/[webpac2]/trunk/lib/WebPAC/Input.pm
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Diff of /trunk/lib/WebPAC/Input.pm

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revision 6 by dpavlin, Sat Jul 16 14:44:38 2005 UTC revision 613 by dpavlin, Wed Aug 23 11:04:32 2006 UTC
# Line 3  package WebPAC::Input; Line 3  package WebPAC::Input;
3  use warnings;  use warnings;
4  use strict;  use strict;
5    
6    use blib;
7    
8    use WebPAC::Common;
9    use base qw/WebPAC::Common/;
10    use Text::Iconv;
11    use Data::Dumper;
12    
13  =head1 NAME  =head1 NAME
14    
15  WebPAC::Input - core module for input file format  WebPAC::Input - read different file formats into WebPAC
16    
17  =head1 VERSION  =head1 VERSION
18    
19  Version 0.01  Version 0.10
20    
21  =cut  =cut
22    
23  our $VERSION = '0.01';  our $VERSION = '0.10';
24    
25  =head1 SYNOPSIS  =head1 SYNOPSIS
26    
27  This module will load particular loader module and execute it's functions.  This module implements input as database which have fixed and known
28    I<size> while indexing and single unique numeric identifier for database
29    position ranging from 1 to I<size>.
30    
31    Simply, something that is indexed by unmber from 1 .. I<size>.
32    
33    Examples of such databases are CDS/ISIS files, MARC files, lines in
34    text file, and so on.
35    
36    Specific file formats are implemented using low-level interface modules,
37    located in C<WebPAC::Input::*> namespace which export C<open_db>,
38    C<fetch_rec> and optional C<init> functions.
39    
40  Perhaps a little code snippet.  Perhaps a little code snippet.
41    
42      use WebPAC::Input;          use WebPAC::Input;
43    
44            my $db = WebPAC::Input->new(
45                    module => 'WebPAC::Input::ISIS',
46                    low_mem => 1,
47            );
48    
49            $db->open( path => '/path/to/database' );
50            print "database size: ",$db->size,"\n";
51            while (my $rec = $db->fetch) {
52                    # do something with $rec
53            }
54    
     my $db = WebPAC::Input->new(  
         format => 'NULL',  
         config => $config,  
         lookup => $lookup_obj,  
     );  
55    
     $db->open('/path/to/database');  
     print "database size: ",$db->size,"\n";  
     while (my $row = $db->fetch) {  
         ...  
     }  
     $db->close;  
56    
57  =head1 FUNCTIONS  =head1 FUNCTIONS
58    
# Line 42  Perhaps a little code snippet. Line 60  Perhaps a little code snippet.
60    
61  Create new input database object.  Create new input database object.
62    
63    my $db = new WebPAC::Input( format => 'NULL' );    my $db = new WebPAC::Input(
64            module => 'WebPAC::Input::MARC',
65            encoding => 'ISO-8859-2',
66            low_mem => 1,
67            recode => 'char pairs',
68            no_progress_bar => 1,
69      );
70    
71    C<module> is low-level file format module. See L<WebPAC::Input::ISIS> and
72    L<WebPAC::Input::MARC>.
73    
74    Optional parametar C<encoding> specify application code page (which will be
75    used internally). This should probably be your terminal encoding, and by
76    default, it C<ISO-8859-2>.
77    
78    Default is not to use C<low_mem> options (see L<MEMORY USAGE> below).
79    
80    C<recode> is optional string constisting of character or words pairs that
81    should be replaced in input stream.
82    
83    C<no_progress_bar> disables progress bar output on C<STDOUT>
84    
85    This function will also call low-level C<init> if it exists with same
86    parametars.
