/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 214 by dpavlin, Mon Dec 5 17:47:29 2005 UTC revision 675 by dpavlin, Wed Sep 13 17:32:49 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Lookup 0.03;
11    use WebPAC::Input 0.11;
12  use WebPAC::Store 0.03;  use WebPAC::Store 0.03;
13  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Normalize 0.11;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier 0.02;  use WebPAC::Validate 0.06;
16    use WebPAC::Output::MARC;
17  use YAML qw/LoadFile/;  use YAML qw/LoadFile/;
18  use LWP::Simple;  use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    
25  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
26    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
27    
28  my $config = LoadFile('conf/config.yml');  =head1 NAME
29    
30  print "config = ",Dumper($config);  run.pl - start WebPAC indexing
31    
32    B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
33    
34    Options:
35    
36    =over 4
37    
38    =item --offset 42
39    
40    start loading (all) databases at offset 42
41    
42    =item --limit 100
43    
44    limit loading to 100 records
45    
46    =item --clean
47    
48    remove database and Hyper Estraier index before indexing
49    
50    =item --only=database_name/input_filter
51    
52    reindex just single database (legacy name is --one)
53    
54    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
55    or C<type> from input
56    
57    =item --config conf/config.yml
58    
59    path to YAML configuration file
60    
61    =item --stats
62    
63    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
64    and subfield usage for each input
65    
66    =item --validate path/to/validation_file
67    
68    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
69    
70    =item --marc-normalize conf/normalize/mapping.pl
71    
72    This option specifies normalisation file for MARC creation
73    
74    =item --marc-output out/marc/test.marc
75    
76    Optional path to output file
77    
78    =item --marc-lint
79    
80    By default turned on if C<--marc-normalize> is used. You can disable lint
81    messages with C<--no-marc-lint>.
82    
83    =item --marc-dump
84    
85    Force dump or input and marc record for debugging.
86    
87    =item --parallel 4
88    
89    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
90    machine if you want to use full load)
91    
92    =item --only-links
93    
94    Create just links
95    
96    =item --merge
97    
98    Create merged index of databases which have links
99    
100    =back
101    
102    =cut
103    
104    my $offset;
105    my $limit;
106    
107    my $clean = 0;
108    my $config = 'conf/config.yml';
109    my $debug = 0;
110    my $only_filter;
111    my $stats = 0;
112    my $validate_path;
113    my ($marc_normalize, $marc_output);
114    my $marc_lint = 1;
115    my $marc_dump = 0;
116    my $parallel = 0;
117    my $only_links = 0;
118    my $merge = 0;
119    
120    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
121    
122    my $hostname = `hostname`;
123    chomp($hostname);
124    $hostname =~ s/\..+$//;
125    if (-e "conf/$hostname.yml") {
126            $config = "conf/$hostname.yml";
127            $log->info("using host configuration file: $config");
128    }
129    
130    GetOptions(
131            "limit=i" => \$limit,
132            "offset=i" => \$offset,
133            "clean" => \$clean,
134            "one=s" => \$only_filter,
135            "only=s" => \$only_filter,
136            "config" => \$config,
137            "debug+" => \$debug,
138            "stats" => \$stats,
139            "validate=s" => \$validate_path,
140            "marc-normalize=s" => \$marc_normalize,
141            "marc-output=s" => \$marc_output,
142            "marc-lint!" => \$marc_lint,
143            "marc-dump!" => \$marc_dump,
144            "parallel=i" => \$parallel,
145            "only-links!" => \$only_links,
146            "merge" => \$merge,
147    );
148    
149    $config = LoadFile($config);
150    
151    #print "config = ",dump($config) if ($debug);
152    
153  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});
154    
155    $log->info( "-" x 79 );
156    
157    
158    my $estcmd_fh;
159    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
160    if ($merge) {
161            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
162            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
163            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
164            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
165    }
166    
167    
168    my $validate;
169    $validate = new WebPAC::Validate(
170            path => $validate_path,
171    ) if ($validate_path);
172    
173    
174    my $use_indexer = $config->{use_indexer} || 'hyperestraier';
175    if ($stats) {
176            $log->debug("option --stats disables update of indexing engine...");
177            $use_indexer = undef;
178    } else {
179            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
180    }
181    
182    # disable indexing when creating marc
183    $use_indexer = undef if ($marc_normalize);
184    
185  my $total_rows = 0;  my $total_rows = 0;
186    my $start_t = time();
187    
188    my @links;
189    
190    if ($parallel) {
191            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
