/[webpac2]/trunk/lib/WebPAC/Input.pm
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Diff of /trunk/lib/WebPAC/Input.pm

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revision 1 by dpavlin, Sat Jun 25 20:23:23 2005 UTC revision 868 by dpavlin, Thu Jun 21 21:26:17 2007 UTC
# Line 3  package WebPAC::Input; Line 3  package WebPAC::Input;
3  use warnings;  use warnings;
4  use strict;  use strict;
5    
6    use blib;
7    
8    use WebPAC::Common;
9    use base qw/WebPAC::Common/;
10    use Data::Dump qw/dump/;
11    use Encode qw/from_to/;
12    
13  =head1 NAME  =head1 NAME
14    
15  WebPAC::Input - The great new WebPAC::Input!  WebPAC::Input - read different file formats into WebPAC
16    
17  =head1 VERSION  =head1 VERSION
18    
19  Version 0.01  Version 0.18
20    
21  =cut  =cut
22    
23  our $VERSION = '0.01';  our $VERSION = '0.18';
24    
25  =head1 SYNOPSIS  =head1 SYNOPSIS
26    
27  Quick summary of what the module does.  This module implements input as database which have fixed and known
28    I<size> while indexing and single unique numeric identifier for database
29    position ranging from 1 to I<size>.
30    
31    Simply, something that is indexed by unmber from 1 .. I<size>.
32    
33    Examples of such databases are CDS/ISIS files, MARC files, lines in
34    text file, and so on.
35    
36    Specific file formats are implemented using low-level interface modules,
37    located in C<WebPAC::Input::*> namespace which export C<open_db>,
38    C<fetch_rec> and optional C<init> functions.
39    
40  Perhaps a little code snippet.  Perhaps a little code snippet.
41    
42      use WebPAC::Input;          use WebPAC::Input;
43    
44      my $foo = WebPAC::Input->new();          my $db = WebPAC::Input->new(
45      ...                  module => 'WebPAC::Input::ISIS',
46            );
47    
48            $db->open( path => '/path/to/database' );
49            print "database size: ",$db->size,"\n";
50            while (my $rec = $db->fetch) {
51                    # do something with $rec
52            }
53    
 =head1 EXPORT  
54    
 A list of functions that can be exported.  You can delete this section  
 if you don't export anything, such as for a purely object-oriented module.  
55    
56  =head1 FUNCTIONS  =head1 FUNCTIONS
57    
58  =head2 function1  =head2 new
59    
60    Create new input database object.
61    
62      my $db = new WebPAC::Input(
63            module => 'WebPAC::Input::MARC',
64            encoding => 'ISO-8859-2',
65            recode => 'char pairs',
66            no_progress_bar => 1,
67            input_config => {
68                    mapping => [ 'foo', 'bar', 'baz' ],
69            },
70      );
71    
72    C<module> is low-level file format module. See L<WebPAC::Input::ISIS> and
73    L<WebPAC::Input::MARC>.
74    
75    Optional parametar C<encoding> specify application code page (which will be
76    used internally). This should probably be your terminal encoding, and by
77    default, it C<ISO-8859-2>.
78    
79    C<recode> is optional string constisting of character or words pairs that
80    should be replaced in input stream.
81    
82    C<no_progress_bar> disables progress bar output on C<STDOUT>
83    
84    This function will also call low-level C<init> if it exists with same
85    parametars.
86    
87  =cut  =cut
88    
89  sub function1 {  sub new {
90            my $class = shift;
91            my $self = {@_};
92            bless($self, $class);
93    
94            my $log = $self->_get_logger;
95    
96            $log->logconfess("code_page argument is not suppored any more. change it to encoding") if ($self->{lookup});
97            $log->logconfess("lookup argument is not suppored any more. rewrite call to lookup_ref") if ($self->{lookup});
98            $log->logconfess("low_mem argument is not suppored any more. rewrite it to load_row and save_row") if ($self->{low_mem});
99    
100            $log->logconfess("specify low-level file format module") unless ($self->{module});
101            my $module_path = $self->{module};
102            $module_path =~ s#::#/#g;
103            $module_path .= '.pm';
104            $log->debug("require low-level module $self->{module} from $module_path");
105    
106            require $module_path;
107    
108            $self->{'encoding'} ||= 'ISO-8859-2';
109    
110            $self ? return $self : return undef;