87    
88  =cut  =cut
89    
90  sub new {  sub new {
91          my $class = shift;          my $class = shift;
92          my $self = {@_};          my $self = {@_};
93          bless($self, $class);          bless($self, $class);
94    
95            my $log = $self->_get_logger;
96    
97            $log->logconfess("code_page argument is not suppored any more. change it to encoding") if ($self->{lookup});
98            $log->logconfess("lookup argument is not suppored any more. rewrite call to lookup_ref") if ($self->{lookup});
99    
100            $log->logconfess("specify low-level file format module") unless ($self->{module});
101            my $module = $self->{module};
102            $module =~ s#::#/#g;
103            $module .= '.pm';
104            $log->debug("require low-level module $self->{module} from $module");
105    
106            require $module;
107            #eval $self->{module} .'->import';
108    
109            # check if required subclasses are implemented
110            foreach my $subclass (qw/open_db fetch_rec init/) {
111                    my $n = $self->{module} . '::' . $subclass;
112                    if (! defined &{ $n }) {
113                            my $missing = "missing $subclass in $self->{module}";
114                            $self->{$subclass} = sub { $log->logwarn($missing) };
115                    } else {
116                            $self->{$subclass} = \&{ $n };
117                    }
118            }
119    
120            if ($self->{init}) {
121                    $log->debug("calling init");
122                    $self->{init}->($self, @_);
123            }
124    
125            $self->{'encoding'} ||= 'ISO-8859-2';
126    
127            # running with low_mem flag? well, use DBM::Deep then.
128            if ($self->{'low_mem'}) {
129                    $log->info("running with low_mem which impacts performance (<32 Mb memory usage)");
130    
131                    my $db_file = "data.db";
132    
133                    if (-e $db_file) {
134                            unlink $db_file or $log->logdie("can't remove '$db_file' from last run");
135                            $log->debug("removed '$db_file' from last run");
136                    }
137    
138                    require DBM::Deep;
139    
140                    my $db = new DBM::Deep $db_file;
141    
142                    $log->logdie("DBM::Deep error: $!") unless ($db);
143    
144                    if ($db->error()) {
145                            $log->logdie("can't open '$db_file' under low_mem: ",$db->error());
146                    } else {
147                            $log->debug("using file '$db_file' for DBM::Deep");
148                    }
149    
150                    $self->{'db'} = $db;
151            }
152    
153          $self ? return $self : return undef;          $self ? return $self : return undef;
154  }  }
155    
156    =head2 open
157    
158    This function will read whole database in memory and produce lookups.
159    
160     $input->open(
161            path => '/path/to/database/file',
162            code_page => '852',
163            limit => 500,
164            offset => 6000,
165            lookup => $lookup_obj,
166            stats => 1,
167            lookup_ref => sub {
168                    my ($k,$v) = @_;
169                    # store lookup $k => $v
170            },
171            modify_records => {
172                    900 => { '^a' => { ' : ' => '^b' } },
173                    901 => { '*' => { '^b' => ' ; ' } },
174            },
175     );
176    
177    By default, C<code_page> is assumed to be C<852>.
178    
179    C<offset> is optional parametar to position at some offset before reading from database.
180    
181    C<limit> is optional parametar to read just C<limit> records from database
182    
183    C<stats> create optional report about usage of fields and subfields
184    
185    C<lookup_coderef> is closure to call when adding C<< key => 'value' >> combinations to
186    lookup.
187    
188    C<modify_records> specify mapping from subfields to delimiters or from
189    delimiters to subfields, as well as oprations on fields (if subfield is
190    defined as C<*>.
191    
192    Returns size of database, regardless of C<offset> and C<limit>
193    parametars, see also C<size>.
194    
195    =cut
196    
197    sub open {
198            my $self = shift;
199            my $arg = {@_};
200    
201            my $log = $self->_get_logger();
202    
203            $log->logconfess("lookup argument is not suppored any more. rewrite call to lookup_coderef") if ($arg->{lookup});
204            $log->logconfess("lookup_coderef must be CODE, not ",ref($arg->{lookup_coderef}))
205                    if ($arg->{lookup_coderef} && ref($arg->{lookup_coderef}) ne 'CODE');
206    
207            $log->logcroak("need path") if (! $arg->{'path'});
208            my $code_page = $arg->{'code_page'} || '852';
209    
210            # store data in object
211            $self->{'input_code_page'} = $code_page;
212            foreach my $v (qw/path offset limit/) {
213                    $self->{$v} = $arg->{$v} if ($arg->{$v});
214            }
215    
216            # create Text::Iconv object
217            $self->{iconv} = Text::Iconv->new($code_page,$self->{'encoding'});      ## FIXME remove!
