/[webpac2]/trunk/run.pl
This is repository of my old source code which isn't updated any more. Go to git.rot13.org for current projects!
ViewVC logotype

Diff of /trunk/run.pl

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 127 by dpavlin, Thu Nov 24 11:47:29 2005 UTC revision 652 by dpavlin, Thu Sep 7 15:01:45 2006 UTC
# Line 4  use strict; Line 4  use strict;
4    
5  use Cwd qw/abs_path/;  use Cwd qw/abs_path/;
6  use File::Temp qw/tempdir/;  use File::Temp qw/tempdir/;
 use Data::Dumper;  
7  use lib './lib';  use lib './lib';
8    
9  use WebPAC::Lookup;  use WebPAC::Common 0.02;
10  use WebPAC::Input::ISIS;  use WebPAC::Lookup 0.03;
11  use WebPAC::DB 0.02;  use WebPAC::Input 0.11;
12  use WebPAC::Normalize::XML;  use WebPAC::Store 0.03;
13    use WebPAC::Normalize 0.11;
14  use WebPAC::Output::TT;  use WebPAC::Output::TT;
15  use WebPAC::Output::Estraier;  use WebPAC::Validate 0.06;
16    use WebPAC::Output::MARC;
17    use YAML qw/LoadFile/;
18    use Getopt::Long;
19    use File::Path;
20    use Time::HiRes qw/time/;
21    use File::Slurp;
22    use Data::Dump qw/dump/;
23    use Storable qw/dclone/;
24    
25  my $limit = shift @ARGV;  use Proc::Queue size => 1;
26    use POSIX ":sys_wait_h"; # imports WNOHANG
27    
28  my $abs_path = abs_path($0);  =head1 NAME
 $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;  
29    
30  my $isis_file = '/data/isis_data/ps/LIBRI/LIBRI';  run.pl - start WebPAC indexing
31    
32  my $lookup = new WebPAC::Lookup(  B<this command will probably go away. Don't get used to it!>
         lookup_file => "$abs_path/conf/lookup/isis.pm",  
 );  
33    
34  my $isis = new WebPAC::Input::ISIS(  Options:
         code_page => 'ISO-8859-2',      # application encoding  
         limit_mfn => $limit,  
 );  
35    
36  my $maxmfn = $isis->open(  =over 4
         filename => $isis_file,  
         code_page => '852',             # database encoding  
 );  
37    
38  my $path = './db/';  =item --offset 42
39    
40  my $db = new WebPAC::DB(  start loading (all) databases at offset 42
         path => $path,  
 );  
41    
42  my $n = new WebPAC::Normalize::XML(  =item --limit 100
 #       filter => { 'foo' => sub { shift } },  
         db => $db,  
         lookup_regex => $lookup->regex,  
         lookup => $lookup,  
 );  
43    
44  $n->open(  limit loading to 100 records
         tag => 'isis',  
         xml_file => "$abs_path/conf/normalize/isis_ffzg.xml",  
 );  
45    
46  my $out = new WebPAC::Output::TT(  =item --clean
47          include_path => "$abs_path/conf/output/tt",  
48          filters => { foo => sub { shift } },  remove database and Hyper Estraier index before indexing
49  );  
50    =item --only=database_name/input_filter
51    
52    reindex just single database (legacy name is --one)
53    
54    C</input_filter> is optional part which can be C<name>
55    or C<type> from input
56    
57    =item --config conf/config.yml
58    
59    path to YAML configuration file
60    
61    =item --stats
62    
63    disable indexing, modify_* in configuration and dump statistics about field
64    and subfield usage for each input
65    
66    =item --validate path/to/validation_file
67    
68    turn on extra validation of imput records, see L<WebPAC::Validation>
69    
70    =item --marc-normalize conf/normalize/mapping.pl
71    
72    This option specifies normalisation file for MARC creation
73    
74    =item --marc-output out/marc/test.marc
75    
76    Optional path to output file
77    
78    =item --marc-lint
79    
80    By default turned on if C<--marc-normalize> is used. You can disable lint
81    messages with C<--no-marc-lint>.