192            Proc::Queue::size($parallel);
193    }
194    
195  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {  while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {
196    
197          my $type = lc($db_config->{input}->{type});          my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
198            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
199    
200            if ($parallel) {
201                    my $f=fork;
202                    if(defined ($f) and $f==0) {
203                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
204                    } else {
205                            next;
206                    }
207            }
208    
209            my $indexer;
210            if ($use_indexer) {
211    
212                    my $cfg_name = $use_indexer;
213                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
214    
215          die "I know only how to handle input type isis, not '$type'!\n" unless ($type eq 'isis');                  my $indexer_config = $config->{$cfg_name} || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
216                    $indexer_config->{database} = $database;
217                    $indexer_config->{clean} = $clean;
218                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
219    
220                    # force clean if database has links
221                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
222    
223                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
224    
225                            # open Hyper Estraier database
226                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
227                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
228                    
229                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
230    
231                            # open Hyper Estraier database
232                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
233                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
234    
235                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
236    
237                            # open KinoSearch
238                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
239                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
240                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
241    
242                    } else {
243                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
244                    }
245    
246                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
247            }
248    
249    
250            #
251            # store Hyper Estraier links to other databases
252            #
253            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
254                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
255                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
256                                    if ($merge) {
257                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
258                                    } else {
259                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
260                                            push @links, sub {
261                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
262                                                    $indexer->add_link(
263                                                            from => $database,
264                                                            to => $link->{to},
265                                                            credit => $link->{credit},
266                                                    );
267                                            };
268                                    }
269                            } else {
270                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
271                            }
272                    }
273            }
274            next if ($only_links);
275    
276    
277            #
278            # now WebPAC::Store
279            #
280          my $abs_path = abs_path($0);          my $abs_path = abs_path($0);
281          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;          $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
282    
         my $lookup = new WebPAC::Lookup(  
                 lookup_file => $db_config->{input}->{lookup},  
         );  
   
283          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;          my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;
284    
285            if ($clean) {
286          my $log = $lookup->_get_logger;                  $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
287          $log->info("working on $database in $db_path");                  rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
288            } else {
289                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
290            }
291    
292          my $db = new WebPAC::Store(          my $db = new WebPAC::Store(
293                  path => $db_path,                  path => $db_path,
294                    database => $database,
295                    debug => $debug,
296          );          );
297    
         my $est_config = $config->{hyperestraier} || $log->logdie("can't find 'hyperestraier' part in confguration");  