218    
219            my $filter_ref;
220            my $recode_regex;
221            my $recode_map;
222    
223            if ($self->{recode}) {
224                    my @r = split(/\s/, $self->{recode});
225                    if ($#r % 2 != 1) {
226                            $log->logwarn("recode needs even number of elements (some number of valid pairs)");
227                    } else {
228                            while (@r) {
229                                    my $from = shift @r;
230                                    my $to = shift @r;
231                                    $recode_map->{$from} = $to;
232                            }
233    
234                            $recode_regex = join '|' => keys %{ $recode_map };
235    
236                            $log->debug("using recode regex: $recode_regex");
237                    }
238    
239            }
240    
241            my $rec_regex = $self->modify_record_regexps(%{ $arg->{modify_records} });
242            $log->debug("rec_regex: ", Dumper($rec_regex));
243    
244            my ($db, $size) = $self->{open_db}->( $self,
245                    path => $arg->{path},
246                    filter => sub {
247                                    my ($l,$f_nr) = @_;
248                                    return unless defined($l);
249    
250                                    ## FIXME remove iconv!
251                                    $l = $self->{iconv}->convert($l) if ($self->{iconv});
252            
253                                    $l =~ s/($recode_regex)/$recode_map->{$1}/g if ($recode_regex && $recode_map);
254    
255                                    ## FIXME remove this warning when we are sure that none of API is calling
256                                    ## this wrongly
257                                    #warn "filter called without field number" unless ($f_nr);
258    
259                                    return $l unless ($rec_regex && $f_nr);
260    
261    #                               my $max_regex = 100;
262    
263                                    # apply regexps
264                                    if ($rec_regex && defined($rec_regex->{$f_nr})) {
265                                            $log->logconfess("regexps->{$f_nr} must be ARRAY") if (ref($rec_regex->{$f_nr}) ne 'ARRAY');
266                                            my $c = 0;
267                                            foreach my $r (@{ $rec_regex->{$f_nr} }) {
268                                                    #$log->debug("\$l = $l\neval \$l =~ $r");
269                                                    eval '$l =~ ' . $r;
270                                                    $log->error("error applying regex: $r") if ($@);
271    
272    #                                               while ( $c < $max_regex && eval '$l =~ ' . $r ) { $c++ };
273    #                                               $log->error("field $f_nr has more than $max_regex regex iterations\n\$l = $l\neval \$l =~ $r") if ($c == $max_regex);
274    
275                                            }
276                                    }
277    
278                                    return $l;
279                    },
280                    %{ $arg },
281            );
282    
283            unless (defined($db)) {
284                    $log->logwarn("can't open database $arg->{path}, skipping...");
285                    return;
286            }
287    
288            unless ($size) {
289                    $log->logwarn("no records in database $arg->{path}, skipping...");
290                    return;
291            }
292    
293            my $from_rec = 1;
294            my $to_rec = $size;
295    
296            if (my $s = $self->{offset}) {
297                    $log->debug("skipping to MFN $s");
298                    $from_rec = $s;
299            } else {
300                    $self->{offset} = $from_rec;
301            }
302    
303            if ($self->{limit}) {
304                    $log->debug("limiting to ",$self->{limit}," records");
305                    $to_rec = $from_rec + $self->{limit} - 1;
306                    $to_rec = $size if ($to_rec > $size);
307            }
308    
309            # store size for later
310            $self->{size} = ($to_rec - $from_rec) ? ($to_rec - $from_rec + 1) : 0;
311    
312            $log->info("processing $self->{size}/$size records [$from_rec-$to_rec] convert $code_page -> $self->{encoding}", $self->{stats} ? ' [stats]' : '');
313    
314            # read database
315            for (my $pos = $from_rec; $pos <= $to_rec; $pos++) {
316    
317                    $log->debug("position: $pos\n");
318    
