_coderef,
402                            lookup => $lookup_jar,
403                            %{ $input },
404                            load_row => sub {
405                                    my $a = shift;
406                                    return $store->load_row(
407                                            database => $database,
408                                            input => $input_name,
409                                            id => $a->{id},
410                                    );
411                            },
412                            save_row => sub {
413                                    my $a = shift;
414                                    return $store->save_row(
415                                            database => $database,
416                                            input => $input_name,
417                                            id => $a->{id},
418                                            row => $a->{row},
419                                    );
420                            },
421    
                 $n->open(  
                         tag => $input->{normalize}->{tag},  
                         xml_file => $input->{normalize}->{path},  
422                  );                  );
423    
424                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  my $lookup_data = WebPAC::Normalize::_get_lookup();
425    
426                          my $row = $isis->fetch || next;                  if (defined( $lookup_data->{$database}->{$input_name} )) {
427                            $log->debug("created following lookups: ", sub { dump( $lookup_data ) } );
428    
429                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                          foreach my $key (keys %{ $lookup_data->{$database}->{$input_name} }) {
430                                    $store->save_lookup(
431                                            database => $database,
432                                            input => $input_name,
433                                            key => $key,
434                                            data => $lookup_data->{$database}->{$input_name}->{$key},
435                                    );
436                            }
437                    }
438    
439                          my $ds = $n->data_structure($row);                  my $report_fh;
440                    if ($stats || $validate) {
441                            my $path = "out/report/${database}-${input_name}.txt";
442                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
443    
444                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input_name' records ",
445                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
446                            $log->info("Generating report file $path");
447                    }
448    
449                          $est->add(                  my $marc;
450                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,                  if ($marc_generate && $parser->have_rules( 'marc', $database, $input_name )) {
451                                  ds => $ds,                          $marc = new WebPAC::Output::MARC(
452                                  type => $config->{hyperestraier}->{type},                                  path => "out/marc/${database}-${input_name}.marc",
453                                    lint => $marc_lint,
454                                    dump => $marc_dump,
455                          );                          );
456                    }
457    
458                    my $rules = $parser->normalize_rules($database,$input_name) || $log->logdie("no normalize rules found for $database/$input_name");
459                    $log->debug("parsed normalize rules:\n$rules");
460    
461                    # reset position in database
462                    $input_db->seek(1);
463    
464                    # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
465                    my $indexer_config = $use_indexer;
466                    $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
467    
468                    my $lookup_hash;
469                    my $depends = $parser->depends($database,$input_name);
470            
471                    if ($depends) {
472                            $log->debug("$database/$input_name depends on: ", dump($depends)) if ($depends);
473                            $log->logdie("parser->depends didn't return HASH") unless (ref($depends) eq 'HASH');
474    
475                            foreach my $db (keys %$depends) {
476                                    foreach my $i (keys %{$depends->{$db}}) {
477                                            foreach my $k (keys %{$depends->{$db}->{$i}}) {
478                                                    my $t = time();
479                                                    $log->debug("loading lookup $db/$i");
480                                                    $lookup_hash->{$db}->{$i}->{$k} = $store->load_lookup(
481                                                            database => $db,
482                                                            input => $i,
483                                                            key => $k,
484                                                    );
485                                                    $log->debug(sprintf("lookup $db/$i took %.2fs", time() - $t));
486                                            }
487                                    }
488                            }
489    
490                            $log->debug("lookup_hash = ", sub { dump( $lookup_hash ) });
491                    }
492    
493    
494                    foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
495    
496                            my $row = $input_db->fetch || next;
497    
498                          $total_rows++;                          $total_rows++;
499    
500                            my $mfn = $row->{'000'}->[0];
501    
502                            if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
503                                    $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
504                                    $mfn = $pos;
505                                    push @{ $row->{'000'} }, $pos;
506                            }
507    
508    
509                            if ($validate) {
510                                    if ( my $errors = $validate->validate_rec( $row, $input_db->dump_ascii ) ) {
511                                            $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
512                                                    $validate->report_error( $errors )
513                                            );
514                                    }
515                                    next;   # validation doesn't create any output
516                            }
517    
518                            my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
519                                    row => $row,
520                                    rules => $rules,
521                                    lookup => $lookup_hash,
522                                    config => create_ds_config( $db_config, $database, $input, $mfn ),
523                                    marc_encoding => 'utf-8',
524                                    load_row_coderef => sub {
525                                            my ($database,$input,$mfn) = @_;
526                                            return $store->load_row(
527                                                    database => $database,
528                                                    input => $input,
529                                                    id => $mfn,
530                                            );
531                                    },
532                            );
533    
534                            $log->debug("ds = ", sub { dump($ds) }) if ($ds);
535    
536                            $store->save_ds(
537                                    database => $database,
538                                    input => $input_name,
539                                    id => $mfn,
540                                    ds => $ds,
541                            ) if ($ds && !$stats);
542    
543                            $indexer->add(
544                                    id => "${input_name}/${mfn}",
545                                    ds => $ds,
546                                    type => $config->get($indexer_config)->{type},
547                            ) if ($indexer && $ds);
548    
549                            if ($marc) {
550                                    my $i = 0;
551    
552                                    while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
553                                            $marc->add(
554                                                    id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
555                                                    fields => $fields,
556                                                    leader => WebPAC::Normalize::_get_marc_leader(),
557                                                    row => $row,
558                                            );
559                                            $i++;
560                                    }
561    
562                                    $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
563                            }
564                  }                  }
565    
566          };                  if ($validate) {
567                            my $errors = $validate->report;
568                            if ($errors) {
569                                    $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
570                                    print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
571                            }
572    
573                            print $report_fh "\nAll possible subfields/delimiter templates:\n", $validate->delimiters_templates( report => 1, current_input => 1 ), "\n\n";
574    
575                            # must be last thing that touches $validate for this input
576                            $validate->reset;
577                    }
578    
579                    if ($stats) {
580                            my $s = $input_db->stats;
581                            $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
582                            print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
583                    }
584    
585                    # close MARC file
586                    $marc->finish if ($marc);
587    
588                    # close report
589                    close($report_fh) if ($report_fh);
590            }
591    
592            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
593    
594            my $dt = time() - $start_t;
595            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
596                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
597                            $dt, ($total_rows / $dt)
598                    )
599            );
600    
601    
602            # end forked process
603            if ($parallel) {
604                    $log->info("parallel process $$ finished");
605                    exit(0);
606            }
607    
         $log->info("$total_rows records indexed");  
608  }  }
609    
610    if ($parallel) {
611            # wait all children to finish
612            sleep(1) while wait != -1;
613            $log->info("all parallel processes finished");
614    }
615    
616    # save new delimiters if needed
617    $validate->save_delimiters_templates if ( $validate );
618    
619    #
620    # handle links or merge after indexing
621    #
622    
623    if ($merge) {
624            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
625            close($estcmd_fh);
626            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
627            system $estcmd_path;
628    } else {
629            foreach my $link (@links) {
630                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
631                    $link->();
632            }
633    }

Legend:
Removed from v.214  
changed lines
  Added in v.851

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26