         $est_config->{database} = $database;  
   
         $log->info("using HyperEstraier URL $est_config->{masterurl}");  
   
         my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  
                 %{ $est_config },  
         );  
298    
299          #          #
300          # now, iterate through input formats          # now, iterate through input formats
# Line 65  while (my ($database, $db_config) = each Line 303  while (my ($database, $db_config) = each
303          my @inputs;          my @inputs;
304          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {          if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
305                  @inputs = @{ $db_config->{input} };                  @inputs = @{ $db_config->{input} };
306          } else {          } elsif ($db_config->{input}) {
307                  push @inputs, $db_config->{input};                  push @inputs, $db_config->{input};
308            } else {
309                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
310          }          }
311    
312            my @supported_inputs = keys %{ $config->{webpac}->{inputs} };
313    
314          foreach my $input (@inputs) {          foreach my $input (@inputs) {
                 $log->info("working on input $input->{path} [$input->{type}]");  
315    
316                  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(                  next if ($only_input && ($input->{name} !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
                         code_page => $config->{webpac}->{webpac_encoding},  
                         limit_mfn => $input->{limit},  
                 );  
317    
318                  my $maxmfn = $isis->open(                  my $type = lc($input->{type});
319                          filename => $input->{path},  
320                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding                  die "I know only how to handle input types ", join(",", @supported_inputs), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, @supported_inputs));
321    
322                    my $lookup;
323                    if ($input->{lookup}) {
324                            $lookup = new WebPAC::Lookup(
325                                    lookup_file => $input->{lookup},
326                            );
327                            delete( $input->{lookup} );
328                    }
329    
330                    my $input_module = $config->{webpac}->{inputs}->{$type};
331    
332                    $log->info("working on input '$input->{name}' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
333                            $input->{lookup} ? "lookup '$input->{lookup}'" : ""
334                  );                  );
335    
336                  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(                  if ($stats) {
337                  #       filter => { 'foo' => sub { shift } },                          # disable modification of records if --stats is in use
338                          db => $db,                          delete($input->{modify_records});
339                          lookup_regex => $lookup->regex,                          delete($input->{modify_file});
340                          lookup => $lookup,                  }
341    
342                    my $input_db = new WebPAC::Input(
343                            module => $input_module,
344                            encoding => $config->{webpac}->{webpac_encoding},
345                            limit => $limit || $input->{limit},
346                            offset => $offset,
347                            lookup_coderef => sub {
348                                    my $rec = shift || return;
349                                    $lookup->add( $rec );
350                            },
351                            recode => $input->{recode},
352                            stats => $stats,
353                            modify_records => $input->{modify_records},
354                            modify_file => $input->{modify_file},
355                  );                  );
356                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
357    
358                  $n->open(                  my $maxmfn = $input_db->open(
359                          tag => $input->{normalize}->{tag},                          path => $input->{path},
360                          xml_file => $input->{normalize}->{path},                          code_page => $input->{encoding},        # database encoding
361                            %{ $input },
362                  );                  );
363    
364                  for ( 0 ... $isis->size ) {                  my $report_fh;
365                    if ($stats || $validate) {
366                            my $path = "out/report/" . $database . '-' . $input->{name} . '.txt';
367                            open($report_fh, '>', $path) || $log->logdie("can't open $path: $!");
368    
369                            print $report_fh "Report for database '$database' input '$input->{name}' records ",
370                                    $offset || 1, "-", $limit || $input->{limit} || $maxmfn, "\n\n";
371                            $log->info("Generating report file $path");
372                    }
373    
374                          my $row = $isis->fetch || next;                  my @norm_array = ref($input->{normalize}) eq 'ARRAY' ?