319                    my $rec = $self->{fetch_rec}->($self, $db, $pos );
320    
321                    $log->debug(sub { Dumper($rec) });
322    
323                    if (! $rec) {
324                            $log->warn("record $pos empty? skipping...");
325                            next;
326                    }
327    
328                    # store
329                    if ($self->{low_mem}) {
330                            $self->{db}->put($pos, $rec);
331                    } else {
332                            $self->{data}->{$pos} = $rec;
333                    }
334    
335                    # create lookup
336                    $arg->{'lookup_coderef'}->( $rec ) if ($rec && $arg->{'lookup_coderef'});
337    
338                    # update counters for statistics
339                    if ($self->{stats}) {
340    
341                            foreach my $fld (keys %{ $rec }) {
342                                    $self->{_stats}->{fld}->{ $fld }++;
343    
344                                    $log->logdie("invalid record fild $fld, not ARRAY")
345                                            unless (ref($rec->{ $fld }) eq 'ARRAY');
346            
347                                    foreach my $row (@{ $rec->{$fld} }) {
348    
349                                            if (ref($row) eq 'HASH') {
350    
351                                                    foreach my $sf (keys %{ $row }) {
352                                                            $self->{_stats}->{sf}->{ $fld }->{ $sf }->{count}++;
353                                                            $self->{_stats}->{sf}->{ $fld }->{ $sf }->{repeatable}++
354                                                                            if (ref($row->{$sf}) eq 'ARRAY');
355                                                    }
356    
357                                            } else {
358                                                    $self->{_stats}->{repeatable}->{ $fld }++;
359                                            }
360                                    }
361                            }
362                    }
363    
364                    $self->progress_bar($pos,$to_rec) unless ($self->{no_progress_bar});
365    
366            }
367    
368            $self->{pos} = -1;
369            $self->{last_pcnt} = 0;
370    
371            # store max mfn and return it.
372            $self->{max_pos} = $to_rec;
373            $log->debug("max_pos: $to_rec");
374    
375            return $size;
376    }
377    
378    =head2 fetch
379    
380    Fetch next record from database. It will also displays progress bar.
381    
382     my $rec = $isis->fetch;
383    
384    Record from this function should probably go to C<data_structure> for
385    normalisation.
386    
387    =cut
388    
389    sub fetch {
390            my $self = shift;
391    
392            my $log = $self->_get_logger();
393    
394            $log->logconfess("it seems that you didn't load database!") unless ($self->{pos});
395    
396            if ($self->{pos} == -1) {
397                    $self->{pos} = $self->{offset};
398            } else {
399                    $self->{pos}++;
400            }
401    
402            my $mfn = $self->{pos};
403    
404            if ($mfn > $self->{max_pos}) {
405                    $self->{pos} = $self->{max_pos};
406                    $log->debug("at EOF");
407                    return;
408            }
409    
410            $self->progress_bar($mfn,$self->{max_pos}) unless ($self->{no_progress_bar});
411    
412            my $rec;
413    
414            if ($self->{low_mem}) {
415                    $rec = $self->{db}->get($mfn);
416            } else {
417                    $rec = $self->{data}->{$mfn};
418            }
419    
420            $rec ||= 0E0;
421    }
422    
423    =head2 pos
424    
425    Returns current record number (MFN).
426    
427     print $isis->pos;
428    
429    First record in database has position 1.
430    
431    =cut
432    
433    sub pos {
434            my $self = shift;
435            return $self->{pos};
436    }
437    
438    
439    =head2 size
440    
441    Returns number of records in database
442    
443     print $isis->size;
444    
445    Result from this function can be used to loop through all records
446    
447     foreach my $mfn ( 1 ... $isis->size ) { ... }
448    
449    because it takes into account C<offset> and C<limit>.
450    
451    =cut
452    
453    sub size {
454            my $self = shift;
455            return $self->{size};
456    }
457    
458    =head2 seek
459    
460    Seek to specified MFN in file.
461    
462     $isis->seek(42);