82    
83    =item --marc-dump
84    
85    Force dump or input and marc record for debugging.
86    
87    =item --parallel 4
88    
89    Run databases in parallel (aproximatly same as number of processors in
90    machine if you want to use full load)
91    
92  my $est = new WebPAC::Output::Estraier(  =item --only-links
93          url => 'http://localhost:1978/node/webpac2',  
94          user => 'admin',  Create just links
95          passwd => 'admin',  
96          database => 'ps',  =item --merge
97    
98    Create merged index of databases which have links
99    
100    =back
101    
102    =cut
103    
104    my $offset;
105    my $limit;
106    
107    my $clean = 0;
108    my $config = 'conf/config.yml';
109    my $debug = 0;
110    my $only_filter;
111    my $stats = 0;
112    my $validate_path;
113    my ($marc_normalize, $marc_output);
114    my $marc_lint = 1;
115    my $marc_dump = 0;
116    my $parallel = 0;
117    my $only_links = 0;
118    my $merge = 0;
119    
120    my $log = _new WebPAC::Common()->_get_logger();
121    
122    my $hostname = `hostname`;
123    chomp($hostname);
124    $hostname =~ s/\..+$//;
125    if (-e "conf/$hostname.yml") {
126            $config = "conf/$hostname.yml";
127            $log->info("using host configuration file: $config");
128    }
129    
130    GetOptions(
131            "limit=i" => \$limit,
132            "offset=i" => \$offset,
133            "clean" => \$clean,
134            "one=s" => \$only_filter,
135            "only=s" => \$only_filter,
136            "config" => \$config,
137            "debug+" => \$debug,
138            "stats" => \$stats,
139            "validate=s" => \$validate_path,
140            "marc-normalize=s" => \$marc_normalize,
141            "marc-output=s" => \$marc_output,
142            "marc-lint!" => \$marc_lint,
143            "marc-dump!" => \$marc_dump,
144            "parallel=i" => \$parallel,
145            "only-links!" => \$only_links,
146            "merge" => \$merge,
147  );  );
148    
149  my $total_rows = 0;  $config = LoadFile($config);
150    
151  for ( 0 ... $isis->size ) {  #print "config = ",dump($config) if ($debug);
152    
153          my $row = $isis->fetch || next;  die "no databases in config file!\n" unless ($config->{databases});
154    
155          my $mfn = $row->{'000'}->[0] || die "can't find MFN";  $log->info( "-" x 79 );
156    
         my $ds = $n->data_structure($row);  
157    
158  #       print STDERR Dumper($row, $ds);  my $estcmd_fh;
159    my $estcmd_path = './estcmd-merge.sh';
160    if ($merge) {
161            open($estcmd_fh, '>', $estcmd_path) || $log->logdie("can't open $estcmd_path: $!");
162            print $estcmd_fh 'cd /data/estraier/_node/ || exit 1',$/;
163            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier stop',$/;
164            $log->info("created merge batch file $estcmd_path");
165    }
166    
 #       my $html = $out->apply(  
 #               template => 'html_ffzg.tt',  
 #               data => $ds,  
 #       );  
 #  
 #       # create test output  
 #  
 #       my $file = sprintf('out/%02d.html', $mfn );  
 #       open(my $fh, '>', $file) or die "can't open $file: $!";  
 #       print $fh $html;  
 #       close($fh);  
 #  
 #       $html =~ s#\s*[\n\r]+\s*##gs;  
 #  
 #       print STDERR $html;  
167    
168          $est->add(  my $validate;
169                  id => $mfn,  $validate = new WebPAC::Validate(
170                  ds => $ds,          path => $validate_path,
171                  type => 'search',  ) if ($validate_path);
172    
173    
174    my $use_indexer = $config->{use_indexer} || 'hyperestraier';
175    if ($stats) {
176            $log->debug("option --stats disables update of indexing engine...");
177            $use_indexer = undef;
178    } else {
179            $log->info("using $use_indexer indexing engine...");
180    }
181    
182    # disable indexing when creating marc
183    $use_indexer = undef if ($marc_normalize);
184    
185    my $total_rows = 0;
186    my $start_t = time();
187    
188    my @links;
189    
190    if ($parallel) {
191            $log->info("Using $parallel processes for speedup");
192            Proc::Queue::size($parallel);
193    }
194    
195    while (my ($database, $db_config) = each %{ $config->{databases} }) {
196    
197            my ($only_database,$only_input) = split(m#/#, $only_filter) if ($only_filter);
198            next if ($only_database && $database !~ m/$only_database/i);
199    
200            if ($parallel) {
201                    my $f=fork;
202                    if(defined ($f) and $f==0) {
203                            $log->info("Created processes $$ for speedup");
204                    } else {
205                            next;
206                    }
207            }
208    
209            my $indexer;
210            if ($use_indexer) {
211    
212                    my $cfg_name = $use_indexer;
213                    $cfg_name =~ s/\-.*$//;
214    