375                            @{ $input->{normalize} } : ( $input->{normalize} );
376    
377                          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";                  if ($marc_normalize) {
378                            @norm_array = ( {
379                                    path => $marc_normalize,
380                                    output => $marc_output || 'out/marc/' . $database . '-' . $input->{name} . '.marc',
381                            } );
382                    }
383    
384                          my $ds = $n->data_structure($row);                  foreach my $normalize (@norm_array) {
385    
386                          $est->add(                          my $normalize_path = $normalize->{path} || $log->logdie("can't find normalize path in config");
387                                  id => $input->{name} . "#" . $mfn,  
388                                  ds => $ds,                          $log->logdie("Found '$normalize_path' as normalization file which isn't supported any more!") unless ( $normalize_path =~ m!\.pl$!i );
                                 type => $config->{hyperestraier}->{type},  
                         );  
389    
390                          $total_rows++;                          my $rules = read_file( $normalize_path ) or die "can't open $normalize_path: $!";
391    
392                            $log->info("Using $normalize_path for normalization...");
393    
394                            my $marc = new WebPAC::Output::MARC(
395                                    path => $normalize->{output},
396                                    lint => $marc_lint,
397                                    dump => $marc_dump,
398                            ) if ($normalize->{output});
399    
400                            # reset position in database
401                            $input_db->seek(1);
402    
403                            # generate name of config key for indexer (strip everything after -)
404                            my $indexer_config = $use_indexer;
405                            $indexer_config =~ s/^(\w+)-?.*$/$1/g if ($indexer_config);
406    
407                            foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
408    
409                                    my $row = $input_db->fetch || next;
410    
411                                    my $mfn = $row->{'000'}->[0];
412    
413                                    if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
414                                            $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
415                                            $mfn = $pos;
416                                            push @{ $row->{'000'} }, $pos;
417                                    }
418    
419    
420                                    if ($validate) {
421                                            if ( my $errors = $validate->validate_errors( $row, $input_db->dump ) ) {
422                                                    $log->error( "MFN $mfn validation error:\n",
423                                                            $validate->report_error( $errors )
424                                                    );
425                                            }
426                                    }
427    
428                                    my $ds_config = dclone($db_config);
429    
430                                    # default values -> database key
431                                    $ds_config->{_} = $database;
432    
433                                    # current mfn
434                                    $ds_config->{_mfn} = $mfn;
435    
436                                    # attach current input
437                                    $ds_config->{input} = $input;
438    
439                                    my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
440                                            row => $row,
441                                            rules => $rules,
442                                            lookup => $lookup ? $lookup->lookup_hash : undef,
443                                            config => $ds_config,
444                                            marc_encoding => 'utf-8',
445                                    );
446    
447                                    $db->save_ds(
448                                            id => $mfn,
449                                            ds => $ds,
450                                            prefix => $input->{name},
451                                    ) if ($ds && !$stats);
452    
453                                    $indexer->add(
454                                            id => $input->{name} . "/" . $mfn,
455                                            ds => $ds,
456                                            type => $config->{$indexer_config}->{type},
457                                    ) if ($indexer && $ds);
458    
459                                    if ($marc) {
460                                            my $i = 0;
461    
462                                            while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
463                                                    $marc->add(
464                                                            id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
465                                                            fields => $fields,
466                                                            leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
467                                                            row => $row,
468                                                    );
469                                                    $i++;
470                                            }
471    
472                                            $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
473                                    }
474    
475                                    $total_rows++;
476                            }
477    
478                            if ($validate) {
479                                    my $errors = $validate->report;
480                                    if ($errors) {
481                                            $log->info("validation errors:\n$errors\n" );
482                                            print $report_fh "$errors\n" if ($report_fh);
483                                    }
484                            }
485    
486                            if ($stats) {
487                                    my $s = $input_db->stats;
488                                    $log->info("statistics of fields usage:\n$s");
489                                    print $report_fh "Statistics of fields usage:\n$s" if ($report_fh);
490                            }
491    
492                            # close MARC file
493                            $marc->finish if ($marc);
494    
495                            # close report
496                            close($report_fh) if ($report_fh)
497                  }                  }
498    
499          };          }
500    
501            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
502    
503            my $dt = time() - $start_t;
504            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
505                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
506                            $dt, ($total_rows / $dt)
507                    )
508            );
509    
510    
511            # end forked process
512            if ($parallel) {
513                    $log->info("parallel process $$ finished");
514                    exit(0);
515            }
516    
         $log->info("$total_rows records indexed");  
517  }  }
518    
519    if ($parallel) {
520            # wait all children to finish
521            sleep(1) while wait != -1;
522            $log->info("all parallel processes finished");
523    }
524    
525    #
526    # handle links or merge after indexing
527    #
528    
529    if ($merge) {
530            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
531            close($estcmd_fh);
532            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
533            system $estcmd_path;
534    } else {
535            foreach my $link (@links) {
536                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
537                    $link->();
538            }
539    }

Legend:
Removed from v.214  
changed lines
  Added in v.675

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26