463    
464    First record in database has position 1.
465    
466    =cut
467    
468    sub seek {
469            my $self = shift;
470            my $pos = shift || return;
471    
472            my $log = $self->_get_logger();
473    
474            if ($pos < 1) {
475                    $log->warn("seek before first record");
476                    $pos = 1;
477            } elsif ($pos > $self->{max_pos}) {
478                    $log->warn("seek beyond last record");
479                    $pos = $self->{max_pos};
480            }
481    
482            return $self->{pos} = (($pos - 1) || -1);
483    }
484    
485    =head2 stats
486    
487    Dump statistics about field and subfield usage
488    
489      print $input->stats;
490    
491    =cut
492    
493    sub stats {
494            my $self = shift;
495    
496            my $log = $self->_get_logger();
497    
498            my $s = $self->{_stats};
499            if (! $s) {
500                    $log->warn("called stats, but there is no statistics collected");
501                    return;
502            }
503    
504            my $max_fld = 0;
505    
506            my $out = join("\n",
507                    map {
508                            my $f = $_ || die "no field";
509                            my $v = $s->{fld}->{$f} || die "no s->{fld}->{$f}";
510                            $max_fld = $v if ($v > $max_fld);
511    
512                            my $o = sprintf("%4s %d ~", $f, $v);
513    
514                            if (defined($s->{sf}->{$f})) {
515                                    map {
516                                            $o .= sprintf(" %s:%d%s", $_,
517                                                    $s->{sf}->{$f}->{$_}->{count},
518                                                    $s->{sf}->{$f}->{$_}->{repeatable} ? '*' : '',
519                                            );
520                                    } sort keys %{ $s->{sf}->{$f} };
521                            }
522    
523                            if (my $v_r = $s->{repeatable}->{$f}) {
524                                    $o .= " ($v_r)" if ($v_r != $v);
525                            }
526    
527                            $o;
528                    } sort { $a cmp $b } keys %{ $s->{fld} }
529            );
530    
531            $log->debug( sub { Dumper($s) } );
532    
533            return $out;
534    }
535    
536    =head2 modify_record_regexps
537    
538    Generate hash with regexpes to be applied using L<filter>.
539    
540      my $regexpes = $input->modify_record_regexps(
541                    900 => { '^a' => { ' : ' => '^b' } },
542                    901 => { '*' => { '^b' => ' ; ' } },
543      );
544    
545    =cut
546    
547    sub modify_record_regexps {
548            my $self = shift;
549            my $modify_record = {@_};
550    
551            my $regexpes;
552    
553            foreach my $f (keys %$modify_record) {
554    warn "--- f: $f\n";
555                    foreach my $sf (keys %{ $modify_record->{$f} }) {
556    warn "---- sf: $sf\n";
557                            foreach my $from (keys %{ $modify_record->{$f}->{$sf} }) {
558                                    my $to = $modify_record->{$f}->{$sf}->{$from};
559                                    #die "no field?" unless defined($to);
560    warn "----- transform: |$from| -> |$to|\n";
561    
562                                    if ($sf =~ /^\^/) {
563                                            my $regex =
564                                                    's/\Q'. $sf .'\E([^\^]+)\Q'. $from .'\E([^\^]+)/'. $sf .'$1'. $to .'$2/g';
565                                            push @{ $regexpes->{$f} }, $regex;
566    warn ">>>>> $regex [sf]\n";
567                                    } else {
568                                            my $regex =
569                                                    's/\Q'. $from .'\E/'. $to .'/g';
570                                            push @{ $regexpes->{$f} }, $regex;
571    warn ">>>>> $regex [global]\n";
572                                    }
573    
574                            }
575                    }
576            }
577    
578            return $regexpes;
579    }
580    
581  =head1 MEMORY USAGE  =head1 MEMORY USAGE
582    
583  C<low_mem> options is double-edged sword. If enabled, WebPAC  C<low_mem> options is double-edged sword. If enabled, WebPAC
# Line 91  Dobrica Pavlinusic, C<< <dpavlin@rot13.o Line 615  Dobrica Pavlinusic, C<< <dpavlin@rot13.o
615    
616  =head1 COPYRIGHT & LICENSE  =head1 COPYRIGHT & LICENSE
617    
618  Copyright 2005 Dobrica Pavlinusic, All Rights Reserved.  Copyright 2005-2006 Dobrica Pavlinusic, All Rights Reserved.
619    
620  This program is free software; you can redistribute it and/or modify it  This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
621  under the same terms as Perl itself.  under the same terms as Perl itself.

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