215                    my $indexer_config = $config->{$cfg_name} || $log->logdie("can't find '$cfg_name' part in confguration");
216                    $indexer_config->{database} = $database;
217                    $indexer_config->{clean} = $clean;
218                    $indexer_config->{label} = $db_config->{name};
219    
220                    # force clean if database has links
221                    $indexer_config->{clean} = 1 if ($db_config->{links});
222    
223                    if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
224    
225                            # open Hyper Estraier database
226                            use WebPAC::Output::Estraier '0.10';
227                            $indexer = new WebPAC::Output::Estraier( %{ $indexer_config } );
228                    
229                    } elsif ($use_indexer eq 'hyperestraier-native') {
230    
231                            # open Hyper Estraier database
232                            use WebPAC::Output::EstraierNative;
233                            $indexer = new WebPAC::Output::EstraierNative( %{ $indexer_config } );
234    
235                            $use_indexer = 'hyperestraier';
236    
237                    } elsif ($use_indexer eq 'kinosearch') {
238    
239                            # open KinoSearch
240                            use WebPAC::Output::KinoSearch;
241                            $indexer_config->{clean} = 1 unless (-e $indexer_config->{index_path});
242                            $indexer = new WebPAC::Output::KinoSearch( %{ $indexer_config } );
243    
244                    } else {
245                            $log->logdie("unknown use_indexer: $use_indexer");
246                    }
247    
248                    $log->logide("can't continue without valid indexer") unless ($indexer);
249            }
250    
251    
252            #
253            # store Hyper Estraier links to other databases
254            #
255            if (ref($db_config->{links}) eq 'ARRAY' && $use_indexer) {
256                    foreach my $link (@{ $db_config->{links} }) {
257                            if ($use_indexer eq 'hyperestraier') {
258                                    if ($merge) {
259                                            print $estcmd_fh 'sudo -u www-data estcmd merge ' . $database . ' ' . $link->{to},$/;
260                                    } else {
261                                            $log->info("saving link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
262                                            push @links, sub {
263                                                    $log->info("adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
264                                                    $indexer->add_link(
265                                                            from => $database,
266                                                            to => $link->{to},
267                                                            credit => $link->{credit},
268                                                    );
269                                            };
270                                    }
271                            } else {
272                                    $log->warn("NOT IMPLEMENTED WITH $use_indexer: adding link $database -> $link->{to} [$link->{credit}]");
273                            }
274                    }
275            }
276            next if ($only_links);
277    
278    
279            #
280            # now WebPAC::Store
281            #
282            my $abs_path = abs_path($0);
283            $abs_path =~ s#/[^/]*$#/#;
284    
285            my $db_path = $config->{webpac}->{db_path} . '/' . $database;
286    
287            if ($clean) {
288                    $log->info("creating new database '$database' in $db_path");
289                    rmtree( $db_path ) || $log->warn("can't remove $db_path: $!");
290            } else {
291                    $log->info("working on database '$database' in $db_path");
292            }
293    
294            my $db = new WebPAC::Store(
295                    path => $db_path,
296                    database => $database,
297                    debug => $debug,
298            );
299    
300    
301            #
302            # now, iterate through input formats
303            #
304    
305            my @inputs;
306            if (ref($db_config->{input}) eq 'ARRAY') {
307                    @inputs = @{ $db_config->{input} };
308            } elsif ($db_config->{input}) {
309                    push @inputs, $db_config->{input};
310            } else {
311                    $log->info("database $database doesn't have inputs defined");
312            }
313    
314            my @supported_inputs = keys %{ $config->{webpac}->{inputs} };
315    
316            foreach my $input (@inputs) {
317    
318                    next if ($only_input && ($input->{name} !~ m#$only_input#i && $input->{type} !~ m#$only_input#i));
319    