111  }  }
112    
113  =head2 function2  =head2 open
114    
115    This function will read whole database in memory and produce lookups.
116    
117     my $store;     # simple in-memory hash
118    
119     $input->open(
120            path => '/path/to/database/file',
121            code_page => 'cp852',
122            limit => 500,
123            offset => 6000,
124            stats => 1,
125            lookup_coderef => sub {
126                    my $rec = shift;
127                    # store lookups
128            },
129            modify_records => {
130                    900 => { '^a' => { ' : ' => '^b' } },
131                    901 => { '*' => { '^b' => ' ; ' } },
132            },
133            modify_file => 'conf/modify/mapping.map',
134            save_row => sub {
135                    my $a = shift;
136                    $store->{ $a->{id} } = $a->{row};
137            },
138            load_row => sub {
139                    my $a = shift;
140                    return defined($store->{ $a->{id} }) &&
141                            $store->{ $a->{id} };
142            },
143    
144     );
145    
146    By default, C<code_page> is assumed to be C<cp852>.
147    
148    C<offset> is optional parametar to position at some offset before reading from database.
149    
150    C<limit> is optional parametar to read just C<limit> records from database
151    
152    C<stats> create optional report about usage of fields and subfields
153    
154    C<lookup_coderef> is closure to called to save data into lookups
155    
156    C<modify_records> specify mapping from subfields to delimiters or from
157    delimiters to subfields, as well as oprations on fields (if subfield is
158    defined as C<*>.
159    
160    C<modify_file> is alternative for C<modify_records> above which preserves order and offers
161    (hopefully) simplier sintax than YAML or perl (see L</modify_file_regex>). This option
162    overrides C<modify_records> if both exists for same input.
163    
164    C<save_row> and C<load_row> are low-level implementation of store engine. Calling convention
165    is documented in example above.
166    
167    Returns size of database, regardless of C<offset> and C<limit>
168    parametars, see also C<size>.
169    
170  =cut  =cut
171    
172  sub function2 {  sub open {
173            my $self = shift;
174            my $arg = {@_};
175    
176            my $log = $self->_get_logger();
177    
178            $log->logconfess("lookup argument is not suppored any more. rewrite call to lookup_coderef") if ($arg->{lookup});
179            $log->logconfess("lookup_coderef must be CODE, not ",ref($arg->{lookup_coderef}))
180                    if ($arg->{lookup_coderef} && ref($arg->{lookup_coderef}) ne 'CODE');
181    
182            $log->debug( $arg->{lookup_coderef} ? '' : 'not ', "using lookup_coderef");
183    
184            $log->logcroak("need path") if (! $arg->{'path'});
185            my $code_page = $arg->{'code_page'} || 'cp852';
186    
187            # store data in object
188            $self->{'input_code_page'} = $code_page;
189            foreach my $v (qw/path offset limit/) {
190                    $self->{$v} = $arg->{$v} if ($arg->{$v});
191            }
192    
193            if ($arg->{load_row} || $arg->{save_row}) {
194                    $log->logconfess("save_row and load_row must be defined in pair and be CODE") unless (
195                            ref($arg->{load_row}) eq 'CODE' &&
196                            ref($arg->{save_row}) eq 'CODE'
197                    );
198                    $self->{load_row} = $arg->{load_row};
199                    $self->{save_row} = $arg->{save_row};
200                    $log->debug("using load_row and save_row instead of in-memory hash");
201            }
202    
203            my $filter_ref;
204            my $recode_regex;
205            my $recode_map;
206    
207            if ($self->{recode}) {
208                    my @r = split(/\s/, $self->{recode});
209                    if ($#r % 2 != 1) {
210                            $log->logwarn("recode needs even number of elements (some number of valid pairs)");
211                    } else {
212                            while (@r) {
213                                    my $from = shift @r;
214                                    my $to = shift @r;
215                                    $recode_map->{$from} = $to;
216                            }
217    
218                            $recode_regex = join '|' => keys %{ $recode_map };
219    
220                            $log->debug("using recode regex: $recode_regex");
221                    }
222    
223            }
224    
225            my $rec_regex;
226            if (my $p = $arg->{modify_file}) {
227                    $log->debug("using modify_file $p");
228                    $rec_regex = $self->modify_file_regexps( $p );
229            } elsif (my $h = $arg->{modify_records}) {
230                    $log->debug("using modify_records ", sub { dump( $h ) });
231                    $rec_regex = $self->modify_record_regexps(%{ $h });