320                    my $type = lc($input->{type});
321    
322                    die "I know only how to handle input types ", join(",", @supported_inputs), " not '$type'!\n" unless (grep(/$type/, @supported_inputs));
323    
324                    my $lookup;
325                    if ($input->{lookup}) {
326                            $lookup = new WebPAC::Lookup(
327                                    lookup_file => $input->{lookup},
328                            );
329                            delete( $input->{lookup} );
330                    }
331    
332                    my $input_module = $config->{webpac}->{inputs}->{$type};
333    
334                    $log->info("working on input '$input->{name}' in $input->{path} [type: $input->{type}] using $input_module",
335                            $input->{lookup} ? "lookup '$input->{lookup}'" : ""
336                    );
337    
338                    if ($stats) {
339                            # disable modification of records if --stats is in use
340                            delete($input->{modify_records});
341                            delete($input->{modify_file});
342                    }
343    
344                    my $input_db = new WebPAC::Input(
345                            module => $input_module,
346                            encoding => $config->{webpac}->{webpac_encoding},
347                            limit => $limit || $input->{limit},
348                            offset => $offset,
349                            lookup_coderef => sub {
350                                    my $rec = shift || return;
351                                    $lookup->add( $rec );
352                            },
353                            recode => $input->{recode},
354                            stats => $stats,
355                            modify_records => $input->{modify_records},
356                            modify_file => $input->{modify_file},
357                    );
358                    $log->logdie("can't create input using $input_module") unless ($input);
359    
360                    my $maxmfn = $input_db->open(
361                            path => $input->{path},
362                            code_page => $input->{encoding},        # database encoding
363                            %{ $input },
364                    );
365    
366                    my @norm_array = ref($input->{normalize}) eq 'ARRAY' ?
367                            @{ $input->{normalize} } : ( $input->{normalize} );
368    
369                    if ($marc_normalize) {
370                            @norm_array = ( {
371                                    path => $marc_normalize,
372                                    output => $marc_output || 'out/marc/' . $database . '-' . $input->{name} . '.marc',
373                            } );
374                    }
375    
376                    foreach my $normalize (@norm_array) {
377    
378                            my $normalize_path = $normalize->{path} || $log->logdie("can't find normalize path in config");
379    
380                            $log->logdie("Found '$normalize_path' as normalization file which isn't supported any more!") unless ( $normalize_path =~ m!\.pl$!i );
381    
382                            my $rules = read_file( $normalize_path ) or die "can't open $normalize_path: $!";
383    
384                            $log->info("Using $normalize_path for normalization...");
385    
386                            my $marc = new WebPAC::Output::MARC(
387                                    path => $normalize->{output},
388                                    lint => $marc_lint,
389                                    dump => $marc_dump,
390                            ) if ($normalize->{output});
391    
392                            # reset position in database
393                            $input_db->seek(1);
394    
395                            foreach my $pos ( 0 ... $input_db->size ) {
396    
397                                    my $row = $input_db->fetch || next;
398    
399                                    my $mfn = $row->{'000'}->[0];
400    
401                                    if (! $mfn || $mfn !~ m#^\d+$#) {
402                                            $log->warn("record $pos doesn't have valid MFN but '$mfn', using $pos");
403                                            $mfn = $pos;
404                                            push @{ $row->{'000'} }, $pos;
405                                    }
406    
407    
408                                    if ($validate) {
409                                            if ( my $errors = $validate->validate_errors( $row ) ) {
410                                                    my $dump_record = defined($errors->{dump}->{record});
411                                                    $log->error( "MFN $mfn\n",
412                                                            $dump_record ? $input_db->dump : '',