232            }
233            $log->debug("rec_regex: ", sub { dump($rec_regex) }) if ($rec_regex);
234    
235            my $class = $self->{module} || $log->logconfess("can't get low-level module name!");
236    
237            my $ll_db = $class->new(
238                    path => $arg->{path},
239                    input_config => $arg->{input_config},
240    #               filter => sub {
241    #                       my ($l,$f_nr) = @_;
242    #                       return unless defined($l);
243    #                       from_to($l, $code_page, $self->{'encoding'});
244    #                       $l =~ s/($recode_regex)/$recode_map->{$1}/g if ($recode_regex && $recode_map);
245    #                       return $l;
246    #               },
247                    %{ $arg },
248            );
249    
250            unless (defined($ll_db)) {
251                    $log->logwarn("can't open database $arg->{path}, skipping...");
252                    return;
253            }
254    
255            my $size = $ll_db->size;
256    
257            unless ($size) {
258                    $log->logwarn("no records in database $arg->{path}, skipping...");
259                    return;
260            }
261    
262            my $from_rec = 1;
263            my $to_rec = $size;
264    
265            if (my $s = $self->{offset}) {
266                    $log->debug("skipping to MFN $s");
267                    $from_rec = $s;
268            } else {
269                    $self->{offset} = $from_rec;
270            }
271    
272            if ($self->{limit}) {
273                    $log->debug("limiting to ",$self->{limit}," records");
274                    $to_rec = $from_rec + $self->{limit} - 1;
275                    $to_rec = $size if ($to_rec > $size);
276            }
277    
278            # store size for later
279            $self->{size} = ($to_rec - $from_rec) ? ($to_rec - $from_rec + 1) : 0;
280    
281            $log->info("processing $self->{size}/$size records [$from_rec-$to_rec] convert $code_page -> $self->{encoding}", $self->{stats} ? ' [stats]' : '');
282    
283            # read database
284            for (my $pos = $from_rec; $pos <= $to_rec; $pos++) {
285    
286                    $log->debug("position: $pos\n");
287    
288                    my $rec = $ll_db->fetch_rec($pos, sub {
289                                    my ($l,$f_nr,$debug) = @_;
290    #                               return unless defined($l);
291    #                               return $l unless ($rec_regex && $f_nr);
292    
293                                    return unless ( defined($l) && defined($f_nr) );
294    
295                                    warn "-=> $f_nr ## |$l|\n" if ($debug);
296                                    $log->debug("-=> $f_nr ## $l");
297    
298                                    # codepage conversion and recode_regex
299                                    from_to($l, $code_page, $self->{'encoding'});
300                                    $l =~ s/($recode_regex)/$recode_map->{$1}/g if ($recode_regex && $recode_map);
301    
302                                    # apply regexps
303                                    if ($rec_regex && defined($rec_regex->{$f_nr})) {
304                                            $log->logconfess("regexps->{$f_nr} must be ARRAY") if (ref($rec_regex->{$f_nr}) ne 'ARRAY');
305                                            my $c = 0;
306                                            foreach my $r (@{ $rec_regex->{$f_nr} }) {
307                                                    my $old_l = $l;
308                                                    $log->logconfess("expected regex in ", dump( $r )) unless defined($r->{regex});
309                                                    eval '$l =~ ' . $r->{regex};
310                                                    if ($old_l ne $l) {
311                                                            my $d = "|$old_l| -> |$l| "; # . $r->{regex};
312                                                            $d .= ' +' . $r->{line} . ' ' . $r->{file} if defined($r->{line});
313                                                            $d .= ' ' . $r->{debug} if defined($r->{debug});
314                                                            $log->debug("MODIFY $d");
315                                                            warn "*** $d\n" if ($debug);
316    
317                                                    }
318                                                    $log->error("error applying regex: $r") if ($@);
319                                            }
320                                    }
321    
322                                    $log->debug("<=- $f_nr ## |$l|");
323                                    warn "<=- $f_nr ## $l\n" if ($debug);
324                                    return $l;
325                    });
326    
327                    $log->debug(sub { dump($rec) });
328    
329                    if (! $rec) {
330                            $log->warn("record $pos empty? skipping...");
331                            next;
332                    }
333    
334                    # store
335                    if ($self->{save_row}) {
336                            $self->{save_row}->({
337                                    id => $pos,
338                                    row => $rec,
339                            });
340                    } else {
341                            $self->{data}->{$pos} = $rec;
342                    }
343    
344                    # create lookup
345                    $arg->{'lookup_coderef'}->( $rec ) if ($rec && $arg->{'lookup_coderef'});
346    
347                    # update counters for statistics
348                    if ($self->{stats}) {
349    
350                            # fetch clean record with regexpes applied for statistics
351                            my $rec = $ll_db->fetch_rec($pos);
352    
353                            foreach my $fld (keys %{ $rec }) {
354                                    $self->{_stats}->{fld}->{ $fld }++;
355    
356                                    $log->logdie("invalid record fild $fld, not ARRAY")
357                                            unless (ref($rec->{ $fld }) eq 'ARRAY');
358            
359                                    foreach my $row (@{ $rec->{$fld} }) {
360    
361                                            if (ref($row) eq 'HASH') {
362    
363                                                    foreach my $sf (keys %{ $row }) {
364                                                            next if ($sf eq 'subfields');
365                                                            $self->{_stats}->{sf}->{ $fld }->{ $sf }->{count}++;
366                                                            $self->{_stats}->{sf}->{ $fld }->{ $sf }->{repeatable}++
367                                                                            if (ref($row->{$sf}) eq 'ARRAY');
368                                                    }
369    
370                                            } else {
371                                                    $self->{_stats}->{repeatable}->{ $fld }++;
372                                            }
373                                    }
374                            }
375                    }
376    
377                    $self->progress_bar($pos,$to_rec) unless ($self->{no_progress_bar});
378    
379            }
380    
381            $self->{pos} = -1;
382            $self->{last_pcnt} = 0;
383    
384            # store max mfn and return it.
385            $self->{max_pos} = $to_rec;
386            $log->debug("max_pos: $to_rec");
387    
388            # save for dump
389            $self->{ll_db} = $ll_db;
390    
391            return $size;
392  }  }
393    
394  =head1 AUTHOR  =head2 fetch
395    
396  Dobrica Pavlinusic, C<< <dpavlin@rot13.org> >>  Fetch next record from database. It will also displays progress bar.
397    
398     my $rec = $isis->fetch;
399    
400    Record from this function should probably go to C<data_structure> for
401    normalisation.
402    
403    =cut
404    
405    sub fetch {
406            my $self = shift;
407    
408            my $log = $self->_get_logger();
409    
410            $log->logconfess("it seems that you didn't load database!") unless ($self->{pos});
411    
412            if ($self->{pos} == -1) {
413                    $self->{pos} = $self->{offset};
414            } else {
415                    $self->{pos}++;
416            }
417    
418  =head1 BUGS          my $mfn = $self->{pos};
419    
420  Please report any bugs or feature requests to          if ($mfn > $self->{max_pos}) {
421  C<bug-webpac-input@rt.cpan.org>, or through the web interface at                  $self->{pos} = $self->{max_pos};
422  L<http://rt.cpan.org/NoAuth/ReportBug.html?Queue=WebPAC>.                  $log->debug("at EOF");
423  I will be notified, and then you'll automatically be notified of progress on                  return;
424  your bug as I make changes.          }
425    
426            $self->progress_bar($mfn,$self->{max_pos}) unless ($self->{no_progress_bar});
427    
428            my $rec;
429    
430            if ($self->{load_row}) {
431                    $rec = $self->{load_row}->({ id => $mfn });
432            } else {
433                    $rec = $self->{data}->{$mfn};
434            }
435    
436            $rec ||= 0E0;
437    }
438    
439    =head2 pos
440    
441    Returns current record number (MFN).
442    
443     print $isis->pos;
444    
445    First record in database has position 1.
446    
447    =cut
448    
449    sub pos {
450            my $self = shift;
451            return $self->{pos};
452    }
453    
454    
455    =head2 size
456    
457    Returns number of records in database
458    
459     print $isis->size;
460    
461    Result from this function can be used to loop through all records
462    
463     foreach my $mfn ( 1 ... $isis->size ) { ... }
464    
465    because it takes into account C<offset> and C<limit>.