413                                                            "validation errors:\n", dump( $errors )
414                                                    );
415                                            }
416                                    }
417    
418                                    my $ds_config = dclone($db_config);
419    
420                                    # default values -> database key
421                                    $ds_config->{_} = $database;
422    
423                                    # current mfn
424                                    $ds_config->{_mfn} = $mfn;
425    
426                                    # attach current input
427                                    $ds_config->{input} = $input;
428    
429                                    my $ds = WebPAC::Normalize::data_structure(
430                                            row => $row,
431                                            rules => $rules,
432                                            lookup => $lookup ? $lookup->lookup_hash : undef,
433                                            config => $ds_config,
434                                            marc_encoding => 'utf-8',
435                                    );
436    
437                                    $db->save_ds(
438                                            id => $mfn,
439                                            ds => $ds,
440                                            prefix => $input->{name},
441                                    ) if ($ds && !$stats);
442    
443                                    $indexer->add(
444                                            id => $input->{name} . "/" . $mfn,
445                                            ds => $ds,
446                                            type => $config->{$use_indexer}->{type},
447                                    ) if ($indexer && $ds);
448    
449                                    if ($marc) {
450                                            my $i = 0;
451    
452                                            while (my $fields = WebPAC::Normalize::_get_marc_fields( fetch_next => 1 ) ) {
453                                                    $marc->add(
454                                                            id => $mfn . ( $i ? "/$i" : '' ),
455                                                            fields => $fields,
456                                                            leader => WebPAC::Normalize::marc_leader(),
457                                                            row => $row,
458                                                    );
459                                                    $i++;
460                                            }
461    
462                                            $log->info("Created $i instances of MFN $mfn\n") if ($i > 1);
463                                    }
464    
465                                    $total_rows++;
466                            }
467    
468                            $log->info("validation errors:\n", dump( $validate->{errors} ) ) if ($validate && defined($validate->{errors}));
469    
470                            $log->info("statistics of fields usage:\n", $input_db->stats) if ($stats);
471    
472                            # close MARC file
473                            $marc->finish if ($marc);
474    
475                    }
476    
477            }
478    
479            eval { $indexer->finish } if ($indexer && $indexer->can('finish'));
480    
481            my $dt = time() - $start_t;
482            $log->info("$total_rows records ", $indexer ? "indexed " : "",
483                    sprintf("in %.2f sec [%.2f rec/sec]",
484                            $dt, ($total_rows / $dt)
485                    )
486          );          );
487    
         $total_rows++;  
488    
489  };          # end forked process
490            if ($parallel) {
491                    $log->info("parallel process $$ finished");
492                    exit(0);
493            }
494    
495    }
496    
497    if ($parallel) {
498            # wait all children to finish
499            sleep(1) while wait != -1;
500            $log->info("all parallel processes finished");
501    }
502    
503  my $log = $lookup->_get_logger;  #
504    # handle links or merge after indexing
505    #
506    
507  $log->info("$total_rows records indexed");  if ($merge) {
508            print $estcmd_fh 'sudo /etc/init.d/hyperestraier start',$/;
509            close($estcmd_fh);
510            chmod 0700, $estcmd_path || $log->warn("can't chmod 0700 $estcmd_path: $!");
511            system $estcmd_path;
512    } else {
513            foreach my $link (@links) {
514                    $log->logdie("coderef in link ", Dumper($link), " is ", ref($link), " and not CODE") unless (ref($link) eq 'CODE');
515                    $link->();
516            }
517    }

Legend:
Removed from v.127  
changed lines
  Added in v.652

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26