466    
467    =cut
468    
469    sub size {
470            my $self = shift;
471            return $self->{size};
472    }
473    
474    =head2 seek
475    
476    Seek to specified MFN in file.
477    
478     $isis->seek(42);
479    
480    First record in database has position 1.
481    
482    =cut
483    
484  =head1 ACKNOWLEDGEMENTS  sub seek {
485            my $self = shift;
486            my $pos = shift;
487    
488            my $log = $self->_get_logger();
489    
490            $log->logconfess("called without pos") unless defined($pos);
491    
492            if ($pos < 1) {
493                    $log->warn("seek before first record");
494                    $pos = 1;
495            } elsif ($pos > $self->{max_pos}) {
496                    $log->warn("seek beyond last record");
497                    $pos = $self->{max_pos};
498            }
499    
500            return $self->{pos} = (($pos - 1) || -1);
501    }
502    
503    =head2 stats
504    
505    Dump statistics about field and subfield usage
506    
507      print $input->stats;
508    
509    =cut
510    
511    sub stats {
512            my $self = shift;
513    
514            my $log = $self->_get_logger();
515    
516            my $s = $self->{_stats};
517            if (! $s) {
518                    $log->warn("called stats, but there is no statistics collected");
519                    return;
520            }
521    
522            my $max_fld = 0;
523    
524            my $out = join("\n",
525                    map {
526                            my $f = $_;
527                            die "no field in ", dump( $s->{fld} ) unless defined( $f );
528                            my $v = $s->{fld}->{$f} || die "no s->{fld}->{$f}";
529                            $max_fld = $v if ($v > $max_fld);
530    
531                            my $o = sprintf("%4s %d ~", $f, $v);
532    
533                            if (defined($s->{sf}->{$f})) {
534                                    map {
535                                            $o .= sprintf(" %s:%d%s", $_,
536                                                    $s->{sf}->{$f}->{$_}->{count},
537                                                    $s->{sf}->{$f}->{$_}->{repeatable} ? '*' : '',
538                                            );
539                                    } sort keys %{ $s->{sf}->{$f} };
540                            }
541    
542                            if (my $v_r = $s->{repeatable}->{$f}) {
543                                    $o .= " ($v_r)" if ($v_r != $v);
544                            }
545    
546                            $o;
547                    } sort { $a <=> $b } keys %{ $s->{fld} }
548            );
549    
550            $log->debug( sub { dump($s) } );
551    
552            return $out;
553    }
554    
555    =head2 dump_ascii
556    
557    Display humanly readable dump of record
558    
559    =cut
560    
561    sub dump_ascii {
562            my $self = shift;
563    
564            return unless $self->{ll_db};
565    
566            if ($self->{ll_db}->can('dump_ascii')) {
567                    return $self->{ll_db}->dump_ascii( $self->{pos} );
568            } else {
569                    return dump( $self->{ll_db}->fetch_rec( $self->{pos} ) );
570            }
571    }
572    
573    =head2 _get_regex
574    
575    Helper function called which create regexps to be execute on code.
576    
577      _get_regex( 900, 'regex:[0-9]+' ,'numbers' );
578      _get_regex( 900, '^b', ' : ^b' );
579    
580    It supports perl regexps with C<regex:> prefix to from value and has
581    additional logic to skip empty subfields.
582    
583    =cut
584    
585    sub _get_regex {
586            my ($sf,$from,$to) = @_;
587    
588            # protect /
589            $from =~ s!/!\\/!gs;
590            $to =~ s!/!\\/!gs;
591    
592            if ($from =~ m/^regex:(.+)$/) {
593                    $from = $1;
594            } else {
595                    $from = '\Q' . $from . '\E';
596            }
597            if ($sf =~ /^\^/) {
598                    my $need_subfield_data = '*';   # no
599                    # if from is also subfield, require some data in between
600                    # to correctly skip empty subfields
601                    $need_subfield_data = '+' if ($from =~ m/^\\Q\^/);
602                    return
603                            's/\Q'. $sf .'\E([^\^]' . $need_subfield_data . '?)'. $from .'([^\^]*?)/'. $sf .'$1'. $to .'$2/';
604            } else {
605                    return
606                            's/'. $from .'/'. $to .'/g';
607            }
608    }
609    
610    
611    =head2 modify_record_regexps
612    
613    Generate hash with regexpes to be applied using L<filter>.
614    
615      my $regexpes = $input->modify_record_regexps(
616                    900 => { '^a' => { ' : ' => '^b' } },
617                    901 => { '*' => { '^b' => ' ; ' } },
618      );
619    
620    =cut
621    
622    sub modify_record_regexps {
623            my $self = shift;
624            my $modify_record = {@_};
625    
626            my $regexpes;
627    
628            my $log = $self->_get_logger();
629    
630            foreach my $f (keys %$modify_record) {
631                    $log->debug("field: $f");
632    
633                    foreach my $sf (keys %{ $modify_record->{$f} }) {
634                            $log->debug("subfield: $sf");
635    
636                            foreach my $from (keys %{ $modify_record->{$f}->{$sf} }) {
637                                    my $to = $modify_record->{$f}->{$sf}->{$from};
638                                    #die "no field?" unless defined($to);
639                                    my $d = "|$from| -> |$to|";
640                                    $log->debug("transform: $d");
641    
642                                    my $regex = _get_regex($sf,$from,$to);
643                                    push @{ $regexpes->{$f} }, { regex => $regex, debug => $d };
644                                    $log->debug("regex: $regex");
645                            }
646                    }
647            }
648    
649            return $regexpes;
650    }
651    
652    =head2 modify_file_regexps
653    
654    Generate hash with regexpes to be applied using L<filter> from
655    pseudo hash/yaml format for regex mappings.
656    
657    It should be obvious:
658    
659            200
660              '^a'
661                ' : ' => '^e'
662                ' = ' => '^d'
663    
664    In field I<200> find C<'^a'> and then C<' : '>, and replace it with C<'^e'>.
665    In field I<200> find C<'^a'> and then C<' = '>, and replace it with C<'^d'>.
666    
667      my $regexpes = $input->modify_file_regexps( 'conf/modify/common.pl' );
668    
669    On undef path it will just return.
670    
671    =cut
672    
673    sub modify_file_regexps {
674            my $self = shift;
675    
676            my $modify_path = shift || return;
677    
678            my $log = $self->_get_logger();
679    
680            my $regexpes;
681    
682            CORE::open(my $fh, $modify_path) || $log->logdie("can't open modify file $modify_path: $!");
683    
684            my ($f,$sf);
685    
686            while(<$fh>) {
687                    chomp;
688                    next if (/^#/ || /^\s*$/);
689    
690                    if (/^\s*(\d+)\s*$/) {
691                            $f = $1;
692                            $log->debug("field: $f");
693                            next;
694                    } elsif (/^\s*'([^']*)'\s*$/) {
695                            $sf = $1;
696                            $log->die("can't define subfiled before field in: $_") unless ($f);
697                            $log->debug("subfield: $sf");
698                    } elsif (/^\s*'([^']*)'\s*=>\s*'([^']*)'\s*$/) {
699                            my ($from,$to) = ($1, $2);
700    
701                            $log->debug("transform: |$from| -> |$to|");
702    
703                            my $regex = _get_regex($sf,$from,$to);
704                            push @{ $regexpes->{$f} }, {
705                                    regex => $regex,
706                                    file => $modify_path,
707                                    line => $.,
708                            };
709                            $log->debug("regex: $regex");
710                    }
711            }
712    
713            return $regexpes;
714    }
715    
716    =head1 AUTHOR
717    
718    Dobrica Pavlinusic, C<< <dpavlin@rot13.org> >>
719    
720  =head1 COPYRIGHT & LICENSE  =head1 COPYRIGHT & LICENSE
721    
722  Copyright 2005 Dobrica Pavlinusic, All Rights Reserved.  Copyright 2005-2006 Dobrica Pavlinusic, All Rights Reserved.
723    
724  This program is free software; you can redistribute it and/or modify it  This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
725  under the same terms as Perl itself.  under the same terms as Perl itself.

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